ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
| TLX3 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | TLX3、HOX11L2、RNX、T細胞白血病ホメオボックス3、T細胞白血病ホメオボックス3 |
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| 外部ID | オミム:604640; MGI : 1351209;ホモロジーン: 23181;ジーンカード:TLX3; OMA :TLX3 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | 11番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 11|11 A4 | 始める | 33,150,752 bp [2] |
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| 終わり | 33,153,589 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - 小脳の右半球
- C1セグメント
- 下垂体
- 下垂体前葉
- 鼻粘膜の嗅覚領域
- 前頭葉皮質
- 女性の生殖器系
- 卵管
- 外皮
- 皮膚の領域
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| | 上位の表現 | - 腰椎神経節
- 尿道
- 女性の尿道
- 男性尿道
- 神経管
- 腸管神経系
- 三叉神経節
- 胚
- 迷走神経節
- 舌咽神経節
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS |  | | より多くの参照表現データ |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- 配列特異的DNA結合
- DNA結合
- タンパク質結合
- DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
- DNA結合転写因子活性
| | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- 多細胞生物の発達
- 神経系プロセスによる呼吸ガス交換の調節
- 細胞運命の指定
- ニューロン運命の指定
- 中枢神経系の発達
- ニューロンの移動
- 転写の制御、DNAテンプレート
- ニューロン分化の負の調節
- 呼吸器系による呼吸ガス交換
- ニューロンの分化
- RNAポリメラーゼIIによる転写の調節
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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T細胞白血病ホメオボックスタンパク質3は、ヒトではTLX3遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7]
RNX(HOX11L2、TLX3)は、 DNA結合性核転写因子をコードするオーファンホメオボックス遺伝子ファミリーに属する。HOX11遺伝子ファミリーのメンバーは、高度に保存されたホメオドメインにおいて、シトシンが47番目のスレオニンに置換されていることを特徴とする(Dear et al., 1993)。[OMIM提供] [7]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000164438 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000040610 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ Lee-Kirsch MA, Engel K, Paditz E, Rosen-Wolff A, Lee YA, Gahr M (2001年7月). 「放射線ハイブリッドマッピングによるヒトホメオボックス11様2遺伝子(HOX11L2)の染色体5q34→q35への割り当て」Cytogenet Cell Genet . 92 ( 3– 4): 358. doi :10.1159/000056933. PMID 11435718. S2CID 85323468.
- ^ Cinti R, Fava M, Sancandi M, Matera I, Ravazzolo R, Ceccherini I (2001年7月). 「in situハイブリダイゼーションによるHOX11L2遺伝子のヒト染色体バンド5q35.1への割り当て、およびそのマウスホモログのマウス染色体バンド11A4-A5への割り当て」Cytogenet Cell Genet . 92 ( 3–4 ): 354–5 . doi :10.1159/000056931. PMID 11435716. S2CID 35224759.
- ^ ab 「Entrez Gene: TLX3 T細胞白血病ホメオボックス3」。
さらに読む
- Dear TN, Sanchez-Garcia I, Rabbitts TH (1993). 「HOX11遺伝子は、ホメオボックス遺伝子の異なるファミリーに属するDNA結合核転写因子をコードする」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 90 (10): 4431–5 . doi : 10.1073/pnas.90.10.4431 . PMC 46525 . PMID 8099440.
- Bernard OA, Busson-LeConiat M, Ballerini P, et al. (2002). 「新たな反復性かつ特異的な潜在性転座t(5;14)(q35;q32)は、T型急性リンパ芽球性白血病におけるHox11L2遺伝子の発現と関連する」. Leukemia . 15 (10): 1495–504 . doi :10.1038/sj.leu.2402249. PMID 11587205. S2CID 32493784.
- Ballerini P, Blaise A, Busson-Le Coniat M, et al. (2002). 「HOX11L2発現は、予後不良に関連する小児T-ALLの臨床サブタイプを定義する」Blood . 100 (3): 991–7 . doi : 10.1182/blood-2001-11-0093 . PMID 12130513. S2CID 16589332.
- Matera I, Bachetti T, Cinti R, et al. (2003). 「先天性中枢性低換気症候群におけるRNX遺伝子の変異解析」Am. J. Med. Genet . 113 (2): 178–82 . doi : 10.1002/ajmg.10746 . PMID 12407709.
- Mauvieux L, Leymarie V, Helias C, et al. (2003). 「T-ALL患児におけるHox11L2発現の高頻度」.白血病. 16 (12): 2417–22 . doi :10.1038/sj.leu.2402709. PMID 12454747. S2CID 20611777.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- Berger R、Dastugue N、Busson M、他。 (2003年)。 「t(5;14)/HOX11L2 陽性 T 細胞急性リンパ性白血病。Groupe Français de Cytogénétique Hématologique (GFCH) の共同研究」。白血病。17 (9): 1851–7 .土井:10.1038/sj.leu.2403061。PMID 12970786。S2CID 24379766 。
- Cavé H, Suciu S, Preudhomme C, et al. (2004). 「小児T細胞悪性腫瘍におけるt(5;14)(q35;q32)に関連するHOX11L2発現、HOX11発現、およびSIL-TAL融合の臨床的意義:EORTC研究58881および58951の結果」Blood . 103 (2): 442–50 . doi : 10.1182/blood-2003-05-1495 . PMID 14504110.
- Su XY, Busson M, Della Valle V, et al. (2004). 「T細胞急性リンパ芽球性白血病において、TLX3遺伝子座を標的とした様々なタイプの転座がみられる」Genes Chromosomes Cancer . 41 (3): 243–9 . doi :10.1002/gcc.20088. PMID 15334547. S2CID 19782389.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大:哺乳類遺伝子コレクション(MGC)」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
- Ballerini P, Busson M, Fasola S, et al. (2005). 「t(5;14)/HOX11L2陽性ALLにおけるNUP214-ABL1増幅は複数の形態を呈し、予後予測因子となる可能性がある」.白血病. 19 (3): 468–70 . doi :10.1038/sj.leu.2403654. PMID 15674415. S2CID 27045652.
- Gottardo NG, Jacoby PA, Sather HN, et al. (2005). 「小児がんグループのプロトコルに従って治療を受けたT細胞急性リンパ芽球性白血病の小児におけるHOX11L2/TLX3発現の意義」.白血病. 19 (9): 1705–8 . doi : 10.1038/sj.leu.2403834 . PMID 15990867.
- Borghini S, Vargiolu M, Di Duca M, et al. (2006). 「核因子Yは、T細胞急性リンパ性白血病で過剰発現する遺伝子であるヒトTLX3の基礎転写を促進する」Mol. Cancer Res . 4 (9): 635–43 . doi : 10.1158/1541-7786.MCR-05-0250 . PMID 16966433.
- Nagel S, Scherr M, Kel A, et al. (2007). 「t(5;14)(q35;q32) T細胞急性リンパ芽球性白血病におけるTLX3およびNKX2-5の活性化:リモート3'-BCL11BエンハンサーとPU.1およびHMGA1による共制御」Cancer Res . 67 (4): 1461–71 . doi : 10.1158/0008-5472.CAN-06-2615 . PMID 17308084.