VPS13B

VPS13B
識別子
エイリアスVPS13B、CHS1、COH1、液胞タンパク質選別13ホモログB
外部IDオミム: 607817 ; MGI : 1916380 ;ホモロジーン: 49516 ;ジーンカード: VPS13B ; OMA : VPS13B - オルソログ
オルソログ
種人間ねずみ
エントレズ

157680

666173

アンサンブル

ENSG00000132549

ENSMUSG00000037646

ユニプロット

Q7Z7G8

Q80TY5

RefSeq (mRNA)

NM_015243 NM_017890 NM_152564 NM_181661 NM_184042

NM_177151

RefSeq（タンパク質）

NP_056058 NP_060360 NP_689777 NP_858047

NP_796125

場所（UCSC）8章: 99.01 – 99.88 Mb15章: 35.37 – 35.93 MB
PubMed検索[ 3 ][ 4 ]
ウィキデータ
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液胞タンパク質選別13B（酵母）
識別子
シンボルVPS13B
代替記号CHS1、COH1
NCBI遺伝子157680
HGNC2183
オミム607817
参照シーケンスNM_184042
ユニプロットQ7Z7G8
その他のデータ
軌跡第8章q22-q23
検索する
構造スイスモデル
ドメインインタープロ

膜間脂質輸送タンパク質VPS13B（別名：液胞タンパク質選別関連13B）は、ヒトではVPS13B遺伝子によってコードされるタンパク質であり、ゴルジ体に関連する巨大タンパク質で、ゴルジ体後の選別と輸送に関与していると考えられています。[ 5 ] ヒトVPS13B遺伝子の変異はコーエン症候群を引き起こします。

VPS13B遺伝子はCHS1、COH1、KIAA0532、 [ 6 ]、DKFZp313I0811とも呼ばれます。 [ 7 ]

ヒトVPS13B遺伝子の細胞遺伝学的位置は8番染色体長腕22.2番の8q22である。様々なスプライスバリアントが同定されており、アイソフォームを形成している。ヒトVPS13B遺伝子によってコードされる発現タンパク質の標準的な形態は、3997個のアミノ酸からなる。[ 6 ]

遺伝子

VPS13B遺伝子は染色体8q22に位置する。この染色体の欠失はコーエン症候群と関連しているため、この遺伝子はCOH1とも呼ばれる。[ 8 ]この遺伝子は66のエクソンで構成され、そのうち4つは選択的スプライシングである。[ 9 ] VS13B遺伝子の選択的スプライシングのパターンは、エクソン28Bと28を含む解析領域で複雑である。これにより、最終的に4つの終止コドンと3つの選択的スプライシング形式が使用されることになる。[ 10 ]エクソン2は、その翻訳開始コドンが発生する場所である。[ 9 ] VPS13Bは大きな遺伝子で、約864キロベースペア（846,000塩基対）のゲノムDNA配列領域に広がっている。[ 9 ] VPS13B遺伝子は、特に前立腺、精巣、卵巣、結腸で広く発現しており、その転写産物は約12～14キロ塩基対である。胎児の脳、肝臓、腎臓でも発現しており、その転写産物は約2.0～5.0キロ塩基対である。成人の脳における発現は非常に少ない。[ 11 ]変異体1Aと2Aは、それぞれ4,022個と39,997個のアミノ酸タンパク質をコードする遺伝子の主要な変異体である。[ 8 ] 3'非翻訳領域には2つのAlu反復配列が存在する。 [ 12 ] 

命名法

VPS13B遺伝子は次のようにも知られています。[ 13 ]

  • CHS1
  • COH1
  • コーエン症候群1
  • DKFZp313I0811
  • KIAA0532
  • 液胞タンパク質選別13ホモログB（酵母）
  • 液胞タンパク質選別 13B
  • VP13B_人間

関数

VPS13B遺伝子から生成されるタンパク質はゴルジ体の一部です。[ 13 ]また、細胞内でのタンパク質の仕分けと輸送も担っています。[ 13 ] VPS13Bタンパク質は、正常な成長、ニューロンの発達、脂肪細胞の発達に重要な役割を果たすため重要です。[ 13 ]このタンパク質は、眼、血液系、中枢神経系の機能の発達や、体内の脂肪の貯蔵と分布にも関与している可能性があります。[ 14 ] VPS13Bは、遺伝子座8q22.2にあります。[ 13 ]これは、 VPS13B遺伝子が8番染色体の8q22.2の長腕の位置22.2に位置することを意味します。 [ 13 ] VPS13Bタンパク質は4,022個のアミノ酸から構成され、合計10個の膜貫通ドメインと複雑な機能モチーフのパターンを持っている可能性がある。[ 15 ]

現在、VPS13B遺伝子は、VPS13Bタンパク質を産生するタンパク質コード遺伝子として認識されています。[ 16 ] VPS13Bタンパク質は、ゴルジ体や、タンパク質修飾、タンパク質組織化、タンパク質分布などの細胞内プロセスと関連付けられています。 [ 17 ]また、VPS13Bタンパク質は、特定の体細胞や体のシステムの発達に影響を与え、ヒトにおける脂肪の蓄積と分配に関与している可能性があると推測されています。[ 6 ] [ 17 ]

VPS13B遺伝子の変異は、VPS13Bタンパク質の機能異常を引き起こす可能性がある。遺伝子内の変異は、コーエン症候群および自閉症の潜在的要因として関連付けられている。[ 17 ] [ 18 ] [ 19 ] [ 20 ]コーエン症候群では、遺伝子の欠失変異によってVPS13Bタンパク質の形状が変わり、短く機能しないタンパク質が生じると考えられている。 [ 17 ] [ 19 ]変化したVPS13Bタンパク質はこれらの遺伝子変化により正常に機能できなくなり、通常のプロセスが阻害される。[ 17 ]研究では、VPS13B遺伝子の変異と骨粗鬆症との関連も示されている。[ 8 ] VPS13Bコピー数変異体の増加と成人の骨密度の低下との間に関連が見つかっている。[ 8 ]しかし、 VPS13B遺伝子の正常で明確な機能は不明であり、その変異形態の具体的な意味も同様である。

臨床的意義

コーエン症候群と診断された患者において、 VPS13B遺伝子の150種類を超える異なる変異が確認されています。[ 13 ] VPS13B遺伝子の欠失は、VPS13Bタンパク質を作るための指示に未熟な停止信号を引き起こし、タンパク質が異常に短くなり、機能しなくなります。[ 13 ]これが起こると、機能しないタンパク質はゴルジ体が正常に機能しないようにし、正常な糖化を停止させます。[ 13 ]

コーエン症候群

RNA干渉によるHeLa細胞におけるCOH1遺伝子の欠損は、正常なゴルジ体組織を破壊します。この遺伝子の欠失は、常染色体劣性遺伝性のコーエン症候群の原因となります。コーエン症候群患者の線維芽細胞もゴルジ体に異常が見られます。[ 21 ]コーエン症候群患者は、ゴルジ体の主要な機能であるタンパク質の糖化に欠陥があることが示されており[ 22 ]、ゴルジ体機能不全がコーエン症候群の病態に寄与しているという説を裏付けています。[ 21 ]

コーエン症候群は非常にまれな遺伝性疾患で、世界中で約1,000人が診断されています。この疾患は、 VPS13B遺伝子の両対立遺伝子変異によって発症します。この疾患は、決して治らない様々な症状を引き起こします。小頭症、筋緊張低下、視力低下、網膜ジストロフィー、思春期遅延、過可動性、肥満などがその例です。この症候群の患者は、特徴的な顔立ちをしています。突出した鼻、異常な形の目、太い髪、細い手足、長く細い指が特徴です。[ 23 ]

コーエン症候群の症状は非常に幼い頃から現れ始める。出生時には新生児に全く症状が見られないこともあるが、顔の特徴が形成され始めると顕著になる。[ 24 ]乳児や小児では発育不全から始まり、その後発達の遅れが現れ始める。小頭症、網脈絡膜ジストロフィー、精神運動発達遅滞、強度近視、好中球減少症、関節過可動性、そして特徴的な顔の特徴が形成され始める。10代や青年期には、低身長や肥満が懸念され始める。この症候群の患者の約30％は非言語および非識字である。[ 25 ]この症候群で言語の遅れが顕著な場合の多くでは、口の中にアフタ性潰瘍ができ、痛みを引き起こす。コーエン症候群の患者の多くは、30歳までに視力が低下し始めます。コーエン症候群は平均寿命を縮めることはありませんが、話すことや見ることができないため、生活の質が低下します。[ 24 ]この症候群の患者は、発作、手足の狭窄、成長ホルモン欠乏症を患うことも知られています。 [ 26 ] [ 27 ]

コーエン症候群は常染色体劣性疾患であり、主に顔面異形症、小頭症、関節弛緩症、間欠性好中球減少症を特徴とする。コーエン症候群は常染色体劣性遺伝性疾患であり、50%の確率で保因者となる。この症候群の患者の子供は、この症候群の保因者となる。[ 19 ]フィンランド人におけるコーエン症候群患者の75%は、遺伝子の両方のコピーに変異を有する。VPS13B遺伝子の変異は、フィンランド人とアーミッシュのグループ以外では、少数の家族にのみ発生する。[ 17 ]

好中球減少症

VPS13B遺伝子が関与するもう一つの疾患は、好中球減少症です。これは白血球の一種である好中球の濃度が低下する疾患です。[ 28 ] この疾患に罹患した人は、感染症や疾患にかかりやすくなります。[ 28 ]これは遺伝性疾患ですが、特定の薬剤や骨髄によっても引き起こされることがあります。[ 28 ]

サットン病2

サットン病は、口腔内に痛みを伴う潰瘍を形成する慢性炎症性疾患です。[ 29 ]潰瘍の大きさや痛みの程度は様々です。この病気は一般的に口内炎と呼ばれます。[ 29 ]

ユーイング肉腫

ユーイング肉腫は骨や軟骨、神経などの軟部組織に発生する癌性腫瘍です。[ 30 ]通常、小児、10代、若年成人に発症します。[ 30 ]ユーイング肉腫に類似した疾患は他にもありますが、VPS13B遺伝子を持つのはこの疾患だけです。[ 30 ]

小頭症

小頭症は、頭が変形し、正常よりも小さくなる疾患です。[ 31 ]小頭症の患者の多くは、発作、発達遅延、運動、バランス、摂食障害を経験します。聴覚障害や視力低下も起こることがあります。[ 31 ]

他の

症候群性自閉症もこの遺伝子と関連しており[ 7 ] 、知的障害も同様である[ 32 ] [ 33 ]。

参考文献

  1. ^ a b c GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000132549 – Ensembl、2017年5月
  2. ^ a b c GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000037646 – Ensembl、2017年5月
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