ヤサラ

もう一つの科学的な人工現実アプリケーション
原作者エルマー・クリーガー
ヤコバス・ファン・ミール
開発者YASARA Biosciences
WHAT IF Foundation
Spronk NMR Consultancy
初回リリース1993年11月; 32年前 (1993-11
安定版リリース
2024年10月5日(日)
書かれたCアセンブリPython
オペレーティング·システムWindowsLinuxOS X
プラットフォームx86
入手可能な英語
タイプ分子モデリング
ライセンス基本構造作業のための独自の無料バージョン
Webサイトwww.yasara.org

Yet Another Scientific Artificial Reality Application ( YASARA ) は、分子の可視化、モデリング、ダイナミクス解析のためのコンピュータプログラムです。このソフトウェアは、多数の科学論文で言及されていることからもわかるように、科学的に幅広い用途に使用されています。[1] YASARAの無料版[2]は、バイオインフォマティクス教育に最適です。このソフトウェアを使用した、無料で利用できるバイオインフォマティクス講座が数多く存在します。

YASARA を使用して教育課題に取り組む学生たち。

一連の例については、分子・生体分子情報科学センター(CMBI)の教育ページを参照してください。 [3]

  • Krieger E, Koraimann G, Vriend G (2002年5月). 「自己パラメータ化力場YASARA NOVAを用いた比較モデルの精度向上」. Proteins . 47 (3): 393– 402. doi : 10.1002/prot.10104 . PMID  11948792.
  • モデリング:Krieger E, Vriend G (2002年2月). 「Models@Home:スクリーンセーバーベースのアプローチを用いたバイオインフォマティクスにおける分散コンピューティング」.バイオインフォマティクス. 18 (2): 315–8 . doi : 10.1093/bioinformatics/18.2.315 . PMID  11847079.
  • ダイナミクス:Krieger E, Darden T, Nabuurs SB, Finkelstein A, Vriend G (2004年12月). 「経験的エネルギー関数の最適利用:結晶空間における力場パラメータ化」. Proteins . 57 (4): 678–83 . CiteSeerX 10.1.1.472.6529 . doi :10.1002/prot.20251. PMID  15390263.
     
YASARA を使用してリガンドをドッキングする方法を学習します。

参照

参考文献

  1. ^ YASARAの科学論文
  2. ^ YASARAビュー
  3. ^ CMBI教育ページ

公式サイト


「https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=YASARA&oldid=1260189795」より取得