バチルスは、バチルス目と乳酸菌目の2つの目を含む細菌の分類学上の 綱であり、炭疽菌（炭疽病の原因菌）などのよく知られた病原菌が含まれています。バチルスはほぼすべてグラム陽性細菌です。[1]
大文字で斜体表記されたBacillusという名称は、特定の細菌属を指します。大文字で斜体表記されていない Bacilli という名称は、より限定的でない分類群の細菌を指すこともあります。この分類群には2つの目があり、そのうちの1つにBacillus属が含まれます。「bacillus」のように小文字で斜体表記されていない場合、それは属名ではなく、形状を指している可能性が高いでしょう。
関連する概念が複数存在し、類似した語句が用いられているため、その曖昧さが大きな混乱を招く可能性があります。「Bacillus」（大文字で斜体表記）という用語も、Bacilli綱に属する属名（Bacillus anthracis）です。
「バチルス」（または小文字のbが付いた複数形の「bacilli」）という言葉は、あらゆる桿菌の形態を表す総称でもあります。この総称は、対象がバチルス綱またはバチルス属に属することを意味するものではありません。したがって、必ずしも類似した特性群を意味するわけではありません。バチルス綱のすべてが桿菌であるわけではなく（ブドウ球菌は球状です）、その綱に属さない桿菌も数多く存在します（例えば、クロストリジウム は桿菌ですが、分類学的には大きく異なります）。さらに、「バチルス」という総称は、必ずしもバチルス綱に共通するグラム陽性染色を示すわけではありません。例えば、大腸菌は「バチルス」と表現できる桿菌ですが、グラム陰性染色を示し、バチルス属やバチルス綱には属しません。微生物学者の中には、混乱を招く恐れがあるため、一般的な「バチルス」という用語の使用を放棄した人もいます。
現在受け入れられている分類法は、原核生物の命名法リスト（LPSN）[2]と国立生物工学情報センター（NCBI） [3]に基づいています。