ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
| DTNB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | DTNB、ジストロブレビンベータ |
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| 外部ID | オミム:602415; MGI : 1203728;ホモロジーン: 74875;ジーンカード:DTNB; OMA :DTNB - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | 12番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 12 A1.1|12 1.88 cM | 始める | 3,622,381 bp [2] |
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| 終わり | 3,831,796 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - C1セグメント
- 右前頭葉
- 前頭前皮質
- 帯状回
- 前帯状皮質
- ブロードマン領域9
- 扁桃体
- ブロードマン領域10
- 側坐核
- 唾液腺
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| | 上位の表現 | - 上前頭回
- 吻側回遊流
- 海馬歯状回顆粒細胞
- 網膜の神経層
- 右腎臓
- 性器結節
- 一次視覚野
- 涙腺
- 顆粒球
- 精細管
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS | |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | NM_001256303 NM_001256304 NM_001256308 NM_021907 NM_033147
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NM_001162465 NM_007886 NM_001355528 NM_001374710 |
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| RefSeq(タンパク質) | NP_001243232 NP_001243233 NP_001243237 NP_001307861 NP_001307862
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| 場所(UCSC) | 2章: 25.38 – 25.67 Mb | 12章: 3.62 – 3.83 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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ジストロブレビンβはヒトではDTNB遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5]
関数
この遺伝子は、ジストロフィン関連タンパク質複合体(DPC )の構成要素であるジストロブレビンβをコードしています。DPCは、ジストロフィンと、ジストログリカン、サルコグリカン、シントロフィン、ジストロブレビンαおよびβを含む複数の膜タンパク質(内在性および表在性)で構成されています。DPCは筋鞘に局在し、その破綻は様々な形態の筋ジストロフィーと関連しています。ジストロブレビンβは、シントロフィンおよびジストロフィンのDP71短縮型と相互作用すると考えられています。異なるアイソフォームをコードする選択的スプライシング転写バリアントが同定されています。[6]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000138101 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000071454 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ Blake DJ, Nawrotzki R, Loh NY, Górecki DC, Davies KE (1998年1月). 「β-ジストロブレビン、ジストロフィン関連タンパク質ファミリーの一員」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 95 (1): 241–6 . Bibcode :1998PNAS...95..241B. doi : 10.1073/pnas.95.1.241 . PMC 18188. PMID 9419360 .
- ^ 「Entrez Gene: DTNB ジストロブレビン、ベータ」。
さらに読む
- Blake DJ, Hawkes R, Benson MA, Beesley PW (1999). 「ニューロンとグリアでは異なるジストロフィン様複合体が発現している」. J. Cell Biol . 147 (3): 645–58 . doi :10.1083/jcb.147.3.645. PMC 2151186. PMID 10545507 .
- Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップの構築に向けて」Nature . 437 (7062): 1173–8 . Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- Yu W, Andersson B, Worley KC, et al. (1997). 「大規模連結cDNAシークエンシング」Genome Res . 7 (4): 353–8 . doi :10.1101/gr.7.4.353. PMC 139146 . PMID 9110174.
- Piluso G, Mirabella M, Ricci E, et al. (2000). 「神経細胞に局在する2つの新規ジストロフィン結合タンパク質、γ1-およびγ2-シントロフィン」J. Biol. Chem . 275 (21): 15851–60 . doi : 10.1074/jbc.M000439200 . PMID 10747910.
- Puca AA, Nigro V, Piluso G, et al. (1998). 「ジストロブレビン遺伝子ファミリーの新規メンバーの同定と特性解析」FEBS Lett . 425 (1): 7– 13. doi :10.1016/S0014-5793(98)00097-0. PMID 9540997. S2CID 31934419.
- Macioce P, Gambara G, Bernassola M, et al. (2003). 「β-ジストロブレビンは脳内のキネシン重鎖と直接相互作用する」J. Cell Sci . 116 (Pt 23): 4847–56 . doi :10.1242/jcs.00805. PMID 14600269. S2CID 27097248.
- 鈴木雄三、中川吉智、丸山健、他 (1997). 「全長エンリッチドcDNAライブラリーおよび5'末端エンリッチドcDNAライブラリーの構築と特性解析」. Gene . 200 ( 1–2 ): 149–56 . doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- Straub V, Campbell KP (1997). 「筋ジストロフィーとジストロフィン糖タンパク質複合体」. Curr. Opin. Neurol . 10 (2): 168–75 . doi : 10.1097/00019052-199704000-00016 . PMID 9146999.
- Nazarian R, Starcevic M, Spencer MJ, Dell'Angelica EC (2006). 「BLOC-1(リソソーム関連オルガネラ生合成複合体-1)のジスビンディンサブユニットのジストロブレビン結合タンパク質としての再研究」Biochem. J. 395 ( 3): 587–98 . doi :10.1042/BJ20051965. PMC 1462696. PMID 16448387 .
- Gudbjartsson DF, Walters GB, Thorleifsson G, et al. (2008). 「成人の身長の多様性に影響を与える多くの配列変異」Nat. Genet . 40 (5): 609–15 . doi :10.1038/ng.122. PMID 18391951. S2CID 3005450.
- 太田 剛志、鈴木 雄志、西川 剛志、他 (2004). 「21,243個の完全長ヒトcDNAの完全配列決定と特性解析」Nat. Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039.
- Albrecht DE, Froehner SC (2004). 「DAMAGE:ジストロフィン複合体における新規α-ジストロブレビン関連MAGEタンパク質」J. Biol. Chem . 279 (8): 7014–23 . doi : 10.1074/jbc.M312205200 . PMID 14623885.
- Peters MF, O'Brien KF, Sadoulet-Puccio HM, et al. (1997). 「ジストロフィンファミリーの新メンバー、β-ジストロブレビン。同定、クローニング、およびタンパク質との関連性」J. Biol. Chem . 272 (50): 31561–9 . doi : 10.1074/jbc.272.50.31561 . PMID 9395493.
- 丸山 憲治, 菅野 誠 (1994). 「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡便法」.遺伝子. 138 ( 1–2 ): 171–4 . doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, et al. (1996). 「改良されたショットガンライブラリー構築のための「ダブルアダプター」法」Anal. Biochem . 236 (1): 107–13 . doi :10.1006/abio.1996.0138. PMID 8619474.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2002). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- Benson MA, Newey SE, Martin-Rendon E, et al. (2001). 「筋肉および脳内のジストロブレビンと相互作用する新規コイルドコイル含有タンパク質、ジスビンディン」J. Biol. Chem . 276 (26): 24232–41 . doi : 10.1074/jbc.M010418200 . PMID 11316798.
- Hillman RT, Green RE, Brenner SE (2004). 「RNAサーベイランスの過小評価された役割」. Genome Biol . 5 (2): R8. doi : 10.1186/gb-2004-5-2-r8 . PMC 395752. PMID 14759258 .
この記事には、パブリック ドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。