USP4

USP4
利用可能な構造 PDB オーソログ検索：PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2Y6E、5CTR
識別子
別名	USP4、UNP、Unph、ユビキチン特異的ペプチダーゼ4
外部ID	OMIM : 603486 ; MGI : 98905 ; HomoloGene : 20716 ; GeneCards : USP4 ; OMA : USP4 - オーソログ
遺伝子の位置（ヒト） 染色体 3番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 3p21.31 開始 49,277,144 bp [ 1 ] 終了 49,340,712 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） 染色体 9番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 9 F2|9 59.25 cM 開始 108,225,052 bp [ 2 ] 終了 108,269,744 bp [ 2 ]
RNA発現パターン Bgee ヒト マウス（相同遺伝子） 最もよく発現している 膵管細胞 内皮細胞 腓腹神経 血液 結腸上皮 単球 扁桃腺 乳首 精子 幽門 最もよく発現している 精細胞 精母細胞 腸絨毛 卵黄嚢 回腸上皮 顆粒球 胚の尾部 網膜の神経層 脳室帯 食道 さらなる参照発現データ BioGPS さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 ペプチダーゼ活性 アデノシン受容体結合 加水分解酵素活性 チオール依存性脱ユビキチン化酵素 金属イオン結合 システイン型ペプチダーゼ活性 同一タンパク質結合 タンパク質結合 細胞構成要素 核 リソソーム 細胞膜 細胞質 細胞質ゾル 生物学的プロセス ユビキチン依存性タンパク質分解プロセス スプライセオソームトリsnRNP複合体の組み立て タンパク質安定性の調節 タンパク質分解 タンパク質ユビキチン化の負の調節 細胞表面へのタンパク質の局在 タンパク質脱ユビキチン化 出典：Amigo / QuickGO
相同遺伝子 種 ヒト マウス エントレズ 7375 22258 アンサンブル ENSG00000114316 ENSMUSG00000032612 ユニプロット Q13107 P35123 RefSeq (mRNA) NM_199443 NM_001251877 NM_003363 NM_011678 NM_001311157 RefSeq（タンパク質） NP_001238806 NP_003354 NP_955475 NP_001298086 NP_035808 場所（UCSC） 3番目の文字: 49.28 – 49.34 MB 9章: 108.23 – 108.27 Mb PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
人間の表示/編集 マウスの表示/編集

ユビキチン特異的プロテアーゼ4（USP4）は、多くのタンパク質基質からユビキチンを切断する酵素です。 ^{[ 5 ]}命名法の標準化以前はUSP4はUNPとして知られており、哺乳類で最初に同定された脱ユビキチン化酵素の1つでした。^{[ 6 ]}マウスとヒトでは、USP4タンパク質は22のエクソン を含む遺伝子によってコードされています。^{[ 7 ] [ 8 ] [ 9 ]}

このタンパク質はシステインペプチダーゼファミリーC19のメンバーです。脱ユビキチン化酵素としては異例なことに、ユビキチン-プロリン結合を切断する能力を有しています。^{[ 10 ]}この特性は酵素活性部位の構造的柔軟性を反映している可能性があり、様々な結合のユビキチン鎖を切断できる能力を説明できるかもしれません。USP4は、NF-κB、TGF-β、Wnt/β-カテニン、p53、スプライソソーム経路など、多くの細胞シグナル伝達経路において重要な機能を果たす基質を持っています。その他の基質には、アデノシンA2A受容体やRo52（TRIM21 ）タンパク質などがあります。

USP4は核質間を輸送するタンパク質であり、機能的な核局在シグナル（NLS）⁷⁶⁶ QPQKKKK ⁷⁷² と核外輸送シグナル（NES）¹³³ VEVYLLELKL ¹⁴²を有する。^{[ 11 ]}これらのシグナルは、USP4の細胞質から核への移行と、核から細胞質への移行をそれぞれ開始する。細胞質USP4プールと核USP4プールの比率は、細胞の種類、細胞周期の段階、およびタンパク質発現レベルによって変化する。^{[ 11 ]}

相互作用

USP4は、腫瘍抑制因子pRbタンパク質およびポケット関連タンパク質p107 およびp130と相互作用することが示されています。^{[ 12 ]}

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000114316 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000032612 – Ensembl、2017年5月
3. 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Gray D (2012). 「第462章」. Rawlings & Salvesen (編).タンパク質分解酵素ハンドブック（第3版）. Elsevier. ISBN 9780123822192。
6. Gupta K, Copeland NG , Gilbert DJ, Jenkins NA, Gray DA (1993年8月). 「Unp、treがん遺伝子に関連するマウス遺伝子」. Oncogene . 8 (8): 2307–10 . PMID 8336951 
7. Di Fruscio M, Gilchrist CA, Baker RT, Gray DA (1998年5月). 「ユビキチン特異的プロテアーゼをコードするマウス遺伝子Unpのゲノム構造」. Biochim. Biophys. Acta . 1398 (1): 9– 17. doi : 10.1016/s0167-4781(98)00035-9 . PMID 9602026 . 
8. Puente XS, Sanchez LM, Overall CM, Lopez-Otin C (2003年7月). 「ヒトとマウスのプロテアーゼ：比較ゲノムアプローチ」Nat Rev Genet . 4 (7): 544– 558. doi : 10.1038/nrg1111 . PMID 12838346 . S2CID 2856065 .  
9. 「Entrez Gene：USP4ユビキチン特異的ペプチダーゼ4（プロトオンコゲン）」。
10. Gilchrist CA, Gray DA, Baker RT (1997年12月). 「ユビキチン-プロリン結合を効率的に切断するユビキチン特異的プロテアーゼ」 . J. Biol. Chem . 272 (51): 32280–5 . doi : 10.1074/jbc.272.51.32280 . hdl : 2292/60433 . PMID 9405433 . 
11. Soboleva, Tatiana A.; Jans, David A.; Johnson-Saliba, Melanie; Baker, Rohan T. (2004-10-18). 「マウス発癌性UNP/USP4脱ユビキチン化酵素の核-細胞質間輸送」 . Journal of Biological Chemistry . 280 (1): 745– 752. doi : 10.1074/jbc.m401394200 . ISSN 0021-9258 . PMID 15494318 .  
12. Blanchette, Paola; Gilchrist, Catherine A; Baker, Rohan T; Gray, Douglas A (2001年9月). 「ユビキチン特異的プロテアーゼUNPとポケットタンパク質pRb、p107、p130との関連」 . Oncogene . 20 (39): 5533– 5537. doi : 10.1038/sj.onc.1204823 . ISSN 0950-9232 . PMID 11571651 .  

さらに詳しい情報

• D'Andrea A, Pellman D (1999). 「脱ユビキチン化酵素：新しいクラスの生物学的調節因子」. Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol . 33 (5): 337– 352. doi : 10.1080 / 10409239891204251 . PMID  9827704
• Gray DA, Inazawa J, Gupta K, et al. (1995). 「ヒト肺腫瘍における3p21.3のプロトオンコゲンであるUnphの発現上昇」Oncogene . 10 (11): 2179–83 . PMID  7784062 .
• 丸山 憲治, 菅野 誠 (1994). 「オリゴキャッピング：真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡便法」.遺伝子. 138 ( 1–2 ): 171–174 . doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID  8125298 .
• Gupta K, Chevrette M, Gray DA (1994). 「Unpプロトオンコゲンは核タンパク質をコードする」. Oncogene . 9 (6): 1729–31 . PMID  8183569 .
• 鈴木雄三、中川吉智、丸山健、他 (1997). 「全長エンリッチドcDNAライブラリーおよび5'末端エンリッチドcDNAライブラリーの構築と特性解析」. Gene . 200 ( 1– 2): 149– 156. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID  9373149 .
• Di Donato F、Chan EK、Askanase AD 他（2001年）。 「52 kDa SSA/Ro と脱ユビキチン化酵素 UnpEL の間の相互作用: 機能への手がかり」。内部。 Ｊ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．セルバイオル。33 (9): 924–934。土井: 10.1016/S1357-2725(01)00055-3。PMID  11461834。
• Blanchette P, Gilchrist CA, Baker RT, Gray DA (2001). 「ユビキチン特異的プロテアーゼUNPとポケットタンパク質pRb、p107、p130との関連性」 . Oncogene . 20 (39): 5533– 5537. doi : 10.1038/sj.onc.1204823 . PMID  11571651 .
• DeSalle LM, Latres E, Lin D, et al. (2001). 「脱ユビキチン化酵素Unpは網膜芽細胞腫タンパク質と相互作用する」 . Oncogene . 20 (39): 5538– 5542. doi : 10.1038/sj.onc.1204824 . PMID  11571652 .
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」 . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 16903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大：哺乳類遺伝子コレクション（MGC）」 . Genome Res . 14 (10B): 2121– 2127. doi : 10.1101 /gr.2596504 . PMC  528928. PMID 15489334  .
• 和田 和人、丹治 和人、上谷 哲也 (2006) 「発がん性タンパク質UnpEL/Usp4は、イソペプチダーゼ活性によりRo52を脱ユビキチン化する」。生化学。生物物理学。解像度共通。339 (3): 731–736。土井: 10.1016/j.bbrc.2005.11.076。PMID  16316627。
• 和田和也、上谷哲也 (2006) 「UnpEL/Usp4 は Ro52 によってユビキチン化され、それ自体で脱ユビキチン化されます。」生化学。生物物理学。解像度共通。342 (1): 253–258。土井: 10.1016/j.bbrc.2006.01.144。PMID  16472766。

外部リンク

• PDBe-KBのUniProt : Q13107（ユビキチンカルボキシル末端加水分解酵素4）のPDBで利用可能なすべての構造情報の概要