分子生物学において、低分子核小体RNA由来のマイクロRNAは、低分子核小体RNA（snoRNA）から派生したマイクロRNA （miRNA）です。マイクロRNAは通常、pre-miRNAと呼ばれる前駆体から派生します。これらのpre-miRNAは、 Pashaタンパク質とDroshaタンパク質によってpri-miRNA前駆体から認識・切断されます。しかし、一部のマイクロRNA（ミルトロン）は、Pashaタンパク質とDroshaタンパク質を経由しない別の経路でイントロンから派生することが知られています。また、一部のマイクロRNAは低分子核小体RNAから派生することも知られています。
発見
核小体由来の低分子RNA由来のマイクロRNAは、2008年に初めて報告されました。原虫性 腸管寄生虫である ジアルジア・ランブリアは、プリmiRNAからプレmiRNAを切断するDroshaタンパク質を欠損しています。しかし、ジアルジアにはmiRNA処理タンパク質ダイサーが存在します。[1] 26ヌクレオチドのRNAであるmiR2は、ジアルジア・ランブリアのsnoRNAであるGlsR17からダイサーによって処理されます。miR2は、変異型表面タンパク質の発現を制御する可能性のあるマイクロRNAです。[2]
2008年には、ヒトカハール小体特異的RNAであるSCARNA15からDicerによって切断される小さなRNAが発見されました。この小さなRNAはマイクロRNAとして機能することが確認されました。また、他のいくつかのヒトsnoRNAにも、マイクロRNAの可能性があるものが同定されました。[3]
ジアルジアsnoRNA由来のmiRNA
ランブル鞭毛虫は少なくとも20種類のsnoRNAを産生する。[4] SnoRNAはrRNAの修飾を誘導し、標的RNAと相補的な10～21ヌクレオチドの領域を含む。[5]ランブル鞭毛虫のsnoRNAのうち5種類はrRNAと相補性がないため、異なる機能を持つ可能性がある。[4]マイクロRNAはランブル鞭毛虫のボックスC/D snoRNAのうち5種類から派生している。
- マイクロRNA miR2はsnoRNA GlsR17に由来し、変異表面タンパク質の発現を制御する可能性がある[2]
- マイクロRNA miR3はsnoRNA GlsR16から派生した[2]
- マイクロRNAであるmiR5は、snoRNAであるGlsR2に由来する。miR5は、4つのキナーゼと3つの変異型表面タンパク質を含む、複数の異なる遺伝子の発現を制御する可能性がある。これらの変異型表面タンパク質は、miR2によって制御される可能性のあるタンパク質とは異なる[6]。
- マイクロRNA miR6はsnoRNA GlsR1に由来する。このmiRNAの予測標的部位には、変異型表面タンパク質が含まれる[7]。
- マイクロRNA miR10はsnoRNA GlsR8に由来する。このmiRNAの予測標的部位には、変異型表面タンパク質が含まれる[7]。
参照
参考文献
- ^ Macrae IJ, Zhou K, Li F, Repic A, Brooks AN, Cande WZ, et al. (2006). 「Dicerによる二本鎖RNAプロセシングの構造的基盤」. Science . 311 (5758): 195– 198. Bibcode :2006Sci...311..195M. doi :10.1126/science.1121638. PMID 16410517. S2CID 23785494.
- ^ abc サライヤ AA、ワン CC (2008)。 「snoRNA、ランブル鞭毛虫におけるmicroRNAの新規前駆体」。PLOS パトス。4 (11) e1000224。土井：10.1371/journal.ppat.1000224。PMC 2583053。PMID 19043559。
- ^ エンダー C、クレック A、フリードレンダー MR、バイツィンガー M、ワインマン L、チェン W、他。 （2008年）。 「microRNA様の機能を持つヒトsnoRNA」。モルセル。32 (4): 519–528。土井: 10.1016/j.molcel.2008.10.017。PMID 19026782。
- ^ ab Yang CY、Zhou H、Luo J、Qu LH (2005)。 「原始真核生物、ランブル鞭毛虫からの 20 個の snoRNA 様 RNA の同定」。Biochem Biophys Res Commun。328 (4): 1224–1231。Bibcode :2005BBRC..328.1224Y。土井：10.1016/j.bbrc.2005.01.077。PMID 15708007。
- ^ Kiss-László Z, Henry Y, Kiss T (1998). 「メチル化の配列と構造要素はpre-rRNAの部位特異的リボースメチル化に必須なsnoRNAを誘導する」EMBO J. 17 ( 3): 797– 807. doi :10.1093/emboj/17.3.797. PMC 1170428. PMID 9451004 .
- ^ Li W, Saraiya AA, Wang CC (2011). 「Giardia lambiaにおける遺伝子制御には、小さな核小体RNA由来の推定マイクロRNAが関与している」. PLOS Negl Trop Dis . 5 (10) e1338. doi : 10.1371/journal.pntd.0001338 . PMC 3196473. PMID 22028939 .
- ^ ab Li W, Saraiya AA, Wang CC (2012). 「ジアルジア・ランブリアにおける変異体表面タンパク質の発現を制御するsnoRNA由来マイクロRNAのプロファイル」. Cell Microbiol . 14 (9): 1455– 1473. doi :10.1111/j.1462-5822.2012.01811.x. PMC 3422372. PMID 22568619 .
