STX16

STX16
識別子
エイリアス	STX16、SYN16、シンタキシン16、SYN-16
外部ID	オミム: 603666 ; MGI : 1923396 ;ホモロジーン: 2791 ;ジーンカード: STX16 ; OMA : STX16 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 20番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 20q13.32 始める 58,651,253 bp [ 1 ] 終わり 58,679,526 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 2番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 2|2 H4 始める 1億7391万8101bp [ 2 ] 終わり 1億7394万1564bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 右卵管 腓骨神経 脳梁 浅側頭動脈 下垂体 小脳の右半球 子宮体部 C1セグメント 右卵巣 下垂体前葉 上位の表現 手 網膜の神経層 耳石器官 卵形嚢 胸腺 レンズ 小脳皮質 一次視覚野 卵黄嚢 上前頭回 より多くの参照表現データ バイオGPS 該当なし
遺伝子オントロジー 分子機能 SNAP受容体活性 タンパク質結合 シンタキシン結合 SNARE結合 細胞成分 細胞質 膜の不可欠な構成要素 ゴルジ体 膜 細胞内膜小器官 ゴルジ槽 焦点接着 トランスゴルジネットワーク SNARE複合体 小胞体 細胞質の核周囲領域 細胞質 トランスゴルジネットワーク膜 ゴルジ膜 内膜系 シナプス小胞膜の不可欠な構成要素 生物学的プロセス 小胞ドッキング 逆行輸送、エンドソームからゴルジ体へ タンパク質輸送 細胞内タンパク質輸送 小胞融合 ゴルジリボンの形成 小胞輸送 輸送 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 8675 228960 アンサンブル ENSG00000124222 ENSMUSG00000027522 ユニプロット O14662 Q8BVI5 RefSeq (mRNA) NM_001001433 NM_001001434 NM_001134772 NM_001134773 NM_001204868 NM_003763 NM_001102423 NM_001102424 NM_001102425 NM_172675 NM_001363029 NM_001363030 NM_001363031 RefSeq（タンパク質） NP_001001433 NP_001128244 NP_001128245 NP_001191797 NP_003754 NP_001095893 NP_001095894 NP_001095895 NP_766263 NP_001349958 NP_001349959 NP_001349960 場所（UCSC） 20章: 58.65 – 58.68 MB 2番目の文字: 173.92 – 173.94 MB PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
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シンタキシン16（STX16）は、SNAREタンパク質（可溶性N-エチルマレイミド感受性因子付着タンパク質）と呼ばれるタンパク質ファミリーグループの一部です。SNAREタンパク質は一般的に2種類に分類されます。v-SNARE（小胞SNARE ）は輸送小胞の形成時に膜に埋め込まれ、t-SNARE（標的SNARE）は神経終末などの標的膜上に位置し、それぞれがタンパク質を輸送します。^{[ 5 ]} STX16はt-SNAREであると考えられており、膜融合を起こす重要なタンパク質です。^{[ 6 ]}

遺伝子

ホモ・サピエンス（人類）

シンタキシン16は、ヒトにおいてSTX16遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[ 7 ] [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ]}、第20染色体（第20染色体：58.65 – 58.68 Mb）に存在し、325個のアミノ酸から構成されている。^{[ 11 ]} STX16遺伝子は多くの異なるアイソフォームで発現し、23種類のスプライスバリアントが存在する。また、種を超えて197の相同遺伝子を含む多くの進化的近縁種が存在し、強い進化的保存性を示している。さらに、同一ゲノム内に12の相同遺伝子が存在し、2つの異なる表現型と関連している。^{[ 12 ]}

マウス（Mus musculus）  

STX16の予測構造。UniProtから提供された配列を使用してAlphaFoldによって作成された。

STX16は第2染色体（第2染色体：173.92 – 173.94 Mb）に存在し、326アミノ酸長のタンパク質をコードしています。^{[ 13 ]} STX16遺伝子は多くの異なるアイソフォームで発現し、5つの異なるスプライスバリアントを有しています。また、他の種にも多くの関連バージョンが存在し、種間で197の相同遺伝子が存在することから、強い進化的保存性を示しています。さらに、ゲノム内に12の相同遺伝子が存在し、29の異なる表現型と関連しています。^{[ 14 ]}

協会

ホモ・サピエンス（人類）

1.偽性副甲状腺機能低下症1B型と関連している。この遺伝子の欠損は、GNAS1エクソンA/Bのメチル化の消失を引き起こす。^{[ 9 ]}

研究により、 STX16（シンタキシン-16）に影響を与える欠失が、偽性副甲状腺機能低下症Ib 型（PHP-1B）に関連していることが示されています。特に、STX16 領域の「微小欠失」は、約 3キロベースまたは新しい約 4.4 キロベースの欠失であり、常染色体優性型の PHP-1B を持つ多くの家系に見られます。母親から欠失を受け継いだ人は、特にGNAS（グアニンヌクレオチド結合タンパク質、アルファ刺激）エクソン A/BでDNA メチル化の損失を示しますが、GNAS の他の差別的メチル化領域は影響を受けません。 ^{[ 9 ]}このメチル化インプリントの損失は、特に腎臓などのホルモン応答性組織での G タンパク質 α サブユニット（Gsα）の発現を低下させることによってGNAS の正常な制御を阻害すると考えられており、 ^{[ 15 ]}

要するに、STX16の欠失は、正しいGNASメチル化に必要な推定上の「インプリンティング制御要素」を破壊し、エクソンA/Bのメチル化の喪失は、STX16欠失とPHP-1Bを結び付ける分子的特徴である。^{[ 9 ]}

ヒト - TBC1D23 PHドメインとSTX16の複合体のX線画像。オレンジ色の部分がSTX16、緑色の部分がTBC1D23である。

2. STX16はTBC1D23と相互作用することが示されている。 ^{[ 16 ]}

研究者らは、アフィニティークロマトグラフィーと質量分析を用いて、TBC1D23のC末端「PH様」ドメインの結合パートナーを特定し、STX16の細胞質側末端がTBC1D23と相互作用できることを発見しました。STX16の約151～225アミノ酸残基の断片が相互作用に必要かつ十分であり、TBC1D23とSTX16の直接結合を確立することが確認されました。

研究者らは、これらの結合機構を理解するために、TBC1D23の末端がSTX16の小片に結合した3D構造を作成しました。その結果、STX16のこの短い断片がTBC1D23の表面にぴったりとフィットし、2つのアミノ酸を小さなポケットに収めることで、電荷に基づく相互作用をさらに形成していることが分かりました。この密接なフィットが、2つのタンパク質が互いに特異的に認識できる理由を説明しています。

全体として、タンパク質間のこの相互接続は、細胞が物質を輸送する上で重要な役割を果たしていることが示されました。研究者らがTBC1D23またはSTX16の結合部位を改変したところ、小胞はゴルジ体へ適切に捕捉されなくなりました。この結果は、TBC1D23が「テザー」のように機能し、ゴルジ体がSTX16に付着して入ってくる小胞を捕捉し、膜融合が起こる前に適切な場所へ輸送される貨物を確保していることを示しています^{[ 16 ]。}

マウス（Mus musculus）  

このタンパク質は、エンドソーム輸送、小胞ドッキング、小胞融合など、複数の細胞プロセスに関与すると考えられています。ゴルジ体に局在し、中枢神経系、結合組織、泌尿生殖器系、腸管、免疫系など、様々な組織で発現しています。^{[ 17 ]}

STX16の分子機能^{[ 18 ]}

• タンパク質結合
• シンタキシン結合
• SNAP受容体活性
• SNARE結合

STX16製品が活性な携帯電話の場所^{[ 18 ]}

• ゴルジ膜
• ゴルジ体
• トランスゴルジネットワーク
• 細胞質の核周囲領域
• 焦点接着
• 細胞質
• 細胞内膜小器官
• SNARE複合体
• 細胞質
• 内膜系
• シナプス小胞膜
• ゴルジ槽
• トランスゴルジネットワーク膜

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000124222 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000027522 – Ensembl、2017年5月
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4. 「マウスPubMedリファレンス：」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Wang T, Li L, Hong W (2017年12月). 「膜輸送におけるSNAREタンパク質」. Traffic . 18 (12): 767–775 . doi : 10.1111/tra.12524 . PMID 28857378 . 
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7. Tang BL, Low DY, Lee SS, Tan AE, Hong W (1998年1月). 「SNAREタンパク質のシンタキシンファミリーに属するヒトシンタキシン16の分子クローニングと局在」.生化学および生物理学的研究通信. 242 (3): 673– 679. Bibcode : 1998BBRC..242..673T . doi : 10.1006/bbrc.1997.8029 . PMID 9464276 . 
8. シモンセン A、ブレムネス B、ロニング E、アスランド R、ステンマルク H (1998 年 3 月)。 「シンタキシン-16、推定上のゴルジ体t-SNARE」。欧州細胞生物学ジャーナル。75 (3): 223–231。土井: 10.1016/S0171-9335(98)80116-7。PMID 9587053。 
9. Linglart A, Gensure RC, Olney RC, Jüppner H, Bastepe M (2005年5月). 「常染色体優性偽性副甲状腺機能低下症Ib型における新規STX16欠失は、GNASのシス作用性インプリンティング制御因子の境界を再定義する」 . American Journal of Human Genetics . 76 (5): 804– 814. doi : 10.1086 /429932 . PMC 1199370. PMID 15800843 .  
10. 「Entrez遺伝子：STX16シンタキシン16」。
11. "UniProt" . UniProt . 2025年12月3日閲覧。
12. 「遺伝子: STX16 (ENSG00000124222) - 概要 - Homo_sapiens - Ensembl ゲノムブラウザ 115」 . useast.ensembl.org . 2025年12月3日閲覧。
13. "UniProt" . UniProt . 2025年12月3日閲覧。
14. 「遺伝子: Stx16 (ENSMUSG00000027522) - 概要 - Mus_musculus - Ensembl ゲノムブラウザ 115」 . useast.ensembl.org . 2025年12月3日閲覧。
15. Bastepe M, Fröhlich LF, Hendy GN, Indridason OS, Josse RG, Koshiyama H, et al. (2003年10月). 「常染色体優性偽性副甲状腺機能低下症Ib型は、GNASの推定インプリンティング制御因子を破壊する可能性のあるヘテロ接合性微小欠失を伴う」 . The Journal of Clinical Investigation . 112 (8): 1255– 1263. doi : 10.1172/JCI19159 . PMC 213493. PMID 14561710 .  
16. Cattin-Ortolá J, Kaufman JG, Gillingham AK, Wagstaff JL, Peak-Chew SY, Stevens TJ, et al. (2024-03-29). 「貨物選択的小胞係留：ゴルジ体係留構成要素TBC1D23による特定の貨物タンパク質結合の構造的基盤」 . Science Advances . 10 (13). doi : 10.1126/sciadv.adl0608 . ISSN 2375-2548 . PMC 11093223. PMID 38552021 .   
17. 「Stx16 シンタキシン16 [Mus musculus (ハツカネズミ)] - 遺伝子 - NCBI」 www.ncbi.nlm.nih.gov . 2025年12月3日閲覧。
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さらに読む

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• Mallard F, Tang BL, Galli T, Tenza D, Saint-Pol A, Yue X, et al. (2002年2月). 「初期／リサイクリングエンドソームからTGNへの輸送には2つのSNARE複合体とRab6アイソフォームが関与する」 . The Journal of Cell Biology . 156 (4): 653– 664. doi : 10.1083 / jcb.200110081 . PMC  2174079. PMID  11839770 .
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• Clark AG, Glanowski S, Nielsen R, Thomas PD, Kejariwal A, Todd MA, 他 (2003年12月). 「ヒト・チンパンジー・マウス相同遺伝子トリオからの非中立進化の推論」. Science . 302 ( 5652): 1960– 1963. Bibcode : 2003Sci...302.1960C . doi : 10.1126/science.1088821 . PMID  14671302. S2CID  6682593 .
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