FishBaseは、魚類（特に魚類）に関する世界的な種データベースです。[1]これは、ウェブ上で最大規模かつ最もアクセス数の多い成魚類に関するオンラインデータベースです。 [2]時間の経過とともに、「ダイナミックで多用途な生態学的ツールへと進化」し、学術出版物で広く引用されています。[3] [4] [5]

FishBaseは、分類、地理的分布、生体測定学および形態、行動および生息地、生態および個体群動態、さらに生殖、代謝、遺伝データを含む包括的な種データを提供しています。栄養ピラミッド、識別キー、生物地理学的モデリング、漁業統計などのツールへのアクセスが可能で、 LarvalBase、GenBank、IUCNレッドリスト、魚類目録などの他のデータベースの情報への種レベルの直接リンクも提供されています。[6]

2024年2月現在、FishBaseには36,100種の魚類と亜種、332,100種の一般名、65,300枚の写真、そして67,600件の科学文献への参照が掲載されています。このサイトには毎月約70万件のアクセスがあります。[7]

歴史

FishBaseの起源は1970年代に遡ります。当時、水産学者 ダニエル・ポーリーは、魚の成長能力が鰓の大きさにどう影響されるかという仮説を検証しようと苦心していました。[8]このような仮説は、大量の経験的データがなければ検証できませんでした。[9]当時の漁業管理では、魚の成長と死亡率の推定値を必要とする分析モデルが使用されていました。 [10]水産学者や管理者にとって、関心のある魚種に関する必要な情報を入手するのは困難な場合があります。なぜなら、関連する事実が多数の学術論文、報告書、ニュースレター、その他の情報源に散在し、埋もれている場合があるからです。特に、そのような情報を必要とする開発途上国の人々にとっては困難です。ポーリーは、水産管理者が必要な量のデータにアクセスする唯一の実際的な方法は、出版されている文献から入手可能なすべてのデータを、中央のアクセスしやすいリポジトリに集めて統合することだと信じていました。[9] [11]このようなデータベースは、データが標準化され、検証されていれば特に有用でしょう。[9]これは、科学者や管理者が新しい仮説を検証する必要があるときには、利用可能なデータがすでに検証済みでアクセス可能な形式で存在しており、新しいデータセットを作成して検証する必要がないことを意味します。[12]

ポーリーはライナー・フローゼを採用し、1988年にこの方向性に沿ったソフトウェアデータベースの開発が始まりました。当初は熱帯魚に限定されていたこのデータベースは、FishBaseの原型となりました。FishBaseはその後、すべての魚類を網羅するように拡張され、 1996年8月にWeb上で公開されました。現在では、世界最大かつ最もアクセス数の多い魚類オンラインデータベースとなっています。[9] 1995年に最初のCD-ROMが「FishBase 100」としてリリースされました。その後、毎年CDがリリースされています。このソフトウェアは、Microsoft Windowsでのみ動作するMicrosoft Access上で動作します。

FishBaseは成魚の魚類をカバーしているが、魚類の初期段階や幼魚段階の詳細は扱っていない。1999年に、Bernd Ueberschärの監修の下、補完的なデータベースであるLarvalBaseがオンラインになった。これは魚類プランクトンと幼魚段階の魚類をカバーし、魚の卵と幼生に関する詳細なデータ、魚の識別、養殖における稚魚の飼育に関連するデータを含んでいる。FishBaseの成功を受けて、魚類以外の水生生物もカバーするデータベースの需要があった。その結果、2006年にSeaLifeBaseが誕生した。[9] SeaLifeBaseの長期目標は、FishBaseをモデルに、FishBaseが専門とする魚類以外の、海水と淡水のすべての水生生物を網羅した情報システムを開発することである。このカテゴリーには合計で約30万種が知られている。[13]

組織

FishBaseは魚類専門家の間で認知度が高まり、2,480人以上の貢献者と協力者を獲得しました。2000年以来、FishBaseは9つの国際機関からなるコンソーシアムによって管理されています。FishBaseコンソーシアムは現在12のメンバーにまで成長しています。ドイツのキール海洋研究所（GEOMAR）のGEOMAR（ヘルムホルツ海洋研究センター）が調整機関として機能し[14] [15]、2017年2月からはQuantitative Aquatics, Inc.が管理機関として機能しています[16] 。

参照

参考文献

  1. ^ Froese RとPauly D（編）（2000）FishBase 2000：概念、設計、データソース。ICLARM。フィリピン。
  2. ^ Marine Froese 2013年12月21日アーカイブ、Wayback Machine Pew Environment Group。
  3. ^ Stergiou KIとTsikliras AC (2006) FishBaseの科学的影響：引用分析 Archived 8 October 2011 at the Wayback Machine In: Palomares MLD, Stergiou KI and Pauly D (eds.), Fishes in Databases and Ecosystems . UBC Fisheries Centre , Research reports 14 (4): 2–6.
  4. ^ 参考文献 FishBaseを引用 FishBase. 最終更新日 2010年7月5日. 2011年7月20日閲覧。
  5. ^ ハンフリーズ, オースティン; ディマルコプロウ, ドナ; ステルギウ, コンスタンティノス; ツィクリラス, アタナシオス; パロマレス, デング; バイリー, ニコラス; ナウエン, コーネリア; ルナ, スーザン; バナシハン, ライラ; フローズ, ライナー; パウリー, ダニエル (2023). 「30年後のFishBaseの科学的影響の測定」(PDF) . Cybium . 47 (3): 213– 224. doi :10.26028/cybium/2023-002.
  6. ^ Gert B および Snoeks J (2004)「FishBase: 百科事典および研究ツール」48 ページ、VLIZ Special Publication 17、ブルージュ、ベルギー。
  7. ^ FishBaseのウェブページによると、2023年11月にアクセス。
  8. ^ Bakun A (2011)「酸素制約」11～23ページ。Villy ChristensenとJay Maclean（編）『漁業への生態系アプローチ：グローバルな視点』ケンブリッジ大学出版局。ISBN 978-0-521-13022-6。
  9. ^ abcde Palomares MLDとBailly N (2011)「海洋生物多様性情報の整理と普及：FishbaseとSeaLifeBaseのストーリー」24～46ページ。Villy ChristensenとJay Maclean（編）『漁業への生態系アプローチ：グローバルな視点』ケンブリッジ大学出版局。ISBN 978-0-521-13022-6。
  10. ^ Monro JL (2011)「熱帯魚の搾取資源の評価：概要」171～188ページ。Villy ChristensenとJay Maclean（編）『漁業への生態系アプローチ：グローバルな視点』ケンブリッジ大学出版局。ISBN 978-0-521-13022-6。
  11. ^ LarvalBase: 魚類幼生に関する世界的情報システム Archived 28 March 2012 at the Wayback Machine American Fisheries Society、Early Life History Section Newsletter、2002年5月、23 (2): 7–9。
  12. ^ Froese R (2011)「FishBaseの科学」47～54ページ。Villy ChristensenとJay Maclean（編）『漁業への生態系アプローチ：グローバルな視点』ケンブリッジ大学出版局。ISBN 978-0-521-13022-6。
  13. ^ SeaLifeBase – ホームページ Archived 14 August 2011 at the Wayback Machine . 2011年7月21日閲覧。
  14. ^ FishBaseホームページ。2018年11月28日閲覧。
  15. ^ 「生態学、個体群動態、漁業：FishBase」IFM-GEOMAR、キール。2012年3月24日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2014年1月27日閲覧。
  16. ^ 「About Us – Quantitative Aquatics, Inc.」2023年9月22日閲覧。
  17. ^ ライプニッツ海洋科学研究所 Archived 7 July 2011 at the Wayback Machine (IFM-GEOMAR). メインウェブサイト.
  18. ^ Fishbaseとアリストテレス大学 Archived 27 March 2012 at the Wayback Machine Aristotle University of Thessaloniki、2006年8月5日。

さらに読む

  • Bailly N (2010)「魚類カタログと FishBase バージョン 2 の間で学名の評価に矛盾が生じる理由」、2010 年 5 月 6 日。
  • Bailly N、Reyes Jr R、Atanacio R、Froese R (2010) 「FishBase の簡易識別ツール」 出典: Nimis PL および Vignes Lebbe R. (編)生物多様性を識別するためのツール: 進歩と問題、31 ～ 36 ページ。ISBN 978-88-8303-295-0。
  • クリステンセン V、CJ ウォルターズ、R アーレンス、J アルダー、J ブゾウスキー、LB クリステンセン、WWL チャン、J ダン、R フローゼ、V カルプージ、K カシュナー、K カーニー、S ライ、V ラム、MLD パロマレス、A ピーターズメイソン、C ピロッディア、JL サルミエント、J スティーンビーク、R スマイラ、R ワトソン、D ゼラーおよび D Pauly (2009) 世界の大規模海洋生態系のデータベース駆動モデル生態学的モデリング、220 (17): 1984–1996。
  • Froese R (2011)「フィッシュベースの科学」Villy ChristensenとJay Maclean編『漁業への生態系アプローチ：グローバルな視点』ケンブリッジ大学出版局、47～54ページ。ISBN 978-0-521-13022-6。
  • Froese R および Pauly D (編) (2000) FishBase 2000: 概念、設計、およびデータ ソース ICLARM、フィリピン。
  • Froese RとPauly D（1994）「カレイの生活史パターンを比較するためのツールとしてのFishbase」Netherlands Journal of Sea Research、32（3/4）：235–239​​。
  • Nauen CE (2004) 持続可能な漁業を支援する世界の魚類に関する公開電子アーカイブ CTA/連邦事務局セミナー、ACP-EU 漁業関係に関する専門家会議、ブリュッセル。
  • Palomares, MLD, N. Bailly, D. Pauly (2009) FishBase、SeaLifeBase、およびデータベース駆動型生態系モデリング p. 156–158. In: MLD Palomares, L. Morissette, A. Cisnero-Montemayor, D. Varkey, M. Coll, C. Piroddi (編) Ecopath 25 Years Conference Proceedings: Extended Abstracts. UBC Fisheries Centre Research Reports 17 (3).
  • Pauly D（1997）「FishBaseの科学」EC漁業協力紀要、 10（2）：4–6。
  • Robertson R (2008)「海洋魚類に関する世界的生物地理学的データベース：買主の注意」多様性と分布、 14 (6): 891–892。
  • Ueberschär BとTeltow M (1999)「FishBaseが釣りに出かける」[永久リンク切れ] Bulletin、12（2–3）：38–39。
Wikidata には次のプロパティがあります:
  • FishBase種ID（P938）（用途を参照）
  • FishBaseオンライン
  • 台湾の魚類データベース
  • アフリカのフィッシュベース
  • FishBase FishBlog (FishBase に関する情報)
  • 2010 年 9 月 3 日、キールサイエンス ニュースラインで FishBase が 20 周年を祝います。
  • FishBase Blue Zooの Rainer Froese さん。
  • 中央アフリカ王立博物館 (RMCA テルビュレン) のFishBase における魚の形態と識別、2007 年 FishBase および魚類分類トレーニング セッションでのプレゼンテーション。
  • 第 6 回 FishBase コンソーシアム会議および第 3 回ミニ FishBase シンポジウムFishBytes、2005 年。
  • 2008年FishBaseシンポジウム、中国水産科学院、2008年9月2日。
  • フィッシュ・オン・オンライン ダニエル・パウリー、ライナー・フローズ、マリア・ルルド・パロマレス。FishBase情報システムを用いた魚類学の学習と教育のためのガイド草稿。2005年1月17日更新。