リボソームタンパク質SA

RPSA
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 3BCH、4UG0、4V6X、5A2Q、5AJ0、4UJE、4D5L、4UJD、5FLX、4D61​​​​
識別子
エイリアス	RPSA、37LRP、67LR、ICAS、LAMBR、LAMR1、LBP、LBP/p40、LRP、LRP/LR、NEM/1CHD4、SA、lamR、p40、リボソームタンパク質SA
外部ID	オミム: 150370 ; MGI : 105381 ;ホモロジーン: 68249 ;ジーンカード：RPSA ; OMA : RPSA - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 3番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 3p22.1 始める 39,406,716 bp [ 1 ] 終わり 39,412,542 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 9番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 9 F4|9 71.41 cM 始める 119,956,755 bp [ 2 ] 終わり 1億1996万1435bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 生殖腺 右卵管 神経節隆起 心室帯 左卵巣 右卵巣 ランゲルハンス島 膵臓の体 横行結腸粘膜 脾臓 上位の表現 心室帯 胚葉上層 神経節隆起 子宮 脾臓 骨髄 レンズ 胸腺 ランゲルハンス島 皮膚の領域 より多くの参照表現データ バイオGPS 該当なし
遺伝子オントロジー 分子機能 ウイルス受容体活性 リボソームの構造構成要素 リボソーム結合 ラミニン受容体活性 タンパク質結合 RNA結合 ラミニン結合 細胞成分 細胞質 細胞質 リボソーム 膜 細胞膜 細胞内解剖学的構造 小さなリボソームサブユニット 細胞外エクソソーム 核 90Sプレリボソーム 核質 細胞質小リボソームサブユニット 生物学的プロセス エンドヌクレアーゼ切断により、（SSU-rRNA、5.8S rRNA、LSU-rRNA）からSSU-rRNAの成熟3'末端が生成される。 ITS1におけるエンドヌクレアーゼ切断により、SSU-rRNAが5.8S rRNAから、LSU-rRNAがトリシストロン性rRNA転写産物から分離される（SSU-rRNA、5.8S rRNA、LSU-rRNA）。 ウイルス転写 SRP依存性共翻訳タンパク質の膜への標的化 翻訳開始 核からのrRNAの輸出 ウイルスの宿主細胞への侵入 核転写されたmRNAの分解過程、ナンセンス変異による分解 タンパク質生合成 ウイルスプロセス rRNA処理 リボソーム小サブユニットアセンブリ 細胞接着 細胞質翻訳 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 3921 16785 アンサンブル ENSG00000168028 ENSMUSG00000032518 ユニプロット P08865 P14206 RefSeq (mRNA) NM_002295 NM_001304288 NM_011029 RefSeq（タンパク質） NP_001291217 NP_002286 NP_035159 場所（UCSC） 3章: 39.41 – 39.41 Mb 9 章: 119.96 – 119.96 Mb PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
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40Sリボソームタンパク質SAは、ヒトではRPSA遺伝子によってコードされているリボソームタンパク質である。^{[ 5 ] [ 6 ]}また、特にラミニンの細胞表面受容体としても機能し、いくつかの病原性プロセスに関与している。

このタンパク質は、リボソームタンパク質SA、RPSA、LamR、LamR1、37 kDaラミニン受容体前駆体、37LRP、67 kDaラミニン受容体、67LR、37/67 kDaラミニン受容体、LRP/LR、LBP/p40、p40リボソーム関連タンパク質など、様々な名称で呼ばれてきました。リボソームタンパク質SAとRPSAは、承認された名称および記号です。

遺伝子

RPSA様遺伝子は複数のコピーが存在するが、そのほとんどはレトロポジション現象によって生じたと考えられる偽遺伝子である。この遺伝子には、同じタンパク質をコードする2つの選択的スプライシング転写バリアントが見つかっている。^{[ 7 ]}

RPSA遺伝子の相補DNA（cDNA）は7つのエクソンの集合体として形成され、そのうち6つがコード配列に対応している。^{[ 6 ]}

構造

RPSAのcDNA配列から推定されるアミノ酸配列は、295残基から構成されています。RPSAは、遺伝子のエクソン2～5に対応するNドメイン（残基1～209）と、エクソン6～7に対応するCドメイン（残基210～295）の2つの主要ドメインに分けられます。RPSAのNドメインは、原核生物のリボソームタンパク質S2（RPS2）と相同性があります。このタンパク質は、すべての後生動物で保存されている回文配列173LMWWML178を含みます。Cドメインは、脊椎動物で高度に保存されています。RPSAのアミノ酸配列は、すべての哺乳類で98%同一です。RPSAは、進化の過程でラミニン受容体の機能を獲得したリボソームタンパク質です。^{[ 8 ] [ 9 ]} RPSAのNドメインの構造は、原核生物のRPS2のものと類似している。^{[ 10 ]} Cドメインは溶液中では本質的に無秩序である。Nドメインは溶液中では単量体であり、三状態平衡に従って展開する。37℃では、フォールディング中間体が優勢である。^{[ 11 ]}

関数

ラミニンは細胞外マトリックス糖タンパク質ファミリーであり、基底膜の主要な非コラーゲン性構成成分です。細胞接着、分化、遊走、シグナル伝達、神経突起伸展、転移など、様々な生物学的プロセスに関与していることが示唆されています。ラミニンの作用の多くは、細胞表面受容体との相互作用を介して発現します。これらの受容体には、インテグリンファミリーのメンバーに加え、非インテグリンのラミニン結合タンパク質が含まれます。RPSA遺伝子は、リボソームタンパク質であると同時に、高親和性の非インテグリンラミニン受容体でもある多機能タンパク質をコードしています。

RPSA のアミノ酸配列は進化を通じて高度に保存されており、重要な生物学的機能を 示唆しています。

組織分布

大腸癌組織および肺癌細胞株では、正常細胞よりもRPSA転写産物のレベルが高いことが観察されています。また、癌細胞におけるこのポリペプチドの発現上昇と、その浸潤性および転移性の表現型との間には相関関係が認められます。

相互作用

RPSAのいくつかの相互作用は、当初は細胞生物学の手法によって発見されていましたが、その後、組換え誘導体やin vitro実験によって確認されました。in vitro実験では、RPSAの折り畳まれたNドメインと無秩序なCドメインが、共通する機能と特異的な機能の両方を持つことが示されました。^{[ 12 ]}

• RPSAは遺伝暗号の翻訳に関与するタンパク質に結合します。(i) 酵母ツーハイブリッドスクリーニングでは、RPSAが40S小リボソームサブユニットのリボソームタンパク質S21に結合することが示されています。^{[ 13 ] [ 14 ]} (ii) RPSAの連続欠失では、Cドメインに含まれる残基236〜262のセグメントが、RPSAとリボソームの40Sサブユニットとの相互作用に関与していることがわかりました。^{[ 15 ]} (iii) 核磁気共鳴分光法（NMR）に基づく研究では、リシルtRNA合成酵素のアンチコドン結合ドメインがRPSAのCドメインに直接結合することが示されている。^{[ 16 ]}
• RPSAは当初ラミニン結合タンパク質として同定されました。^{[ 17 ] [ 18 ]} RPSAの組み換えNドメインとCドメインは両方とも試験管内でラミニンに結合し、同様の解離定数（300 nM）で結合します。^{[ 10 ] [ 12 ]}
• RPSAとラミニンは共にヘパリン/ヘパラン硫酸相互作用体に属します。^{[ 19 ]}ヘパリンはin vitroにおいてRPSAのNドメインに結合しますが、Cドメインには結合しません。さらに、RPSAのCドメインとヘパリンはラミニンへの結合をめぐって競合します。これは、RPSAの高酸性Cドメインがラミニンへの結合においてヘパリン（そしておそらくヘパラン硫酸）を模倣していることを示しています。^{[ 12 ]}
• RPSAは、デングウイルス（DENV）^{[ 20 ] [ 21 ]}を含むいくつかの病原性フラビウイルスおよびシンドビスウイルス（SINV）^{[ 22 ]}を含むアルファウイルスの潜在的な細胞受容体である。RPSAのNドメインには、in vitroでSINVの結合部位が含まれている。^{[ 10 ]} Nドメインには、2つのフラビウイルス、ウエストナイルウイルス、およびDENVの血清型2のエンベロープタンパク質からの組換えドメイン3（ED3、残基296〜400）に対する弱い結合部位も含まれている。Cドメインには、黄熱ウイルス（YFV）のドメイン3とDENVの血清型1および2に対する弱い結合部位が含まれている。対照的に、日本脳炎ウイルスのドメイン3は、in vitroでRPSAに結合しないと思われる。^{[ 12 ]}
• RPSAは小分子の受容体でもある。(i) RPSAは生体内および試験管内の両方でアフラトキシンB1に結合する。^{[ 23 ]} (ii) RPSAは緑茶の主成分であり、多くの健康関連効果を持つエピガロカテキンガレート（EGCG）の受容体である。^{[ 24 ] [ 25 ]} EGCGは試験管内においてRPSAのNドメインにのみ結合し、解離定数は100 nMであるが、Cドメインには結合しない。^{[ 12 ]}

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