ジゴキシゲニン

ジゴキシゲニン
名前
IUPAC名
3β,12β,14-トリヒドロキシ-5β-カルド-20(22)-エノリド
IUPAC体系名
4-[(1 R ,3a S ,3b R ,5a R ,7 S ,9a S ,9b S ,11 R ,11a S )-3a,7,11-トリヒドロキシ-9a,11a-ジメチルヘキサデカヒドロ-1 H -シクロペンタ[ a ]フェナントレン-1-イル]フラン-2(5 H )-オン
識別子
  • 1672-46-4 チェックはい
チェビ
  • チェビ:42098 チェックはい
チェムブル
  • ChEMBL1153 チェックはい
ケムスパイダー
  • 14728 チェックはい
ECHA 情報カード 100.015.279
  • 15478
ユニイ
  • NQ1SX9LNAU チェックはい
  • DTXSID6051778
  • InChI=1S/C23H34O5/c1-21-7-5-15(24)10-14(21)3-4-17-18(21)11-19(25)22(2)16(6-8-23(17,22)27)13-9-20(26)28-12-13/h9,14-19,24-25,27H,3-8,10-12H2,1-2H3/t14-,15+,16-,17-,18+,19-,21+,22+,23+/m1/s1 チェックはい
    キー: SHIBSTMRCDJXLN-KCZCNTNESA-N チェックはい
  • InChI=1/C23H34O5/c1-21-7-5-15(24)10-14(21)3-4-17-18(21)11-19(25)22(2)16(6-8-23(17,22)27)13-9- 20(26)28-12-13/h9,14-19,24-25,27H,3-8,10-12H2,1-2H3/t14-,15+,16-,17-,18+,19-,21+,22+,23+/m1/s1
    キー: SHIBSTMRCDJXLN-KCZCNTNEBN
プロパティ
C 23 H 34 O 5
モル質量 390.51 g/モル
ログP 2.57510 [1]
特に記載がない限り、データは標準状態(25 °C [77 °F]、100 kPa)における材料のものです。
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化合物

ジゴキシゲニンDIG)は、ジギタリス・プルプレアジギタリス・オリエンタリス、ジギタリスラナタ(ジギタリス属)の花と葉にのみ含まれるステロイドであり、糖と結合して 配糖体(例:ジゴキシンラナトシドC)を形成します。[2]

バイオテクノロジーにおける用途

ジゴキシゲニンは、抗原性の高い分子であるハプテンであり、 2,4-ジニトロフェノールビオチンフルオレセインなどの他の一般的なハプテンと同様に、多くの分子生物学アプリケーションで使用されています。通常、ジゴキシゲニンは化学的に生体分子(タンパク質、核酸)に導入(結合)され、その後のアッセイで検出されます。ジゴキシゲニンと抗体の相互作用のK dは約12 nMと推定されています[3] (ビオチンとストレプトアビジンの相互作用のK dは約0.1 pMです[4])。

DIG結合タンパク質

ティンバーグらはDIGに結合する人工タンパク質を設計した。彼らの最も優れた結合タンパク質であるDIG10.3は、141アミノ酸からなるタンパク質で、解離定数(K d)541(+/- 193)pMでDIGに結合する。[5]

高い親和性と特異性を有する抗ジゴキシゲニン抗体は、様々な生物学的免疫測定法(ELISAなど)に用いられています。抗体は、可視化と検出のために、色素、酵素、または蛍光物質で直接または二次的に標識されます。

このように、ジゴキシゲニンは汎用的な免疫タグであり、特にin situハイブリダイゼーションの標準的な免疫組織化学マーカーである。[6] [7] この場合、ジゴキシゲニンは単一種のRNAヌクレオシド三リン酸(典型的にはウリジン)に結合され、これが細胞機構によって合成されるRNA(「リボプローブ」)に組み込まれる。

これにより、次のことが可能になります。

  • 植物中の核酸を検出するための高感度非放射性in situハイブリダイゼーションプローブ。1μgのプラスミドDNAを検出できる。[8]
  • ペプチド-DIG複合体、すなわち非常に感度の高い化学発光免疫測定法によるブラジキニン測定。[9]
  • 競合免疫測定用の蛍光およびDIG標識トレーサー、すなわち不整脈治療薬であるジゴキシンを0.2 ng mL −1まで検出するためのもの。[10]
  • ジゴキシゲニンは糖と結合して、 生物系におけるグリコシル化現象を研究することができる[11] 。

参照

参考文献

  1. ^ 「ジゴキシゲニン」.材料データ安全シート. ChemSrc.
  2. ^ Polya G (2003).植物生理活性化合物の生化学的標的. ニューヨーク: CRC Press. ISBN 978-0-415-30829-8
  3. ^ Tetin SY, Matayoshi ED (2002年8月). 「抗体親和性の測定と単一分子レベルでの免疫アッセイ」.分析生化学. 307 (1): 84– 91. doi :10.1016/S0003-2697(02)00011-8. PMID  12137783.
  4. ^ Duan X (2012). 「シリコンナノワイヤバイオセンサーを用いたタンパク質相互作用の親和性と速度論の定量化」Nature Nanotechnology 7 (6): 401– 407. Bibcode :2012NatNa...7..401D. doi :10.1038/nnano.2012.82. PMC 4180882. PMID 22635097  . 
  5. ^ Tinberg CE, Khare SD, Dou J, Doyle L, Nelson JW, Schena A, Jankowski W, Kalodimos CG, Johnsson K, Stoddard BL, Baker D (2013年9月). 「高親和性と選択性を持つリガンド結合タンパク質の計算論的設計」. Nature . 501 (7466): 212– 216. Bibcode :2013Natur.501..212T. doi :10.1038/nature12443. PMC 3898436. PMID 24005320  . 
  6. ^ Aisel D、Grünewald-Janho S、Krushen B、編。 (2002年)。非放射性in situハイブリダイゼーションのための DIG アプリケーションマニュアル(第 3 版)。ペンツベルグ: Roche Diagnostics。
  7. ^ Hauptmann G, Gerster T (1994年8月). 「脊椎動物およびショウジョウバエ胚に対する2色全載in situハイブリダイゼーション」. Trends in Genetics . 10 (8): 266. doi :10.1016/0168-9525(90)90008-T. PMID  7940754.
  8. ^ Hart SM, Basu C (2009年4月). 「シロイヌナズナにおける遺伝子検出のためのジゴキシゲニンベースの免疫アッセイシステムの最適化」. Journal of Biomolecular Techniques . 20 (2): 96– 100. PMC 2685603. PMID  19503620. 
  9. ^ Décarie A, Drapeau G, Closset J, Couture R, Adam A (1994). 「ジゴキシゲニン標識ペプチドの開発:炎症組織におけるブラジキニンの化学発光酵素免疫測定への応用」.ペプチド. 15 (3): 511–8 . doi :10.1016/0196-9781(94)90214-3. PMID  7937327. S2CID  19210640.
  10. ^ Mayilo S, Ehlers B, Wunderlich M, Klar TA, Josel HP, Heindl D, Nichtl A, Kürzinger K, Feldmann J (2009年7月). 「金ナノ粒子による蛍光消光に基づく競合的均一ジゴキシゲニン免疫アッセイ」. Analytica Chimica Acta . 646 ( 1–2 ): 119–22 . Bibcode :2009AcAC..646..119M. doi :10.1016/j.aca.2009.05.023. PMID  19523564.
  11. ^ Goodarzi MT, Rafiq M, Turner G (1995年5月). 「ジゴキシゲニン標識レクチンを用いた改良型マルチウェル免疫アッセイによる精製糖タンパク質のグリコシル化研究」.生化学会誌. 23 (2): 168S. doi :10.1042/bst023168s. PMID  7672194.
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