スリット2

スリット2
利用可能な構造 PDB オルソログ検索: H0Y9Z6 PDBe H0Y9Z6 RCSB PDB IDコードのリスト 2V70、2V9S、2V9T、2WFH
識別子
エイリアス	SLIT2、SLIL3、Slit-2、スリットガイダンスリガンド2
外部ID	オミム：603746; MGI : 1315205;ホモロジーン: 3516;ジーンカード：SLIT2; OMA :SLIT2 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 4番染色体（ヒト）[1] バンド 4p15.31 始める 20,251,905 bp [1] 終わり 20,620,561 bp [1]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 5番染色体（マウス）[2] バンド 5|5 B3 始める 48,140,​​480 bp [2] 終わり 48,465,075 bp [2]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 肺の下葉 嗅球 大静脈 三叉神経節 右肺 脊髄神経節 尿道 心膜 壁側胸膜 中側頭回 上位の表現 フロアプレート 毛様体 坐骨神経 精管 脈絡叢上皮 大腿骨体 虹彩 左肺葉 髄質集合管 乳頭体 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 カルシウムイオン結合 ヘパリン結合 タンパク質ホモ二量体化活性 GTPase阻害剤活性 ラミニン1結合 タンパク質結合 同一のタンパク質結合 ラウンドアバウトバインディング プロテオグリカン結合 細胞成分 細胞質 膜 細胞外領域 細胞表面 細胞外エクソソーム 細胞膜 細胞外空間 生物学的プロセス タンパク質リン酸化の負の制御 ケモカインを介したシグナル伝達経路の負の制御 好中球走化性の負の調節 成長因子刺激に対する細胞応答の負の調節 胎児嗅球介在ニューロン前駆細胞の移動に関与する化学反発 細胞分化 尿管芽の発達 負の走化性 アクチンフィラメント重合の負の制御 低分子量GTPaseを介したシグナル伝達の負の制御 網膜神経節細胞の軸索誘導の負の制御 単核細胞の移動の負の調節 脊髄を通る皮質脊髄ニューロンの軸索誘導 平滑筋細胞の移動の負の調節 ラウンドアバウトシグナル伝達経路 軸索形成の正の調節 神経系の発達 血管新生の芽生えに関与する細胞移動 内皮細胞遊走の負の調節 軸索誘導 多細胞生物の発達 走化性 平滑筋細胞の走化性の負の調節 ホルモン刺激に対する細胞反応 細胞移動の負の調節 単球走化性の負の調節 細胞増殖の負の調節 コルチゾールへの反応 黄体退縮に関与するアポトーシス過程 アポトーシス過程の正の調節 負の走化性の誘導 ヘパリンに対する細胞反応 運動ニューロンの軸索誘導 上皮管の分岐形態形成 白血球走化性の負の調節 出生後の嗅球介在ニューロンの移動に関与する化学反発 軸索誘導に関与する軸索伸展 ラメリポディウムの組み立ての負の調節 血管透過性の負の調節 網膜神経節細胞の軸索誘導 GTPase活性の負の調節 大動脈弁の形態形成 肺弁の形態形成 心室中隔の形態形成 出典：Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 9353 20563 アンサンブル ENSG00000145147 ENSMUSG00000031558 ユニプロット O94813 Q9R1B9 RefSeq (mRNA) NM_001289135 NM_001289136 NM_004787 NM_001291227 NM_001291228 NM_178804 RefSeq（タンパク質） NP_001276064 NP_001276065 NP_004778 NP_001278156 NP_001278157 NP_848919 場所（UCSC） 4章: 20.25 – 20.62 MB 5章: 48.14 – 48.47 Mb PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
人間の表示/編集 マウスの表示/編集

スリットホモログ2タンパク質は、ヒトではSLIT2遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[5] [6] [7]}

相互作用

SLIT2はグリピカン1と相互作用することが示されている。^[8]

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000145147 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000031558 – Ensembl、2017年5月
3. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. 伊藤 明、宮林 剛、大野 正治、坂野 誠 (1999年2月). 「ショウジョウバエslitの3つの哺乳類ホモログのクローニングと発現は、神経系の形成と維持におけるSlitの役割を示唆している」Brain Res Mol Brain Res . 62 (2): 175–86 . doi :10.1016/S0169-328X(98)00224-1. PMID  9813312.
6. Chedotal A (2008年2月). 「スリットとその受容体」.軸索の成長と誘導. 実験医学生物学の進歩. 第621巻. pp.  65– 80. doi :10.1007/978-0-387-76715-4_5. ISBN 978-0-387-76714-7. PMID  18269211。
7. 「Entrez Gene: SLIT2 slit homolog 2 (Drosophila)」.
8. Ronca F, Andersen JS, Paech V, Margolis RU (2001年8月). 「Slitタンパク質とグリピカン-1の相互作用の特性評価」. J. Biol. Chem . 276 (31). 米国: 29141–7 . doi : 10.1074/jbc.M100240200 . ISSN  0021-9258. PMID  11375980.

さらに読む

• Wong K, Park HT, Wu JY, Rao Y (2003). 「スリットタンパク質：ニューロンから白血球まで幅広い細胞に対する分子ガイダンスの手がかり」. Curr. Opin. Genet. Dev . 12 (5): 583–91 . doi :10.1016/S0959-437X(02)00343-X. PMID  12200164.
• Zhao XC, Zhang LM, Li Q, Tong DY, Fan LC, An P, Wu XY, Chen WM, Zhao P, Wang J. (2013). 「イソフルランポストコンディショニングはSlit2/Robo1の発現上昇を介して皮質ニューロンの初代培養における酸素およびグルコース欠乏障害を抑制する」Brain Res . 1537 : 283–9 . doi :10.1016/j.brainres.2013.08.036. PMC  3820100 . PMID  23994690.
• Wang KH, Brose K, Arnott D, et al. (1999). 「感覚軸索の伸長と分岐の正の調節因子としての哺乳類スリットタンパク質の生化学的精製」. Cell . 96 (6): 771–84 . doi : 10.1016/S0092-8674(00)80588-7 . PMID  10102266. S2CID  16810644.
• Brose K, Bland KS, Wang KH, et al. (1999). 「Slitタンパク質はRobo受容体に結合し、反発的な軸索誘導において進化的に保存された役割を果たす」. Cell . 96 (6): 795– 806. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80590-5 . PMID  10102268. S2CID  16301178.
• Li HS, Chen JH, Wu W, et al. (1999). 「脊椎動物のスリットは膜貫通タンパク質ラウンドアバウトの分泌リガンドであり、嗅球軸索に対する忌避剤として作用する」. Cell . 96 (6): 807–18 . doi : 10.1016/S0092-8674(00)80591-7 . PMID  10102269.
• Nguyen Ba-Charvet KT, Brose K, Marillat V, et al. (1999). 「Slit2を介した化学反発と発達中の前脳軸索の崩壊」Neuron . 22 (3): 463–73 . doi : 10.1016/S0896-6273(00)80702-3 . PMID  10197527. S2CID  18663762.
• Holmes GP, Negus K, Burridge L, et al. (1999). 「脊椎動物のスリットホモログ2種の異なるが重複する発現パターンは、中枢神経系の発達と器官形成における機能的役割を示唆する」Mech. Dev . 79 ( 1– 2): 57– 72. doi : 10.1016/S0925-4773(98)00174-9 . PMID  10349621. S2CID  6057216.
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• Zou Y, Stoeckli E, Chen H, Tessier-Lavigne M (2000). 「灰白質からの軸索の絞り出し：正中線および腹側脊髄由来のスリットタンパク質およびセマフォリンタンパク質の役割」（PDF） . Cell . 102 (3): 363– 75. doi :10.1016/S0092-8674(00)00041-6. PMID  10975526. S2CID  14174593. オリジナル（PDF）から2018年11月1日にアーカイブ。 2020年9月11日閲覧。
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• Wu JY, Feng L, Park HT, et al. (2001). 「神経忌避因子Slitは走化性因子によって誘導される白血球走化性を阻害する」Nature . 410 (6831): 948–52 . Bibcode :2001Natur.410..948W. doi :10.1038/35073616. PMC 2072862.  PMID 11309622  .
• Ronca F, Andersen JS, Paech V, Margolis RU (2001). 「Slitタンパク質とグリピカン-1の相互作用の特性評価」. J. Biol. Chem . 276 (31): 29141–7 . doi : 10.1074/jbc.M100240200 . PMID  11375980.
• Nguyen Ba-Charvet KT, Brose K, Ma L, et al. (2001). 「軸索誘導におけるSlit2タンパク質分解断片の作用の多様性と特異性」. J. Neurosci . 21 (12): 4281–9 . doi : 10.1523/JNEUROSCI.21-12-04281.2001 . PMC  6762758. PMID  11404413 .
• Little M, Rumballe B, Georgas K, et al. (2003). 「マウスおよびヒトのSlit遺伝子における保存されたモジュール性と選択的スプライシングの可能性」. Int. J. Dev. Biol . 46 (4): 385–91 . PMID  12141424.
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