電気泳動図（エレクトロフォレトグラム、シーケンシングクロマトグラム、EPG、Eグラムとも呼ばれる）は、主に法医学生物学、分子生物学、生化学の分野で分析技術として電気泳動が使用されたときに作成される記録またはチャートである。[1]この手法では、特定の時間と様々な光の波長における蛍光強度を表すデータポイントをプロットして、DNAプロファイルを表す。[2] [ページが必要]
遺伝学の分野では、電気泳動図は DNA 断片のサイズをプロットしたもので、通常はDNA シーケンシングなどの遺伝子型判定に使用されます。[3]データは、x 軸に塩基対 (bps) で示される時間、y 軸に蛍光強度でプロットされます。このようなプロットは、多くの場合、キャピラリー電気泳動 (CE) と組み合わせた自動DNA シーケンサーなどの機器を使用して作成されます。このような電気泳動図は、サンプルを内部サイズ標準および同じサイズ標準を使用した対立遺伝子ラダーデータと比較することにより、DNA 配列の遺伝子型、または特定の DNA 断片の長さや特定の遺伝子座の短いタンデムリピート (STR) の数に基づく遺伝子型を決定するために使用できます。[2] [ページが必要]これらの遺伝子型は、次の目的で使用できます。
参照
参考文献
- ^ Karabiber, F (2013). 「電気泳動図解析への応用における新たな改良点を備えたピークアライメントアルゴリズム」. Journal of Bioinformatics and Computational Biology . 11 (5): 1350011. doi :10.1142/S021972001350011X. PMC 4529286. PMID 24131055 .
- ^ ab Butler, JM (2015).法医学DNAタイピングの高度なトピック：解釈. エルゼビア.。
- ^ Schwartz, H.; Guttman, A. (1995).キャピラリー電気泳動によるDNAの分離. Beckman.
外部リンク
- PHPH — 電気泳動図の品質分析のためのウェブベースのツール
- GeneScanソフトウェアの異なるバージョンによって報告される電気泳動図のピーク高さの系統的な違い
- DYS464 電気泳動図の解釈と画像との不一致
