ユビキチンD

UB
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2MBE
識別子
エイリアス	UBD、FAT10、GABBR1、UBD-3、ユビキチンD
外部ID	オミム: 606050 ; MGI : 1344410 ;ホモロジーン: 4665 ;ジーンカード：UBD ; OMA : UBD - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 6番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 6p22.1 始める 29,555,515 bp [ 1 ] 終わり 29,559,732 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 17番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 17|17 B1 始める 37,504,783 bp [ 2 ] 終わり 37,506,986 bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 付録 リンパ節 ランゲルハンス島 直腸 胆嚢 人間の腎臓 扁桃腺 鼻粘膜の嗅覚領域 肝臓 脾臓 上位の表現 胸腺 腸間膜リンパ節 空腸 胃の粘液細胞 乳腺 皮下脂肪組織 胚 十二指腸 脾臓 腸絨毛 より多くの参照表現データ バイオGPS 該当なし
遺伝子オントロジー 分子機能 プロテアソーム結合 タンパク質結合 細胞成分 細胞質 攻撃的な 核 原線維中心 細胞質 生物学的プロセス I-κBキナーゼ/NF-κBシグナル伝達の正の制御 腫瘍壊死因子に対する反応 骨髄樹状細胞の分化 小さなタンパク質の結合によるタンパク質修飾 タンパク質のユビキチン化 ユビキチン依存性タンパク質分解プロセス インターフェロンガンマへの反応 タンパク質分解 積極的な集会 アポトーシス過程の正の調節 翻訳後タンパク質修飾 有糸分裂細胞周期の相転移の調節 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 10537 24108 アンサンブル ENSG00000228913 ENSG00000231968 ENSG00000206468 ENSG00000206513 ENSG00000224654 ENSG00000213886 ENSG00000226898 ENSMUSG00000035186 ユニプロット O15205 P63072 RefSeq (mRNA) NM_006398 NM_023137 RefSeq（タンパク質） NP_006389 NP_075626 場所（UCSC） 6章: 29.56 – 29.56 Mb 17章: 37.5 – 37.51 Mb PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
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ユビキチンDは、ヒトではUBD遺伝子（FAT10とも呼ばれる）によってコードされるタンパク質である。 ^{[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]} UBDはユビキチン様タンパク質ファミリーのメンバーであり、プロテアソームによる分解の基質を標的とすることでタンパク質の代謝回転に関与する。

構造

UBD遺伝子は、ヒト主要組織適合遺伝子複合体（MHC）クラスI遺伝子座位の6番染色体上に存在し、網内系組織および粘膜関連リンパ系において初めて同定されました。^{[ 5 ] [ 6 ]} コードされるタンパク質の分子量は約18 kDaで、N末端領域とC末端領域はそれぞれユビキチンと29%および36%の配列相同性を有します。他のユビキチン様修飾因子とは異なり、UBDは標的タンパク質への直接結合を可能にする遊離C末端ジグリシンモチーフを有します。

関数

UBDはユビキチンと同様に、タンパク質を共有結合的に修飾し、プロテアソームによる分解へと誘導します。ユビキチン様タンパク質の中で、UBDは非共有結合したタンパク質をプロテアソームへ直接誘導できるという点で独特です。タンパク質分解における役割に加え、UBDは有糸分裂、染色体安定性、アポトーシス、免疫応答の調節にも関与していることが示唆されています。

臨床的意義

UBD 発現の調節異常は、アポトーシスの変化、異常な細胞分裂、染色体不安定性など、腫瘍性形質転換につながるプロセスと関連している。UBD 発現の増加は、肝臓、子宮頸部、卵巣、膵臓、胃、小腸の腺がんなど、いくつかの腫瘍型で報告されているが、甲状腺、前立腺、腎臓のがんでは上方制御はほとんどまたは全く観察されていない。^{[ 8 ]} 肝細胞がんでは、UBD 発現の上昇は、細胞増殖のマーカーである増殖細胞核抗原のレベルの上昇、および実験モデルでの腫瘍増殖の促進と関連している。UBD の過剰発現は、慢性肝疾患におけるマロリー・デンク小体の形成にも関連している。胃がんでは、UBD 発現の増加は、転移、腫瘍のステージ、および予後に相関しており、UBD mRNA およびタンパク質レベルは両方とも独立した予後指標として報告されている。 UBD の発現は、プロモーター内のインターフェロン配列応答要素を介してインターフェロン-γ および腫瘍壊死因子-α によって誘導される可能性があり、これは炎症シグナル伝達と UBD 調節の間に関連があることを示唆しています。

相互作用

UBDはNUB1 ^{[ 9 ]}およびMAD2L1 ^{[ 10 ]}と相互作用することが示されている。

参考文献

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6. Fan W, Cai W, Parimoo S, Schwarz DC, Lennon GG, Weissman SM (1996年8月). 「HLA-F遺伝子座周辺の7つの新規ヒトMHCクラスI領域遺伝子の同定」.免疫遺伝学. 44 (2): 97– 103. doi : 10.1007/BF02660056 . PMID 8662070. S2CID 21628804 .  
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さらに読む

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