応用1

応用1
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2EJ8、2ELA、2ELB、2Q12、2Q13、2Z0N、2Z0O、5C5B​​​​​​
識別子
エイリアス	APPL1、APPL、DIP13alpha、MODY14、アダプタータンパク質、PHドメインおよびロイシンジッパー1と相互作用するリン酸化チロシン
外部ID	オミム: 604299 ; MGI : 1920243 ;ホモロジーン: 32143 ;ジーンカード: APPL1 ; OMA : APPL1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 3番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 3p14.3 始める 57,227,726 bp [ 1 ] 終わり 57,278,105 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 14番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 14|14 A3 始める 26,640,945 bp [ 2 ] 終わり 26,693,189 bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 アキレス腱 上腕二頭筋 胚上皮 膵臓の体 外側広筋 人間のペニス 腓腹筋 上腕二頭筋の骨格筋組織 太ももの筋肉 腹直筋の骨格筋組織 上位の表現 一次卵母細胞 大動脈弁 上行大動脈 二次卵母細胞 前庭感覚上皮 蝸牛管の前庭膜 黒質 原始的な条線 結膜円蓋 虹彩 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 プロテインキナーゼB結合 タンパク質結合 同一のタンパク質結合 ホスファチジルセリン結合 ホスファチジルイノシトール結合 タンパク質ホモ二量体化活性 タンパク質含有複合体結合 β-チューブリン結合 細胞成分 細胞質 NuRD複合体 細胞質 エンドソーム 初期エンドソーム膜 膜 小胞膜 エンドソーム膜 細胞外エクソソーム 核 初期エンドソーム フリル 細胞膜 細胞質小胞 初期ファゴソーム マクロピノソーム 細胞内小胞 細胞投影 貪食小胞 生物学的プロセス グルコース輸入の調節 リガンド非存在下での外因性アポトーシスシグナル伝達経路 細胞周期 細胞集団の増殖 シグナル伝達 インスリン受容体シグナル伝達経路 タンパク質の細胞膜への局在の制御 トランスフォーミング成長因子β受容体シグナル伝達経路 線維芽細胞の移動の調節 シグナリング アディポネクチン活性化シグナル伝達経路 Toll様受容体4シグナル伝達経路の調節 肝細胞増殖因子刺激に対する細胞応答 自然免疫応答の調節 グルコース輸入の正の調節 メラニン生合成プロセスの正の調節 炎症反応に関与するサイトカイン産生の正の調節 マクロピノサイトーシスの正の調節 貪食作用に関与するFc-γ受容体シグナル伝達経路の負の制御 核へのタンパク質の輸入 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 26060 72993 アンサンブル ENSG00000157500 ENSMUSG00000040760 ユニプロット Q9UKG1 Q8K3H0 RefSeq (mRNA) NM_012096 NM_145221 RefSeq（タンパク質） NP_036228 NP_660256 場所（UCSC） 3章: 57.23 – 57.28 Mb 14章: 26.64 – 26.69 MB PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
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アダプタータンパク質、PHドメインおよびロイシンジッパー1と相互作用するリン酸化チロシン（APPL1）、またはDCC相互作用タンパク質13-α（DIP13alpha）は、ヒトではAPPL1遺伝子によってコードされるタンパク質です。^{[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]} APPL1には、プレクストリン相同性（PH）ドメイン、リン酸化チロシン結合（PTB）ドメイン、およびBin-Amphiphysin-Rvs （BAR）ドメインなど、いくつかの重要な相互作用ドメインが含まれています。^{[ 8 ]}

関数

APPL1は、 Rab5陽性（「初期」）エンドソームのサブセットに局在するアダプタータンパク質であり、他の結合パートナーをリクルートし、小胞輸送とエンドソームシグナル伝達を制御する。APPL1はEEA1陰性の非常に初期のエンドソームに濃縮されており、EEA1が引き継ぐ前のエンドソーム輸送の最も初期段階にAPPL1が影響を及ぼすことを示している。これは、APPL1とEEA1がRab5結合をめぐって競合するという観察結果と一致する。APPL1は、Rab5の活性化に依存する主要なエンドソーム貨物（例： EGF受容体）の内在化速度に影響を与える。^{[ 8 ]}

APPL1のPTBドメインは、特定のエンドソーム区画（「シグナル伝達エンドソーム」と呼ばれることもある）における多くの細胞シグナル伝達を制御します。これには、リゾホスファチジン酸（LPA）誘導シグナル伝達（相互作用タンパク質GIPC1との共存）が含まれます。APPL1のさらなる役割は、エンドソームから解離したAPPL1が核に局在することを特定しました。 ^{[ 8 ]}

変異体研究

Appl1のマウス変異対立遺伝子
マウス遺伝子のマーカーシンボル。このシンボルはMGIによってゲノム遺伝子座に割り当てられる。	アプリケーション1
変異マウス胚性幹細胞クローン。これらは、マウスにおけるこの遺伝子の既知の標的変異です。	Appl1 ^tm1a(KOMP)Wtsi
この遺伝子の標的条件変異対立遺伝子の構造例
これらの変異ES細胞は直接研究することも、この遺伝子をノックアウトしたマウスを作成するために用いることもできます。これらのマウスの研究は、Appl1の機能の解明につながる可能性があります。 ノックアウトマウスを参照

相互作用

APPL1は、大腸癌における欠失タンパク質^{[ 9 ]}、AKT2 ^{[ 5 ]}だけでなく、Rab5 、 Rab21 、 OCRL 、その他約30種類のタンパク質と相互作用することが示されています。 ^{[ 8 ]}

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000157500 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000040760 – Ensembl、2017年5月
3. 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Mitsuuchi Y, Johnson SW, Sonoda G, Tanno S, Golemis EA, Testa JR (1999年9月). 「がんタンパク質セリン／スレオニンキナーゼAKT2と相互作用するアダプター分子をコードする染色体3p14.3-21.1遺伝子APPLの同定」. Oncogene . 18 ( 35): 4891–8 . doi : 10.1038/sj.onc.1203080 . PMID 10490823. S2CID 25245749 .  
6. Nechamen CA, Thomas RM, Dias JA (2007年1月). 「APPL1、APPL2、Akt2、FOXO1aは、潜在的なシグナル伝達複合体においてFSHRと相互作用する」. Molecular and Cellular Endocrinology . 260– 262: 93– 9. doi : 10.1016/j.mce.2006.08.014 . PMC 1782224. PMID 17030088 .  
7. 「Entrez Gene: APPL1アダプタータンパク質、リン酸化チロシン相互作用、PHドメインおよびロイシンジッパー含有1」。
8. Diggins NL, Webb DJ (2017年6月). 「APPL1は多機能エンドソームシグナル伝達アダプタータンパク質である」 .生化学会誌. 45 (3): 771– 779. doi : 10.1042/bst20160191 . PMC 5844352. PMID 28620038 .  
9. Liu J, Yao F, Wu R, Morgan M, Thorburn A, Finley RL, Chen YQ (2002年7月). 「DIP13αによるDCCアポトーシスシグナルの媒介」 . The Journal of Biological Chemistry . 277 (29): 26281–5 . doi : 10.1074/jbc.M204679200 . PMID 12011067 . 

さらに読む

• 中島 D、岡崎 N、山川 H、菊野 R、大原 O、長瀬 T (2002 年 6 月)。「KIAA 遺伝子の発現準備が整った cDNA クローンの構築: 330 個の KIAA cDNA クローンの手動キュレーション」。DNA 研究。9 (3): 99–106 .土井: 10.1093/dnares/9.3.99。PMID  12168954。
• 永瀬 剛志、菊野 亮、石川 紀雄、広澤 正之、小原 修 (2000年2月). 「未同定ヒト遺伝子のコード配列の予測 XVI. 脳由来の新規cDNAクローン150個の完全配列。in vitroで巨大タンパク質をコードする」 . DNA Research . 7 (1): 65– 73. doi : 10.1093/dnares/7.1.65 . PMID  10718198 .
• Liu J, Yao F, Wu R, Morgan M, Thorburn A, Finley RL, Chen YQ (2002年7月). 「DIP13αによるDCCアポトーシスシグナルの媒介」 . The Journal of Biological Chemistry . 277 (29): 26281–5 . doi : 10.1074/jbc.M204679200 . PMID  12011067 .
• Yang L, Lin HK, Altuwaijri S, Xie S, Wang L, Chang C (2003年5月). 「APPLはAkt活性を増強することによりアンドロゲン受容体のトランス活性化を抑制する」 . The Journal of Biological Chemistry . 278 (19): 16820–7 . doi : 10.1074/jbc.M213163200 . PMID  12621049 .
• Miaczynska M, Christoforidis S, Giner A, Shevchenko A, Uttenweiler-Joseph S, Habermann B, Wilm M, Parton RG, Zerial M (2004年2月). 「APPLタンパク質はエンドソーム区画を介してRab5を核シグナル伝達に結びつける」 . Cell . 116 ( 3): 445–56 . doi : 10.1016/S0092-8674(04)00117-5 . PMID  15016378. S2CID  18281503 .
• Nechamen CA, Thomas RM, Cohen BD, Acevedo G, Poulikakos PI, Testa JR, Dias JA (2004年8月). 「ヒト卵胞刺激ホルモン（FSH）受容体はHEK 293細胞においてアダプタータンパク質APPL1と相互作用する：FSHシグナル伝達におけるPI3K経路の関与の可能性」 . Biology of Reproduction . 71 (2): 629–36 . doi : 10.1095/biolreprod.103.025833 . PMID  15070827 .
• Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (2004年8月). 「HeLa細胞核リン酸化タンパク質の大規模解析」 .米国科学アカデミー紀要. 101 (33): 12130–5 . Bibcode : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073/ pnas.0404720101 . PMC  514446. PMID  15302935 .
• Ballif BA, Villén J, Beausoleil SA, Schwartz D, Gygi SP (2004年11月). 「マウス脳発達過程のリン酸化プロテオミクス解析」 . Molecular & Cellular Proteomics . 3 (11): 1093–101 . doi : 10.1074/mcp.M400085-MCP200 . PMID  15345747 .
• ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實・岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ＝グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグ DS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサック S、セケーラ R、ドゥセット・スタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M (2005 年 10 月)。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。自然。437 (7062): 1173– 8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID  16189514 . S2CID  4427026 .
• Mao X, Kikani CK, Riojas RA, Langlais P, Wang L, Ramos FJ, Fang Q, Christ-Roberts CY, Hong JY, Kim RY, Liu F, Dong LQ (2006年5月). 「APPL1はアディポネクチン受容体に結合し、アディポネクチンシグナル伝達と機能を媒介する」. Nature Cell Biology . 8 (5): 516–23 . doi : 10.1038/ncb1404 . PMID  16622416. S2CID  21273764 .
• Li J, Mao X, Dong LQ, Liu F, Tong L (2007年5月). 「ヒトAPPL1のBAR-PHドメインとPTBドメインの結晶構造」 . Structure . 15 (5): 525–33 . doi : 10.1016/j.str.2007.03.011 . PMID  17502098 .
• Zhu G, Chen J, Liu J, Brunzelle JS, Huang B, Wakeham N, Terzyan S, Li X, Rao Z, Li G, Zhang XC (2007年7月). 「APPL1 BAR-PHドメインの構造とRab5との相互作用特性」 . The EMBO Journal . 26 (14): 3484–93 . doi : 10.1038/sj.emboj.7601771 . PMC  1933402. PMID  17581628 .
• Saito T, Jones CC, Huang S, Czech MP, Pilch PF (2007年11月). 「AktとAPPL1の相互作用はインスリン刺激によるGlut4の転座に必要である」 . The Journal of Biological Chemistry . 282 (44): 32280–7 . doi : 10.1074/jbc.M704150200 . PMID  17848569 .

外部リンク

• UCSC ゲノム ブラウザのヒトAPPL1ゲノムの位置とAPPL1遺伝子の詳細ページ。