シンプルなモジュラーアーキテクチャ研究ツール

スマート

コンテンツ
説明	タンパク質ドメインの識別スキーム
キャプチャされたデータの種類	タンパク質ドメイン
生物	すべて
お問い合わせ
研究センター	欧州分子生物学研究所
主要引用	PMID  18978020
アクセス
ウェブサイト	http://smart.embl-heidelberg.de
その他
ライセンス	学術関係者は無料ですが、商用利用者は無料ではありません
バージョン	7
キュレーションポリシー	はい

シンプルモジュラーアーキテクチャリサーチツール（SMART）は、タンパク質配列内のタンパク質ドメインの同定と解析に使用される生物学的データベースです。 ^{[ 1 ] [ 2 ]} SMARTは、多重配列アライメントから構築されたプロファイル隠れマルコフモデルを使用して、タンパク質配列内のタンパク質ドメインを検出します。SMARTの最新リリースには、1,204のドメインモデルが含まれています。^{[ 3 ]} SMARTのデータは、保存ドメインデータベースコレクション の作成に使用され、 InterProデータベースの一部としても配布されています。^{[ 4 ]}このデータベースは、ハイデルベルクの 欧州分子生物学研究所によってホストされています

参考文献

1. Schultz J, Milpetz F, Bork P, Ponting CP (1998年5月). 「SMART、シンプルなモジュラーアーキテクチャ研究ツール：シグナル伝達ドメインの同定」(PDF) . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 95 ( 11 ) : 5857–64 . Bibcode : 1998PNAS...95.5857S . doi : 10.1073/pnas.95.11.5857 . PMC 34487. PMID 9600884  
2. Letunic I, Doerks T, Bork P (2009年1月). 「SMART 6：最近のアップデートと新たな開発」 . Nucleic Acids Res . 37 (データベース版): D229–32. doi : 10.1093/nar/gkn808 . PMC 2686533. PMID 18978020 .  
3. Letunic, Ivica; Doerks, Tobias; Bork, Peer (2015年1月). 「SMART：最近のアップデート、新たな開発、そして2015年の現状」 . Nucleic Acids Research . 43 (データベース版): D257–260. doi : 10.1093/nar/gku949 . ISSN 1362-4962 . PMC 4384020. PMID 25300481 .   
4. Mulder NJ, Apweiler R, Attwood TK, et al. (2002年9月). 「InterPro: タンパク質ファミリー、ドメイン、機能部位のための統合ドキュメンテーションリソース」 . Brief. Bioinformatics . 3 (3): 225–35 . doi : 10.1093/bib/3.3.225 . PMID 12230031 . 

外部リンク

• SMARTウェブサイト