リポカリン1
ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
LCN1
利用可能な構造
PDBヒトUniProt検索：PDBe RCSB
識別子
エイリアスLCN1、PMFA、TLC、TP、VEGP、リポカリン1
外部IDオミム: 151675;ホモロジーン: 48099;ジーンカード：LCN1; OMA :LCN1 - オルソログ
オーソログ
種人間ねずみ
エントレズ

3933

該当なし

アンサンブル

ENSG00000160349

該当なし

ユニプロット

P31025

該当なし

RefSeq (mRNA)

NM_001252617
NM_001252618
NM_001252619
NM_002297

該当なし

RefSeq（タンパク質）

該当なし

場所（UCSC）9章: 135.52 – 135.53 Mb該当なし
PubMed検索[2]該当なし
ウィキデータ
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リポカリン-1は、ヒトではLCN1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[3] [4]

この遺伝子によってコードされるタンパク質はリポカリンファミリーに属します。リポカリンは細胞外タンパク質群であり、その構造内に親油性物質を封じ込めることで溶媒との接触を最小限に抑えます。このタンパク質は疎水性リガンドと結合し、システインプロテアーゼを阻害する可能性があります。また、味覚受容にも関与している可能性があります。[4]

構造

LCN1のNMR構造

タンパク質は、リガンドの結合部位として機能するバレル構造を形成する 8 つの逆平行ベータシートによってリポカリン ファミリーに分類されます。

関数

リポカリン-1（LCN1）は、亜鉛イオンや塩化物イオンに加え、様々な親油性分子と結合することができます。この特性から、LCN1の主な機能は、潜在的に有害な脂質や親油性分子と結合して体内から除去することであると考えられています。LCN1-リガンド複合体は、リポカリン-1相互作用膜受容体（LIMR）を介して細胞内に取り込まれ、結合した分子は細胞内で安全に分解されます。[5]この分子回収プロセスは、フェロモンシグナル伝達、免疫調節、炎症、解毒、組織発達、アポトーシスなど、様々なプロセスに影響を与える可能性があります。

LCN1はシスタチンと3つの配列モチーフを共有しており、これによりシスタチンと同様にシステインプロテアーゼ阻害剤として作用することが可能となっている。これらのドメインはパパインと特異的に結合することが示されている。[6] [7]

LCN1は涙液膜の脂質層を安定化させる役割も果たしているが、その詳細はまだ十分に解明されていない。[8] [9]

歴史

リポカリン-1は当初、外分泌腺でのみ産生されると考えられていましたが、下垂体の副腎皮質刺激ホルモン分泌細胞でも発見されています。[10]

別名：ヒト涙液プレアルブミン、涙液リポカリン、フォン・エブナー腺タンパク質

臨床

細胞が炎症、感染などによりストレスを受けると、リポカリン1（LCN1）の産生レベルが上昇します。このため、LCN1は様々な疾患の非侵襲的なバイオマーカーとなる可能性があります。この可能性は体外受精 胚盤胞の研究で示されており、LCN1の上昇は胚盤胞における異数性を示唆していました。[11]

参考文献

  1. ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000160349 – Ensembl、2017年5月
  2. ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  3. ^ Lassagne H, Ressot C, Mattei MG, Gachon AM (1993年10月). 「in situハイブリダイゼーションによるヒト涙液リポカリン遺伝子（LCN1）の9q34への割り当て」. Genomics . 18 (1): 160–1 . doi :10.1006/geno.1993.1444. PMID  8276406.
  4. ^ ab 「Entrez Gene: LCN1 リポカリン 1 (涙液プレアルブミン)」.
  5. ^ Wojnar P, Lechner M, Redl B (2003年5月). 「リポカリン相互作用膜受容体発現のアンチセンスダウンレギュレーションはヒトNT2細胞におけるリポカリン-1の細胞内移行を阻害する」. The Journal of Biological Chemistry . 278 (18): 16209–15 . doi : 10.1074/jbc.M210922200 . PMID  12591932. S2CID  24433456.
  6. ^ van't Hof W, Blankenvoorde MF, Veerman EC, Amerongen AV (1997年1月). 「唾液リポカリンであるフォン・エブナー腺タンパク質はシステインプロテアーゼ阻害剤である」. The Journal of Biological Chemistry . 272 (3): 1837–41 . doi : 10.1074/jbc.272.3.1837 . PMID  8999869. S2CID  2650128.
  7. ^ Wojnar P, van't Hof W, Merschak P, Lechner M, Redl B (2001年10月). 「組換えヒト涙液リポカリン/フォン・エブナー腺タンパク質のN末端部分は、シスタチン様配列モチーフ全体の存在に応じてシステインプロテアーゼ阻害を付与する」. Biological Chemistry . 382 (10): 1515–20 . doi :10.1515/BC.2001.186. PMID  11727836. S2CID  44411516.
  8. ^ Nagyová B, Tiffany JM (1999年7月). 「ヒトの涙液の表面張力を左右する成分」Current Eye Research . 19 (1): 4– 11. doi :10.1076/ceyr.19.1.4.5341. PMID  10415451.
  9. ^ サーレン・セペラ H、ジャウヒアイネン M、テルボ TM、レッドル B、キヌネン PK、ホロパイネン JM (2005 年 10 月)。 「精製涙液リポカリンと脂質膜との相互作用」。調査眼科学と視覚科学。46 (10): 3649–56 .土井:10.1167/iovs.05-0176。PMID  16186346。
  10. ^ Wojnar P, Dirnhofer S, Ladurner P, Berger P, Redl B (2002年3月). 「ヒトリポカリン-1は親油性化合物の生理学的スカベンジャーであり、下垂体の副腎皮質刺激ホルモン産生細胞によって産生される」. The Journal of Histochemistry and Cytochemistry . 50 (3): 433–5 . doi : 10.1177/002215540205000314 . PMID  11850445. S2CID  26078329.
  11. ^ McReynolds S, Vanderlinden L, Stevens J, Hansen K, Schoolcraft WB, Katz-Jaffe MG (2011年6月). 「リポカリン-1：非侵襲性異数性スクリーニングにおける潜在的マーカー」. Fertility and Sterility . 95 (8): 2631–3 . doi : 10.1016/j.fertnstert.2011.01.141 . PMID  21324447.

さらに読む

  • Glasgow BJ, Abduragimov AR, Gasymov OK, Yusifov TN (2002). 「涙液リポカリン：構造、機能、および分子作用メカニズム」.涙腺、涙液膜、およびドライアイ症候群 3.実験医学生物学の進歩. 第506巻. pp.  555– 65. doi :10.1007/978-1-4615-0717-8_78. ISBN 978-1-4613-5208-2. PMID  12613960。
  • Redl B, Holzfeind P, Lottspeich F (1992年10月). 「cDNAクローニングとシークエンシングにより、ヒト涙液プレアルブミンが親油性リガンドキャリアタンパク質スーパーファミリーの一員であることが明らかになった」The Journal of Biological Chemistry . 267 (28): 20282–7 . doi : 10.1016/S0021-9258(19)88698-2 . PMID  1400345.
  • Lassagne H, Nguyen VC, Mattei MG, Gachon AM (1995). 「LCN1のヒト9番染色体への割り当てが確認された」. Cytogenetics and Cell Genetics . 71 (1): 104. doi : 10.1159/000134073 . PMID  7606920.
  • Bläker M, Kock K, Ahlers C, Buck F, Schmale H (1993年2月). 「舌唾液腺で高発現するリポカリンスーパーファミリーに属するヒトフォン・エブナー腺タンパク質の分子クローニング」. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - 遺伝子構造と発現. 1172 ( 1–2 ): 131–7 . doi :10.1016/0167-4781(93)90279-m. PMID  7679926.
  • Holzfeind P, Redl B (1994年2月). 「ヒトリポカリン涙液プレアルブミンをコードする遺伝子の構造的構成と大腸菌における組換えタンパク質の合成」. Gene . 139 (2): 177–83 . doi :10.1016/0378-1119(94)90752-8. PMID  8112601.
  • Lassagne H, Gachon AM (1993年5月). 「涙液中に分泌されるヒト涙液リポカリンのクローニング」. Experimental Eye Research . 56 (5): 605–9 . doi :10.1006/exer.1993.1075. PMID  8500570.
  • Holzfeind P、Mercchak P、Rogatsch H、Culig Z、Feichtinger H、Klocker H、Redl B (1996 年 10 月)。 「ヒト前立腺における涙液リポカリン/フォンエブナー腺タンパク質の遺伝子の発現」。FEBS レター。395 ( 2–3 ): 95– 8.土井: 10.1016/0014-5793(96)01008-3。PMID  8898072。S2CID 22843813  。
  • van't Hof W, Blankenvoorde MF, Veerman EC, Amerongen AV (1997年1月). 「唾液リポカリンであるフォン・エブナー腺タンパク質はシステインプロテイナーゼ阻害剤である」. The Journal of Biological Chemistry . 272 (3): 1837–41 . doi : 10.1074/jbc.272.3.1837 . PMID  8999869.
  • Redl B, Wojnar P, Ellemunter H, Feichtinger H (1998年9月). 「ヒト気管支粘膜腺におけるリポカリンの同定と嚢胞性線維症におけるその分泌促進」.実験室調査; 技術的方法と病理学ジャーナル. 78 (9): 1121–9 . PMID  9759656.
  • Gasymov OK, Abduragimov AR, Yusifov TN, Glasgow BJ (1999年11月). 「涙液リポカリンとリゾチームおよびラクトフェリンとの相互作用」.生化学および生物理学的研究コミュニケーション. 265 (2): 322–5 . doi :10.1006/bbrc.1999.1668. PMID  10558865.
  • Wojnar P, Lechner M, Merschak P, Redl B (2001年6月). 「ファージディスプレイ法を用いた新規リポカリン-1相互作用ヒト細胞膜受容体の分子クローニング」. The Journal of Biological Chemistry . 276 (23): 20206–12 . doi : 10.1074/jbc.M101762200 . PMID  11287427.
  • Wojnar P, van't Hof W, Merschak P, Lechner M, Redl B (2001年10月). 「組換えヒト涙液リポカリン/フォン・エブナー腺タンパク質のN末端部分は、シスタチン様配列モチーフ全体の存在に依存してシステインプロテアーゼ阻害を付与する」. Biological Chemistry . 382 (10): 1515–20 . doi :10.1515/BC.2001.186. PMID  11727836. S2CID  44411516.
  • Wojnar P, Dirnhofer S, Ladurner P, Berger P, Redl B (2002年3月). 「ヒトリポカリン-1は脂溶性化合物の生理学的スカベンジャーであり、下垂体の副腎皮質刺激ホルモン産生細胞によって産生される」. The Journal of Histochemistry and Cytochemistry . 50 (3): 433–5 . doi : 10.1177/002215540205000314 . PMID  11850445.
  • Wojnar P, Lechner M, Redl B (2003年5月). 「リポカリン相互作用膜受容体発現のアンチセンスダウンレギュレーションはヒトNT2細胞におけるリポカリン-1の細胞内移行を阻害する」. The Journal of Biological Chemistry . 278 (18): 16209–15 . doi : 10.1074/jbc.M210922200 . PMID  12591932.
  • Glasgow BJ, Abduragimov AR, Gassymov OK, Yusifov TN, Ruth EC, Faull KF ​​(2002). 「ヒト涙液中のリポカリン分画と関連するビタミンE」.涙腺、涙液膜、およびドライアイ症候群 3.実験医学生物学の進歩. 第506巻. pp.  567– 72. doi :10.1007/978-1-4615-0717-8_79. ISBN 978-1-4613-5208-2. PMID  12613961。
  • Tiffany JM, Nagyová B (2002). 「涙液の物理的特性を決定するリポカリンの役割」.涙腺、涙液膜、およびドライアイ症候群 3.実験医学生物学の進歩. 第506巻. pp.  581–5 . doi :10.1007/978-1-4615-0717-8_81. ISBN 978-1-4613-5208-2. PMID  12613963。
  • Gasymov OK, Abduragimov AR, Yusifov TN, Glasgow BJ (2004年10月). 「インターストランドループCDとEFはpH依存的に涙液リポカリンにおける脂肪酸リガンド結合を制御するゲートとして機能する」.生化学. 43 (40): 12894–904 . doi :10.1021/bi049076o. PMID  15461462.
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