ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
| GCM1 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オーソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | GCM1、GCMA、hGCMa、ホモログ1を欠損したグリア細胞、転写因子1を欠損したグリア細胞 |
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| 外部ID | オミム:603715; MGI : 108045;ホモロジーン: 2702;ジーンカード:GCM1; OMA :GCM1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | 9番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 9 E1|9 43.49 cM | 始める | 77,959,206 bp [2] |
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| 終わり | 77,972,906 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - 胎盤
- 脱落膜
- 睾丸
- 精子
- 血
- 腎臓尿細管
- 人間の腎臓
- ランゲルハンス島
- 白血球
- 後腎
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| | 上位の表現 | - 合胞体栄養芽細胞
- 胚
- 近位尿細管
- 右腎臓
- 卵黄嚢
- 栄養芽層巨細胞
- 腰椎神経節
- 人間の腎臓
- 後腎
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS |  | | より多くの参照表現データ |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- DNA結合
- DNA結合転写因子活性
- 亜鉛イオン結合
- DNA結合転写活性化因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
- 転写因子結合
- ヒストン脱アセチル化酵素結合
- 金属イオン結合
- RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合
- タンパク質結合
- DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
| | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- 転写の制御、DNAテンプレート
- 解剖学的構造の形態形成
- 細胞膜融合によるシンシチウム形成の正の制御
- RNAポリメラーゼIIによる転写
- 転写、DNAテンプレート
- 多細胞生物の発達
- 迷路層の形態形成に関与する分岐
- アストロサイトの運命決定
- RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御
- グリア新生
- 胎児胎盤の発達に関与する細胞分化の調節
- 胎児胎盤の発達に関与する細胞分化
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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絨毛膜特異的転写因子GCMaは、ヒトではGCM1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
この遺伝子は、gcmモチーフ(グリア細胞欠損モチーフ)を持つDNA結合タンパク質をコードしています。このタンパク質は、ショウジョウバエのグリア細胞欠損遺伝子(gcm)のホモログです。このタンパク質は、DNA結合タンパク質の既知の標的配列の中でも新規なGCMモチーフ(A/G)CCCGCATに結合します。N末端DNA結合ドメインは、このタンパク質に特有のDNA結合活性を付与します。[6]
癌患者では、GCM1の発現は癌の種類に応じて生存率の上昇と低下の両方と関連付けられている。[7]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000137270 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000023333 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ Akiyama Y, Hosoya T, Poole AM, Hotta Y (1997年1月). 「GCMモチーフ:ショウジョウバエと哺乳類で保存されている新規DNA結合モチーフ」Proc Natl Acad Sci USA . 93 (25): 14912–6 . doi : 10.1073/pnas.93.25.14912 . PMC 26236 . PMID 8962155.
- ^ ab 「Entrez Gene: GCM1グリア細胞にホモログ1が欠落している(ショウジョウバエ)」。
- ^ 「MCMチームによる研究アップデート(2025年1月)」World Community Grid、2025年1月21日。 2025年1月21日閲覧。
さらに読む
- 山田 憲治、小川 秀、本田 誠、他 (1999). 「GCMモチーフタンパク質はヒトアロマターゼ遺伝子の胎盤特異的発現に関与する」J. Biol. Chem . 274 (45): 32279–86 . doi : 10.1074/jbc.274.45.32279 . PMID 10542267.
- Nait-Oumesmar B, Copperman AB, Lazzarini RA (2000). 「ヒトGcm1遺伝子の胎盤発現と染色体局在」. J. Histochem. Cytochem . 48 (7): 915–22 . doi : 10.1177/002215540004800704 . PMID 10858268.
- 山田 憲治、小川 浩、田宮 剛、他 (2001). 「胎盤特異的転写因子遺伝子 GCMa/GCM1 のゲノム構成、染色体局在、および 22 kb DNA 完全配列」Biochem. Biophys. Res. Commun . 278 (1): 134–9 . doi :10.1006/bbrc.2000.3775. PMID 11071865.
- Yu C, Shen K, Lin M, et al. (2003). 「GCMaはシンシチンを介した栄養膜融合を制御する」J. Biol. Chem . 277 (51): 50062–8 . doi : 10.1074/jbc.M209316200 . PMID 12397062.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK, et al. (2003). 「ヒト6番染色体のDNA配列と解析」. Nature . 425 (6960): 805–11 . Bibcode :2003Natur.425..805M. doi : 10.1038/nature02055 . PMID 14574404.
- Chen CP, Chen CY, Yang YC, et al. (2005). 「妊娠中毒症における胎盤GCM1(グリア細胞欠損)遺伝子発現の低下」. Placenta . 25 (5): 413–21 . doi :10.1016/j.placenta.2003.10.014. PMID 15081636.
- Baczyk D, Satkunaratnam A, Nait-Oumesmar B, et al. (2004). 「ヒト胎盤の絨毛および絨毛外栄養芽細胞におけるGCM1 mRNAおよびタンパク質の複雑なパターン」. Placenta . 25 (6): 553–9 . doi :10.1016/j.placenta.2003.12.004. PMID 15135239.
- Schubert SW, Kardash E, Khan MA, et al. (2005). 「GCMaとPitx2の相互作用、協調的プロモーター調節、および腎臓における共局在」J. Biol. Chem . 279 (48): 50358–65 . doi : 10.1074/jbc.M404587200 . PMID 15385555.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大:哺乳類遺伝子コレクション(MGC)」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
- Yang CS, Yu C, Chuang HC, et al. (2005). 「FBW2はGCMaをユビキチン-プロテアソーム分解系に誘導する」J. Biol. Chem . 280 (11): 10083–90 . doi : 10.1074/jbc.M413986200 . PMID 15640526.
- Knerr I, Schubert SW, Wich C, et al. (2005). 「常酸素圧および低酸素圧条件下におけるヒト栄養芽細胞におけるcAMPを介したPKAシグナル伝達によるGCMaおよびシンシチンの刺激」FEBS Lett . 579 (18): 3991–8 . doi :10.1016/j.febslet.2005.06.029. PMID 16004993. S2CID 46648257.
- Chang CW, Chuang HC, Yu C, et al. (2005). 「サイクリックAMP/プロテインキナーゼAシグナル伝達によるGCMa転写活性の刺激は、CBPを介したGCMaのアセチル化に起因する」. Mol. Cell. Biol . 25 (19): 8401–14 . doi :10.1128/MCB.25.19.8401-8414.2005. PMC 1265739. PMID 16166624 .
- Chuang HC, Chang CW, Chang GD, et al. (2006). 「ヒストン脱アセチル化酵素3はGCMa転写因子に結合し、その制御を行う」Nucleic Acids Res . 34 (5): 1459–69 . doi :10.1093/nar/gkl048. PMC 1401512 . PMID 16528103.
- 藤戸 暢、佐村 修、三春 暢、他 (2007). 「妊娠中毒症の母親における胎盤特異的遺伝子1(PLAC1)およびグリア細胞欠損遺伝子1(GCM1)の血漿mRNAの増加」.広島医学科学誌. 55 (1): 9– 15. PMID 16594548.
- Chou CC, Chang C, Liu JH, et al. (2007). 「小さなユビキチン様修飾因子は、ショウジョウバエホモログaを欠損したグリア細胞のDNA結合活性を制御する。」J. Biol. Chem . 282 (37): 27239–49 . doi : 10.1074/jbc.M700351200 . PMID 17646165.