POP4（遺伝子）

POP4
識別子
エイリアス	POP4、RPP29、POP4ホモログ、リボヌクレアーゼP/MRPサブユニット
外部ID	オミム: 606114 ; MGI : 1913411 ;ホモロジーン: 31392 ;ジーンカード：POP4 ; OMA : POP4 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 19番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 19q12 始める 29,606,283 bp [ 1 ] 終わり 29,617,237 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 7番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 7|7 B3 始める 37,961,420 bp [ 2 ] 終わり 37,970,847 bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 右副腎 右副腎皮質 左副腎 顆粒球 右冠動脈 左副腎皮質 横行結腸粘膜 口腔粘膜細胞 左冠動脈 鼻粘膜の嗅覚領域 上位の表現 神経節隆起 胚盤胞 心室帯 上顎突出 下顎突出 内側神経節隆起 桑実胚 真皮 リンパ管の内皮細胞 性器結節 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 リボヌクレアーゼ活性 タンパク質結合 リボヌクレアーゼP RNA結合 リボヌクレアーゼMRP活性 加水分解酵素活性 RNA結合 リボヌクレアーゼP活性 細胞成分 リボヌクレアーゼP複合体 核小体 核 核質 多量体リボヌクレアーゼP複合体 リボヌクレアーゼMRP複合体 生物学的プロセス tRNAの処理 RNAホスホジエステル結合加水分解、エンドヌクレアーゼ tRNA 5'リーダー除去 rRNA処理 RNA処理 RNAホスホジエステル結合の加水分解 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 10775 66161 アンサンブル ENSG00000105171 ENSMUSG00000030423 ユニプロット O95707 Q9CR08 RefSeq (mRNA) NM_006627 NM_025390 RefSeq（タンパク質） NP_006618 NP_079666 場所（UCSC） 19章: 29.61 – 29.62 Mb 7章: 37.96 – 37.97 Mb PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
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リボヌクレアーゼPタンパク質サブユニットp29は、ヒトではPOP4遺伝子によってコードされている酵素である。^{[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]}

相互作用

POP4はRPP38 ^{[ 8 ]}およびPOP1 ^{[ 8 ]}と相互作用することが示されている。

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000105171 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000030423 – Ensembl、2017年5月
3. 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. van Eenennaam H, Pruijn GJ, van Venrooij WJ (1999年7月). 「hPop4：ヒトRNase MRPおよびRNase Pリボ核タンパク質複合体の新規タンパク質サブユニット」 . Nucleic Acids Res . 27 (12): 2465–72 . doi : 10.1093 / nar/27.12.2465 . PMC 148449. PMID 10352175 .  
6. Jarrous N, Eder PS, Wesolowski D, Altman S (1999年3月). 「ヒトリボヌクレアーゼPの2つのタンパク質サブユニット、Rpp14とRpp29」 . RNA . 5 (2) S135583829800185X: 153–7 . doi : 10.1017 / S135583829800185X . PMC 1369747. PMID 10024167 .  
7. 「Entrez Gene：前駆体4、リボヌクレアーゼP/MRPサブユニット（S. cerevisiae）のPOP4プロセシング」。
8. Welting TJ, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (2004). 「ヒトRNase MRPリボ核タンパク質複合体のサブユニット間の相互作用」 . Nucleic Acids Res . 32 (7): 2138–46 . doi : 10.1093 / nar/gkh539 . PMC 407822. PMID 15096576 .  

さらに読む

• ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實・岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ＝グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグ DS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、 Fraughton C、Llamosas E、Cevik S、Bex C、Lamesch P、Sikorski RS、Vandenhaute J、Zoghbi HY、Smolyar A、Bosak S、Sequerra R、Doucette-Stamm L、Cusick ME、Hill DE、Roth FP、Vidal M (2005)。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。自然。437 (7062): 1173– 8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID  16189514 . S2CID  4427026 .
• Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (2005). 「核小体プロテオームダイナミクス」. Nature . 433 ( 7021): 77– 83. Bibcode : 2005Natur.433...77A . doi : 10.1038/nature03207 . PMID  15635413. S2CID  4344740 .
• Welting TJ, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (2004). 「ヒトRNase MRPリボ核タンパク質複合体のサブユニット間の相互作用」 . Nucleic Acids Res . 32 (7): 2138–46 . doi : 10.1093/nar/ gkh539 . PMC  407822. PMID  15096576 .
• Jiang T, Guerrier-Takada C, Altman S (2001). 「ヒト核RNase Pサブユニットにおけるタンパク質-RNA相互作用」 . RNA . 7 ( 7) S1355838201010299: 937–41 . doi : 10.1017/S1355838201010299 . PMC  1370153. PMID  11455963 .