ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
| TIMP4 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | TIMP4、TIMPメタロペプチダーゼ阻害剤4、TIMP-4 |
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| 外部ID | オミム:601915; MGI : 109125;ホモロジーン: 37748;ジーンカード:TIMP4; OMA :TIMP4 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | 6番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 6 E3|6 53.29 cM | 始める | 115,218,853 bp [2] |
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| 終わり | 115,229,166 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - 腹部の脂肪
- 皮下脂肪組織
- 胸部大動脈
- 左冠動脈
- 上行大動脈
- 心臓の頂点
- 滑膜関節
- 小脳の右半球
- 下行胸部大動脈
- 膝窩動脈
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| | 上位の表現 | - 心室中隔
- 白色脂肪組織
- 小脳葉
- 小脳虫部
- 脊髄の腰椎亜節
- 運動ニューロン
- 深部小脳核
- 大動脈領域の中膜
- 黒質
- 褐色脂肪組織
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS |  | | より多くの参照表現データ |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- ペプチダーゼ阻害活性
- 酵素阻害活性
- 金属イオン結合
- プロテアーゼ結合
- メタロエンドペプチダーゼ阻害活性
| | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- ノッチシグナル伝達経路
- ペプチダーゼ活性の負の調節
- ペプチドホルモンへの反応
- 中枢神経系の発達
- リポ多糖類に対する反応
- 排卵周期
- 膜タンパク質細胞外ドメインのタンパク質分解の負の制御
- 触媒活性の負の調節
- エンドペプチダーゼ活性の負の調節
- ホルモンへの反応
- サイトカインへの反応
- 生物学的プロセス
- 有機物への反応
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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メタロプロテアーゼインヒビター4は、ヒトではTIMP4遺伝子によってコードされる酵素である。[5] [6] [7]
この遺伝子は、組織メタロプロテアーゼ阻害遺伝子ファミリーに属する。この遺伝子ファミリーによってコードされるタンパク質は、細胞外マトリックスの分解に関与するペプチダーゼ群であるマトリックスメタロプロテアーゼの阻害因子である。この遺伝子によってコードされる分泌型のネトリンドメイン含有タンパク質は、血小板凝集およびリクルートメントの調節に関与しており、ホルモン調節および子宮内膜組織のリモデリングにも関与している可能性がある。[7]
相互作用
TIMP4はMMP2と相互作用することが示されている。[8] [9]
参照
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000157150 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000030317 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ Greene J, Wang M, Liu YE, Raymond LA, Rosen C, Shi YE (1997年1月). 「ヒト組織メタロプロテアーゼ阻害剤4の分子クローニングと特性解析」. J Biol Chem . 271 (48): 30375– 30380. doi : 10.1074/jbc.271.48.30375 . PMID 8939999.
- ^ Olson TM, Hirohata S, Ye J, Leco K, Seldin MF, Apte SS (1998年9月). 「ヒト組織メタロプロテアーゼ阻害因子4遺伝子(TIMP4)のクローニングと、TIMP4遺伝子およびTimp4遺伝子のヒト染色体3p25およびマウス染色体6への局在」. Genomics . 51 (1): 148– 151. doi :10.1006/geno.1998.5362. PMID 9693046.
- ^ ab 「Entrez Gene: TIMP4 TIMPメタロペプチダーゼ阻害剤4」。
- ^ Bigg HF, Shi YE, Liu YE, Steffensen B, Overall CM (1997年6月). 「ヒトゼラチナーゼAのCOOH末端ヘモペキシン様ドメインへの組織メタロプロテアーゼ阻害剤-4(TIMP-4)の特異的かつ高親和性結合。TIMP-4はTIMP-2と同様にプロゼラチナーゼAおよびCOOH末端ドメインに結合する」. J. Biol. Chem . 272 (24): 15496– 15500. doi : 10.1074/jbc.272.24.15496 . ISSN 0021-9258. PMID 9182583.
- ^ Kai HS, Butler Georgina S, Morrison Charlotte J, King Angela E, Pelman Gayle R, Overall Christopher M (2002年12月). 「新規組換えミオグロビン融合タンパク質発現システムを用いた、組織メタロプロテアーゼ阻害因子(TIMP)-4およびTIMP-2のC末端ドメインと末端の変異誘発による特性解析。MMP-2ヘモペキシンCドメインへの結合における酸性残基の重要性」. J. Biol. Chem . 277 (50): 48696– 48707. doi : 10.1074/jbc.M209177200 . ISSN 0021-9258. PMID 12374789.
さらに読む
- Bigg HF, Shi YE, Liu YE, et al. (1997). 「ヒトゼラチナーゼAのCOOH末端ヘモペキシン様ドメインへの組織メタロプロテアーゼ阻害剤-4(TIMP-4)の特異的かつ高親和性結合。TIMP-4はTIMP-2と同様にプロゼラチナーゼAおよびCOOH末端ドメインに結合する」J. Biol. Chem . 272 (24): 15496– 15500. doi : 10.1074/jbc.272.24.15496 . PMID 9182583.
- Pohar N, Godenschwege TA, Buchner E (1999). 「無脊椎動物の組織メタロプロテアーゼ阻害因子:シナプシン遺伝子座における構造とネスト遺伝子構成はショウジョウバエからヒトまで保存されている」. Genomics . 57 (2): 293– 296. doi :10.1006/geno.1999.5776. PMID 10198170.
- ヘルナンデス・バランテス S、志村 Y、ソロウェイ PD、他(2001)。 「MT1-MMPによるプロMMP-2活性化におけるTIMP-4とTIMP-2の異なる役割」。生化学。生物物理学。解像度共通。281 (1): 126–130。土井:10.1006/bbrc.2001.4323。PMID 11178970。
- Huang W, Li WQ, Dehnade F, Zafarullah M (2002). 「ヒト変形性大腿骨頭軟骨における組織メタロプロテアーゼ阻害因子-4(TIMP-4)遺伝子発現の亢進」J. Cell. Biochem . 85 (2): 295– 303. doi :10.1002/jcb.10138. PMID 11948685. S2CID 43053515.
- Zhang J, Cao YJ, Zhao YG, et al. (2003). 「ヒト正常細胞栄養芽細胞および絨毛癌細胞株JEG-3におけるマトリックスメタロプロテアーゼ-26および組織メタロプロテアーゼ阻害因子-4の発現」Mol. Hum. Reprod . 8 (7): 659– 666. doi : 10.1093/molehr/8.7.659 . PMID 12087081.
- Kai HS, Butler GS, Morrison CJ, et al. (2003). 「新規組換えミオグロビン融合タンパク質発現システムを用いた、組織メタロプロテアーゼ阻害因子(TIMP)-4およびTIMP-2のC末端ドメインと末端の変異誘発による特性解析。MMP-2ヘモペキシンCドメインへの結合における酸性残基の重要性」J. Biol. Chem . 277 (50): 48696– 48707. doi : 10.1074/jbc.M209177200 . PMID 12374789.
- Radomski A, Jurasz P, Sanders EJ, et al. (2003). 「ヒト血小板における組織メタロプロテアーゼ阻害因子-4(TIMP-4)の同定、制御および役割」Br. J. Pharmacol . 137 (8): 1330– 1338. doi :10.1038/sj.bjp.0704936. PMC 1573597. PMID 12466243 .
- Troeberg L, Tanaka M, Wait R, et al. (2003). 「大腸菌におけるTIMP-4の発現とTIMP-1およびTIMP-2との比較速度論的研究:TIMPとマトリックスメタロプロテアーゼ2(ゼラチナーゼA)の相互作用に関する知見」.生化学. 41 (50): 15025– 15035. doi :10.1021/bi026454l. PMID 12475252.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 16903. Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- Chegini N, Rhoton-Vlasak A, Williams RS (2003). 「正常月経周期における子宮内膜におけるマトリックスメタロプロテアーゼ-26およびマトリックスメタロプロテアーゼ-3および-4の組織阻害因子の発現と、レボノルゲストレルインプラント使用者における不規則子宮出血の変化」Fertil. Steril . 80 (3): 564– 570. doi : 10.1016/S0015-0282(03)00797-0 . PMID 12969699.
- Zhao YG, Xiao AZ, Park HI, et al. (2004). 「ヒト乳管癌in situにおけるエンドメターゼ/マトリライシン-2とメタロプロテアーゼ-2および-4の組織阻害剤によるその阻害:乳癌浸潤の開始における推定役割」Cancer Res . 64 (2): 590– 598. doi :10.1158/0008-5472.CAN-03-1932. PMID 14744773. S2CID 15342778.
- Pilka R, Domanski H, Hansson S, et al. (2005). 「子宮内膜TIMP-4 mRNAは中期および増殖期に高値を示すが、悪性腫瘍では低下する。MMP-26との協調的発現」Mol. Hum. Reprod . 10 (9): 641– 650. doi : 10.1093/molehr/gah092 . PMID 15273280.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大:哺乳類遺伝子コレクション(MGC)」. Genome Res . 14 (10B): 2121– 2127. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
- Lee MH, Rapti M, Murphy G (2005). 「特定のメタロプロテアーゼ標的への組織メタロプロテアーゼ阻害剤(TIMP)の完全転換:腫瘍壊死因子α変換酵素の最適阻害のためのTIMP-4の微調整」J. Biol. Chem . 280 (16): 15967–75 . doi : 10.1074/jbc.M500897200 . PMID 15713681.
- Lizarraga F, Espinosa M, Maldonado V, Melendez-Zajgla J (2005). 「子宮頸がん患者における組織メタロプロテアーゼ阻害因子4の発現」. Anticancer Res . 25 (1B): 623–7 . PMID 15816637.
- Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップの構築に向けて」Nature . 437 (7062): 1173– 1178. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- Koskivirta I, Rahkonen O, Mäyränpää M, et al. (2007). 「組織メタロプロテアーゼ阻害因子4(TIMP4)はヒト心血管病変の炎症プロセスに関与している」Histochem. Cell Biol . 126 (3): 335– 342. doi :10.1007/s00418-006-0163-8. PMID 16521002. S2CID 10581957.
- Pilka R, Noskova V, Domanski H, et al. (2006). 「子宮内膜TIMP-4 mRNAは間質で発現し、TIMP-4タンパク質は上皮に蓄積して子宮液中に放出される」Mol. Hum. Reprod . 12 (8): 497– 503. doi : 10.1093/molehr/gal055 . PMID 16809379.
外部リンク
- ペプチダーゼとその阻害剤に関するMEROPSオンラインデータベース:I35.004