| SeqA、C末端ドメイン | |||||||||
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 大腸菌SeqAタンパク質とn6-メチルアデニン-グアニンミスマッチDNAの複合体の結晶構造 | |||||||||
| 識別子 | |||||||||
| シンボル | SeqA | ||||||||
| ファム | PF03925 | ||||||||
| インタープロ | IPR005621 | ||||||||
| SCOP2 | 1lrr / スコープ / SUPFAM | ||||||||
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分子生物学において、SeqA タンパク質は細菌と古細菌に存在します。このタンパク質の機能はDNA複製において極めて重要です。このタンパク質は、大腸菌（Escherichia coli）の複製起点（OriC）において、 DNA複製の開始を負に制御します。[ 1]さらに、このタンパク質は隔離においても重要な役割を果たします。このタンパク質の重要性は極めて高く、DNA複製、細胞分裂、その他の重要なプロセスにおいて、このタンパク質の助けがなければ起こりません。このタンパク質ドメインは、SeqBなどの他のタンパク質を含む、はるかに大きなタンパク質複合体の一部であると考えられています。[2]
関数
DNA複製はエネルギーを消費するプロセスであるため、細菌では細胞周期の特定のチェックポイントでのみ起こります。SeqAタンパク質のヘミメチル化GATC配列への結合は、oriCにおける染色体複製開始の負の調節、および大腸菌の染色体分離に必要なSeqAフォーカスの形成に重要です。[3]
SeqAテトラマーは、濃度依存的に可逆的に凝集または多量体化することができる。[3] DNA複製の制御における機能とは別に、SeqAは特異的転写因子である可能性もある。[4]
さらに、SeqAは染色体の組織化と遺伝子制御にも役割を果たしていると考えられています。[5]
ローカリゼーション
細胞内のSeqAのほとんどは複製フォークで新しいDNAに結合して発見されています。[5]
構造
N末端ドメイン
N末端ドメインは2つのαヘリックスと1つのβストランドに折り畳まれる。このタンパク質ドメインは多量体形成を助ける上で極めて重要である。 [5]
C末端ドメイン
C末端 タンパク質ドメインはDNAへの結合において重要な役割を果たします 。oriCにおいて、完全メチル化およびヘミメチル化されたGATC配列に結合します。C末端ドメインの構造は、7つのαヘリックスと3本鎖βシートで構成されています。[5]
参考文献
- ^ Slater S, Wold S, Lu M, Boye E, Skarstad K, Kleckner N (1995年9月). 「大腸菌SeqAタンパク質は、DNA複製開始と複製起点隔離における役割に応じて、2つの異なるメチル化制御反応でoriCに結合する」. Cell . 82 (6): 927–36 . doi : 10.1016/0092-8674(95)90272-4 . PMID 7553853. S2CID 14652024.
- ^ Shakibai N, Ishidate K, Reshetnyak E, Gunji S, Kohiyama M, Rothfield L (1998年9月). 「大腸菌膜におけるヘミメチル化oriCの高親和性結合は、SeqAと新たに同定された因子SeqBを含む多タンパク質系によって媒介される」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 95 (19): 11117–21 . Bibcode :1998PNAS...9511117S. doi : 10.1073/pnas.95.19.11117 . PMC 21605. PMID 9736699 .
- ^ ab Lee H, Kang S, Bae SH, Choi BS, Hwang DS (2001年9月). 「SeqAタンパク質の凝集はSeqAの機能に必要である」. The Journal of Biological Chemistry . 276 (37): 34600–6 . doi : 10.1074/jbc.M101339200 . PMID 11457824.
- ^ Slomińska M、Wegrzyn A、Konopa G、Skarstad K、Wegrzyn G (2001 年 6 月)。 「大腸菌由来の隔離タンパク質であるSeqAも、特異的な転写因子です。」分子微生物学。40 (6): 1371–9 .土井:10.1046/j.1365-2958.2001.02480.x。PMID 11442835。S2CID 21295910 。
- ^ abcd Waldminghaus T, Skarstad K (2009年5月). 「大腸菌SeqAタンパク質」. Plasmid . 61 (3): 141–50 . doi :10.1016/j.plasmid.2009.02.004. PMID 19254745.
