リン酸キャリアタンパク質、ミトコンドリア

ミトコンドリア膜タンパク質

SLC25A3
識別子
エイリアスSLC25A3、PHC、PTP、OK/SW-cl.48、溶質キャリアファミリー25メンバー3
外部IDオミム:600370; MGI : 1353498;ホモロジーン: 37649;ジーンカード:SLC25A3; OMA :SLC25A3 - オルソログ
オーソログ
人間ねずみ
エントレズ
アンサンブル
ユニプロット
RefSeq (mRNA)

NM_213612
NM_002635
NM_005888
NM_213611

NM_133668

RefSeq(タンパク質)

NP_002626
NP_005879
NP_998776
NP_005879.1

NP_598429

場所(UCSC)12章: 98.59 – 98.61 Mb10番目の文字: 90.95 – 90.96 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
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ミトコンドリアリン酸キャリアタンパク質は、ヒトではSLC25A3遺伝子によってコードされているタンパク質である[5] [6]コードされているタンパク質は、ミトコンドリア内膜に位置する膜貫通タンパク質であり、酸化的リン酸化を目的としてリン酸イオン輸送触媒する[7] [8]ヒト細胞で発現しているこの遺伝子には、構造と機能がわずかに異なる2つの重要なアイソフォームがある[9]この遺伝子の変異は、乳酸アシドーシス新生児低血圧肥大型心筋症、および生後1年以内の死亡を症状とする致命的な酸化リン酸化障害であるミトコンドリアリン酸キャリア欠損症(MPCD)を引き起こす可能性がある。 [7] [8]

構造

SLC25A3遺伝子は、 12 番染色体の q 腕の23.1 番位置にあり、8,376 塩基対に及んでいます。[6]この遺伝子には 9 つのエクソンがあり、362 個のアミノ酸からなる 40.1 kDa のタンパク質を生成します[10] [11] [9]コードされているタンパク質 (PHC) は、ミトコンドリア内膜に位置する複数回膜貫通型タンパク質です。6 つの膜貫通セグメントが含まれ、大きな膜外ループを形成しています。[7] [8] [12]このタンパク質のN 末端領域とC 末端領域は両方とも細胞質に向かって突出しています。PHC には、ミトコンドリアキャリア ファミリーの他の特徴付けられたメンバーに見られるセグメントと関連した 3 つの関連セグメントが縦列に並んでいます[6]このタンパク質には、13 個のアミノ酸が異なる PHC-A と PHC-B の 2 つの転写バリアントがあります。[12]アイソフォームAは42個のアミノ酸を含み、アイソフォームBは41個のアミノ酸を含む。試験管内試験では、これらのアイソフォームは基質親和性と輸送速度が異なる。[13] [9]

関数

コードされたタンパク質(PHC)は、プロトン共輸送または水酸化イオンとの交換によって、細胞質からミトコンドリアマトリックスへのリン酸の輸送を触媒する。[6]酸化的リン酸化の最終段階では、このタンパク質がミトコンドリア内膜を介したリン酸イオンとプロトンの取り込みを触媒する。[9]酸化的リン酸化のための無機リン酸の利用可能性は、主にPHCの活性に依存する。[13]酸化的リン酸化に大きな影響を与えるには、PHCの枯渇が85%を超える必要がある。[14 ]このタンパク質は、ミトコンドリア膜透過性遷移孔(mPTP)の調節に関与している可能性がある。[7] [8]

臨床的意義

この遺伝子の変異は、酸化リン酸化の致死的な疾患であるミトコンドリアリン酸キャリア欠損症(MPCD)を引き起こす可能性があります。症状には乳酸アシドーシス、肥大型心筋症、新生児低血圧などがあり、罹患した患者は生後1年以内に死亡します。[7] [8]

この遺伝子のアイソフォームAは心臓膵臓骨格筋細胞で高レベルで発現しているが、アイソフォームBは弱いながらも全ての組織で発現している。[13] [9]

この遺伝子の変異の唯一の記録された症例では、この遺伝子の選択的スプライシングされたエクソン3Aのホモ接合変異(c.215G>A)がアイソフォームAのアミノ酸置換(G72E)を引き起こした。これは、アイソフォームAを発現する筋細胞におけるATP合成酵素の欠損につながるが、アイソフォームBを発現する線維芽細胞ではこの欠損は起こらず、MPCDおよび前述の標準的な症状を引き起こす。[15] [9]

相互作用

コードされたタンパク質はPPIF相互作用するが、この相互作用はCsAによって阻害される。[7] [8]

参照

参考文献

  1. ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000075415 – Ensembl、2017年5月
  2. ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000061904 – Ensembl、2017年5月
  3. ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター
  4. ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター
  5. ^ Jabs EW, Thomas PJ, Bernstein M, Coss C, Ferreira GC, Pedersen PL (1994年5月). 「酸化代謝の終末段階に必要な遺伝子の染色体局在:ATP合成酵素のαサブユニットとγサブユニット、そしてリン酸キャリア」. Human Genetics . 93 (5): 600–2 . doi :10.1007/bf00202832. PMID  8168843. S2CID  39597611.
  6. ^ abcd 「Entrez遺伝子:SLC25A3溶質キャリアファミリー25(ミトコンドリアキャリア、リン酸キャリア)、メンバー3」。パブリックドメインこの記事には、パブリック ドメインであるこのソースからのテキストが組み込まれています
  7. ^ abcdef 「SLC25A3 - リン酸キャリアタンパク質、ミトコンドリア前駆体 - ホモサピエンス(ヒト) - SLC25A46 遺伝子とタンパク質」www.uniprot.org . 2018年8月20日閲覧 この記事には、CC BY 4.0 ライセンスに基づいて利用可能なテキストが組み込まれています。
  8. ^ abcdef 「UniProt:ユニバーサルタンパク質知識ベース」. Nucleic Acids Research . 45 (D1): D158– D169. 2017年1月. doi :10.1093/nar/gkw1099. PMC 5210571. PMID 27899622  . 
  9. ^ abcdef オンラインメンデル遺伝学(OMIM):SLC25A3 - 600370
  10. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J, Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (2013年10月). 「専門的な知識ベースによる心臓プロテオーム生物学と医学の統合」. Circulation Research . 113 (9): 1043–53 . doi :10.1161/CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID 23965338  . 
  11. ^ 「SLC25A3 - ミトコンドリアリン酸キャリアタンパク質」。心臓オルガネラタンパク質アトラスナレッジベース(COPaKB)
  12. ^ ab Dolce V, Iacobazzi V, Palmieri F, Walker JE (1994年4月). 「ミトコンドリア由来リン酸キャリアのヒトおよびウシ遺伝子の配列には、選択的スプライシングの証拠が含まれている」. The Journal of Biological Chemistry . 269 (14): 10451–60 . doi : 10.1016/S0021-9258(17)34081-4 . PMID  8144629.
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  15. ^ Mayr JA、Merkel O、Kohlwein SD、Gebhardt BR、Böhles H、Fötschl U、Koch J、Jaksch M、Lochmüller H、Horváth R、Freisinger P、Sperl W (2007 年 3 月)。 「ミトコンドリアのリン酸担体欠損症:酸化的リン酸化の新たな疾患」。アメリカ人類遺伝学ジャーナル80 (3): 478–84 .土井:10.1086/511788。PMC 1821108PMID  17273968。 

さらに読む

  • Dolce V, Fiermonte G, Messina A, Palmieri F (1992). 「ミトコンドリアリン酸キャリアをコードするヒト心臓cDNAのヌクレオチド配列」DNA Sequence . 2 (2): 133–5 . doi :10.3109/10425179109039683. PMID  1777677.
  • 丸山 憲治、菅野 誠(1994年1月). 「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡便法」.遺伝子. 138 ( 1–2 ): 171–4 . doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
  • Dolce V, Iacobazzi V, Palmieri F, Walker JE (1994年4月). 「ミトコンドリア由来リン酸キャリア遺伝子のヒトおよびウシ遺伝子配列には、選択的スプライシングを受けた形態の証拠が含まれている」. The Journal of Biological Chemistry . 269 (14): 10451–60 . doi : 10.1016/S0021-9258(17)34081-4 . PMID  8144629.
  • Marsh S, Carter NP, Dolce V, Iacobazzi V, Palmieri F (1995年10月). 「ミトコンドリアリン酸キャリア遺伝子PHCの染色体局在(12q23)」. Genomics . 29 (3): 814–5 . doi :10.1006/geno.1995.9924. PMID  8575787.
  • 鈴木雄三、中川吉智、丸山健、須山明生、菅野誠一(1997年10月)「全長エンリッチドcDNAライブラリーおよび5'末端エンリッチドcDNAライブラリーの構築と特性解析」Gene . 200 ( 1–2 ): 149–56 . doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID  9373149.
  • Huizing M, Ruitenbeek W, van den Heuvel LP, Dolce V, Iacobazzi V, Smeitink JA, Palmieri F, Trijbels JM (1998年6月). 「ヒトミトコンドリア膜貫通代謝物キャリア:組織分布とミトコンドリア疾患への影響」. Journal of Bioenergetics and Biomembranes . 30 (3): 277–84 . doi :10.1023/A:1020501021222. PMID  9733094. S2CID  45811751.
  • バウミースター T、ボーフ A、ラフナー H、アングランド PO、ベルガミニ G、クロートン K、クルシア C、エバーハルト D、ガグヌール J、ギデッリ S、ホップ C、フーセ B、マンガノ R、ミション AM、シルル M、シュレーグル J、シュワブ M、スタイン MA、バウアー A、カサリ G、ドリューズ G、ギャビン AC、ジャクソン DB、ジョバティG、ノイバウアー G、リック J、クスター B、スーパーティフルガ G (2004 年 2 月)。 「ヒト TNF-α/NF-κ B シグナル伝達経路の物理的および機能的マップ」。自然の細胞生物学6 (2): 97–105土井:10.1038/ncb1086。PMID  14743216。S2CID 11683986  。
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  • Iacobazzi V, Infantino V, Costanzo P, Izzo P, Palmieri F (2005年11月). 「ヒトミトコンドリアリン酸キャリア遺伝子のプロモーターの機能解析:活性化因子および抑制因子とそれらの転写因子の同定」. The Biochemical Journal . 391 (Pt 3): 613–21 . doi :10.1042/BJ20050776. PMC 1276962.  PMID 15984930  .
  • 大月隆、太田隆、西川隆、林和也、鈴木裕、山本純、若松亜、木村和、坂本和、波多野直、河合裕、石井真、斉藤和、小島隆、杉山隆、小野隆、岡野和、吉川裕、青塚深、佐々木直、服部亜、奥村和、永井和、菅野真、磯貝隆 (2007) 「オリゴキャップされたcDNAライブラリーからの分泌タンパク質または膜タンパク質をコードする完全長ヒトcDNAの選択のためのシグナル配列およびキーワードトラップのインシリコ」。DNA 研究12 (2): 117–26 .土井: 10.1093/dnares/12.2.117PMID  16303743。
  • Mayr JA、Merkel O、Kohlwein SD、Gebhardt BR、Böhles H、Fötschl U、Koch J、Yaksch M、Lochmüller H、Horváth R、Freisinger P、Sperl W (2007 年 3 月)。 「ミトコンドリアのリン酸担体欠損症:酸化的リン酸化の新たな障害」。アメリカ人類遺伝学ジャーナル80 (3): 478–84 .土井:10.1086/511788。PMC  1821108PMID  17273968。

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