CYANA（ソフトウェア）
| シアナ | |
|---|---|
| 原作者 | ピーター・ギュンタート |
| 安定版リリース | 2.1 / 2005年7月1日 （2005年7月1日） |
| プレビューリリース | 3.96 / 2013年3月5日 （2013年3月5日） |
| オペレーティング·システム | Linux、FreeBSD、Unixなどのオペレーティングシステム、Microsoft Windows、Mac OS X |
| タイプ | 計算化学 |
| Webサイト | www.cyana.org |
CYANA（Combined Assignment and Dynamics a lgorithm for N MR a pplications）は、核磁気共鳴（NMR）による配座制約に基づいて生体高分子の自動構造計算を行うプログラムです。自動核オーバーハウザー効果分光法 （NOESY）によるクロスピーク帰属と、高速ねじれ角ダイナミクスアルゴリズムを用いた構造計算を 組み合わせます。
CYANAパッケージには、ねじれ角空間における分子動力学（ねじれ角ダイナミクス）とシミュレーテッドアニーリングを組み合わせた従来のDYANAシステムが含まれています。目標関数はポテンシャルエネルギーとして使用され、システムは初期の高温から徐々に冷却される温度浴に結合されているため、目標関数の局所的最小値から遠ざかることができます。[ 1 ] [ 2 ]
ソフトウェアは標準Fortran 77で記述されており、対話型コマンド言語も備えています。対話型コマンド言語では、Fortran 77の数式および文字式、マクロ、制御フロー、並列化が利用可能です。標準プロトコルもこのコマンド言語で記述されており、ユーザーはソースコードを変更することなく変更することができます。[ 3 ]
参考文献
外部リンク
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