RoXaN (ロタウイルスX関連非構造タンパク質)は、 ZC3H7B(ジンクフィンガーCCCH型7B含有)としても知られ、ヒトではZC3H7B遺伝子によってコードされるタンパク質です。[ 5 ] RoXaNは、テトラトリコペプチドリピート、ロイシン-アスパラギン酸リピート、およびジンクフィンガードメインを含むタンパク質です。このタンパク質は、ロタウイルスの非構造タンパク質NSP3とも相互作用します。[ 5 ]
関数
ロタウイルスのmRNAはキャップされているもののポリアデニル化されておらず、ウイルスタンパク質は細胞翻訳機構によって翻訳される。これは、ウイルスmRNAの3'コンセンサス配列に特異的に結合し、真核生物の翻訳開始因子eIF4G Iと相互作用するウイルス非構造タンパク質NSP3の作用によって達成される。[ 6 ]
RoXaN(ロタウイルスXタンパク質、 NSP3関連)は110kDaの細胞タンパク質で、タンパク質間相互作用または核酸間相互作用に関与すると予測される少なくとも3つの領域を含んでいます。多タンパク質複合体で最もよく見られるタンパク質間相互作用ドメインであるテトラトリコペプチドリピート領域は、アミノ末端領域に存在します。カルボキシ末端には少なくとも5つのジンクフィンガーモチーフが観察され、RoXaNが他のタンパク質または核酸に結合する能力があることを示唆しています。これらの2つの領域の間には、タンパク質間相互作用に関与するパキシリンロイシン-アスパラギン酸リピート(LD)モチーフが存在します。 [ 6 ]
臨床的意義
RoXaNは生体内およびロタウイルス感染時にNSP3と相互作用する。相互作用ドメインは、NSP3の二量体化ドメイン(アミノ酸163~237)およびRoXaNのLDドメイン(アミノ酸244~341)に対応する。NSP3とRoXaNの相互作用は、NSP3とeIF4G Iの相互作用を阻害せず、ロタウイルス感染細胞ではNSP3、RoXaN、eIF4G Iからなる三量体複合体が検出され、RoXaNが翻訳制御に関与していることが示唆されている。[ 6 ]
RoXaNの発現はGIST(消化管間質腫瘍)における腫瘍の進行度の高さと相関していることが判明した。[ 7 ]
参考文献
- ^ a b c GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000100403 – Ensembl、2017年5月
- ^ a b c GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000022390 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「ヒトPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ a b「Entrez遺伝子:7Bを含むZC3H7BジンクフィンガーCCCH型」。
- ^ a b c Vitour D, Lindenbaum P, Vende P, Becker MM, Poncet D (2004年4月). 「TPR、LD、およびジンクフィンガーモチーフを含む新規細胞タンパク質RoXaNは、真核生物開始因子4GおよびロタウイルスNSP3と三元複合体を形成する」 . J. Virol . 78 (8): 3851–62 . doi : 10.1128 / JVI.78.8.3851-3862.2004 . PMC 374268. PMID 15047801 .
- ^ Kang HJ, Koh KH, Yang E, You KT, Kim HJ, Paik YK, Kim H (2006年2月). 「KITおよびPDGFRA変異を有する消化管間質腫瘍における特異的発現タンパク質」.プロテオミクス. 6 ( 4): 1151–7 . doi : 10.1002/pmic.200500372 . PMID 16402362. S2CID 2780778 .
さらに読む
- 丸山 憲一、菅野 誠(1994年1月). 「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡便法」.遺伝子. 138 ( 1–2 ): 171–4 . doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
- 鈴木雄三、中川佳智、丸山健、須山明生、菅野誠一(1997年10月). 「全長エンリッチドcDNAライブラリーおよび5'末端エンリッチドcDNAライブラリーの構築と特性解析」. Gene . 200 ( 1– 2 ): 149– 56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
- 菊野 亮、永瀬 剛、石川 功、他 (1999年6月). 「未同定ヒト遺伝子のコード配列の予測 XIV. in vitroで巨大タンパク質をコードする脳由来の新規cDNAクローン100個の完全配列」 . DNA Research . 6 (3): 197– 205. doi : 10.1093/dnares/6.3.197 . PMID 10470851 .
- Dunham I, Shimizu N, Roe BA, et al. (1999年12月). 「ヒト22番染色体のDNA配列」 . Nature . 402 (6761): 489–95 . Bibcode : 1999Natur.402..489D . doi : 10.1038/990031 . PMID 10591208 .
- Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001年3月). 「ヒト遺伝子およびタンパク質のカタログ作成に向けて:新規完全タンパク質コードヒトcDNA500個の配列決定と解析」. Genome Research . 11 (3): 422–35 . doi : 10.1101/gr.GR1547R . PMC 311072. PMID 11230166 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2002年12月). 「15,000以上のヒトおよびマウスの完全長cDNA配列の生成と初期解析」 . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 99 (26): 16899–903 . Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, 他 (2004年10月). 「NIH完全長cDNAプロジェクト:哺乳類遺伝子コレクション(MGC)の現状、品質、そして拡大」. Genome Research . 14 (10B): 2121–7 . doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928. PMID 15489334 .
- Rush J, Moritz A, Lee KA, et al. (2005年1月). 「癌細胞におけるチロシンリン酸化の免疫親和性プロファイリング」. Nature Biotechnology . 23 (1): 94– 101. doi : 10.1038/nbt1046 . PMID 15592455. S2CID 7200157 .
- Lim J, Hao T, Shaw C, et al. (2006年5月). 「ヒト遺伝性運動失調症およびプルキンエ細胞変性疾患におけるタンパク質間相互作用ネットワーク」 . Cell . 125 (4): 801–14 . doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID 16713569 .