ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
SEC13 利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 3BG0、3BG1、5A9Q
識別子 エイリアス SEC13 、D3S1231E、SEC13L1、SEC13R、npp-20、SEC13ホモログ、核孔およびCOPIIコート複合体成分 外部ID オミム ：600152; MGI : 99832; ホモロジーン : 6479; ジーンカード ：SEC13; OMA :SEC13 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） キリスト 6番染色体（マウス） [2] バンド 6 E3|6 52.84 cM 始める 113,705,023 bp [2] 終わり 113,717,704 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） 上位の表現 子宮内膜間質細胞 卵母細胞 下垂体 ベータ細胞 下垂体前葉 十二指腸 小腸粘膜 耳下腺 軟骨組織 脛骨
上位の表現 大臼歯 小腸上皮 精嚢 耳板 回腸上皮 下顎突出 上顎突出 心内膜クッション 神経管 十二指腸
より多くの参照表現データ
バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能
タンパク質結合 同一のタンパク質結合 構造分子活性 細胞成分
小胞体膜 細胞内膜小器官 膜 核膜 核孔 核質 GATOR2複合体 核膜孔外輪 小胞体 ERからゴルジ体への輸送小胞膜 細胞外エクソソーム 細胞質小胞 核 動原体 ゴルジ膜 リソソーム リソソーム膜 COPII小胞コート 細胞質 宿主細胞 生物学的プロセス
mRNA輸送 MHCクラスIIを介した外因性ペプチド抗原の抗原処理と提示 MHCクラスIを介した抗原処理とペプチド抗原の提示 COPII小胞コーティング タンパク質輸送 細胞内タンパク質輸送 小胞輸送 TORシグナル伝達の正の調節 姉妹染色分体接着 COPII被覆小胞貨物積載 輸送 小胞体からのタンパク質の排出 COPII被覆小胞の出芽 TORC1シグナル伝達の正の制御 解糖系の調節 核からのmRNAの輸出 核からのtRNAの輸出 ウイルスプロセス ウイルス転写 miRNAによる遺伝子サイレンシングの制御 ウイルスの細胞内輸送 熱に対する細胞反応の調節 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001136026 NM_001136232 NM_001278946 NM_030673 NM_183352
RefSeq（タンパク質） NP_001129498 NP_001129704 NP_001265875 NP_109598 NP_899195
場所（UCSC） 3章: 10.29 – 10.32 Mb 6章: 113.71 – 113.72 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
タンパク質SEC13ホモログ は、ヒトでは SEC13 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6]
この遺伝子によってコードされるタンパク質は、 WDリピート タンパク質のSEC13ファミリーに属します。これは、タンパク質輸送中に 小胞体 から 小胞体への 分化に必要な 酵母SEC13および SEC31タンパク質と類似性を有します。 [6]
参考文献
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さらに読む
Shaywitz DA, Orci L, Ravazzola M, et al. (1995). 「ヒトSEC13Rpは酵母で機能し、小胞体から出芽する輸送小胞上に存在する」 J. Cell Biol . 128 (5): 769–77 . doi :10.1083/jcb.128.5.769. PMC 2120388. PMID 7876304 . 丸山 憲治, 菅野 誠 (1994). 「オリゴキャッピング：真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡便法」. 遺伝子 . 138 ( 1–2 ): 171–4 . doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298. Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, et al. (1996). 「改良されたショットガンライブラリー構築のための「ダブルアダプター」法」 Anal. Biochem . 236 (1): 107–13 . doi :10.1006/abio.1996.0138. PMID 8619474. Yu W, Andersson B, Worley KC, et al. (1997). 「大規模連結cDNAシークエンシング」 Genome Res . 7 (4): 353–8 . doi :10.1101/gr.7.4.353. PMC 139146 . PMID 9110174. 鈴木雄三、中川吉智、丸山健、他 (1997). 「全長エンリッチドcDNAライブラリーおよび5'末端エンリッチドcDNAライブラリーの構築と特性解析」. Gene . 200 ( 1–2 ): 149–56 . doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149. Mammoto A, Sasaki T, Kim Y, Takai Y (2000). 「ラブフィリン-11と哺乳類Sec13タンパク質の物理的および機能的相互作用：小胞輸送における意義」 J. Biol. Chem . 275 (18): 13167–70 . doi : 10.1074/jbc.C000096200 . PMID 10747849. Tang BL, Zhang T, Low DY, et al. (2000). 「酵母sec31pの哺乳類ホモログ。普遍的に発現する形態は小胞体（ER）出口部位に局在し、ER-ゴルジ体輸送に必須である」。J . Biol. Chem . 275 (18): 13597– 604. doi : 10.1074/jbc.275.18.13597 . PMID 10788476. Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 . Gevaert K, Goethals M, Martens L, et al. (2004). 「N末端ペプチドの質量分析によるプロテオームの探索とタンパク質プロセシングの解析」 Nat. Biotechnol . 21 (5): 566–9 . doi :10.1038/nbt810. PMID 12665801. S2CID 23783563. Enninga J, Levay A, Fontoura BM (2003). 「Sec13は核と細胞質の間を往復し、核膜孔複合体においてNup96と安定的に相互作用する」. Mol. Cell. Biol . 23 (20): 7271–84 . doi :10.1128/MCB.23.20.7271-7284.2003. PMC 230331. PMID 14517296 . 太田 剛志、鈴木 雄志、西川 剛志、他 (2004). 「21,243個の完全長ヒトcDNAの完全配列決定と特性解析」 Nat. Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039. Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, et al. (2004). 「ヒトTNF-α/NF-κBシグナル伝達経路の物理的および機能的マップ」 Nat. Cell Biol . 6 (2): 97– 105. doi :10.1038/ncb1086. PMID 14743216. S2CID 11683986. Loïodice I, Alves A, Rabut G, et al. (2005). 「3つの新規メンバーを含むNup107-160複合体全体が、有糸分裂においてキネトコアに一体として標的化される」 Mol. Biol. Cell . 15 (7): 3333– 44. doi :10.1091/mbc.E03-12-0878. PMC 452587. PMID 15146057 . Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大：哺乳類遺伝子コレクション（MGC）」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 . Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップの構築に向けて」 Nature . 437 (7062): 1173–8 . Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026. Stagg SM, Gürkan C, Fowler DM, et al. (2006). 「Sec13/31 COPIIコートケージの構造」. Nature . 439 (7073): 234–8 . Bibcode :2006Natur.439..234S. doi :10.1038/nature04339. PMID 16407955. S2CID 2426465.
