ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
| DLGAP1 |
|---|
|
| 識別子 |
|---|
| エイリアス | DLGAP1、DAP-1、DAP-1-ALPHA、DAP-1-BETA、DAP1、DLGAP1A、DLGAP1B、GKAP、SAPAP1、hGKAP、ディスクラージホモログ関連タンパク質1、DLG関連タンパク質1 |
|---|
| 外部ID | オミム:605445; MGI : 1346065;ホモロジーン: 31258;ジーンカード:DLGAP1; OMA :DLGAP1 - オルソログ |
|---|
|
| 遺伝子の位置(マウス) |
|---|
 | | キリスト | 17番染色体(マウス)[2] |
|---|
| | バンド | 17 E1.3|17 40.85 cM | 始める | 70,276,068 bp [2] |
|---|
| 終わり | 71,128,408 bp [2] |
|---|
|
| RNA発現パターン |
|---|
| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
|---|
| 上位の表現 | - ブロードマン野23
- 内皮細胞
- 一次視覚野
- 前頭前皮質
- 橋
- 背外側前頭前皮質
- ブロードマン領域9
- 頭頂葉
- 上前頭回
- 右前頭葉
|
| | 上位の表現 | - 梨状皮質
- 鉤状部
- 一次運動野
- 帯状回
- 海馬の区分
- 海馬固有部I領域
- 外側中隔核
- 小脳虫部
- 小脳葉
- 前扁桃体領域
|
| | より多くの参照表現データ |
|
|---|
| バイオGPS | 
 | | より多くの参照表現データ |
|
|---|
|
| 遺伝子オントロジー |
|---|
| 分子機能 |
- タンパク質結合
- タンパク質ドメイン特異的結合
- タンパク質含有複合体結合
| | 細胞成分 |
- 細胞接合
- シナプス後膜
- シナプス後密度
- 膜
- 細胞膜
- シナプス
- 細胞成分
| | 生物学的プロセス | | | 出典:Amigo / QuickGO |
|
| オーソログ |
|---|
| 種 | 人間 | ねずみ |
|---|
| エントレズ | | |
|---|
| アンサンブル | | |
|---|
| ユニプロット | | |
|---|
| RefSeq (mRNA) | NM_001003809 NM_001242761 NM_001242762 NM_001242763 NM_001242764
|
|---|
NM_001242765 NM_001242766 NM_001308390 NM_004746 |
| NM_001128180 NM_001128181 NM_027712 NM_177639 NM_001347411
|
|---|
NM_001347412 NM_001347413 NM_001347414 NM_001360665 |
|
|---|
| RefSeq(タンパク質) | NP_001003809 NP_001229690 NP_001229691 NP_001229692 NP_001229693
|
|---|
NP_001229694 NP_001229695 NP_001295319 NP_004737 |
| NP_001121652 NP_001121653 NP_001334340 NP_001334341 NP_001334342
|
|---|
NP_001334343 NP_081988 NP_808307 NP_001347594 |
|
|---|
| 場所(UCSC) | 18章: 3.5 – 4.46 MB | 17章: 70.28 – 71.13 Mb |
|---|
| PubMed検索 | [3] | [4] |
|---|
|
| ウィキデータ |
|
ディスクラージ関連タンパク質1(DAP-1 )は、グアニル酸キナーゼ関連タンパク質(GKAP)としても知られ、ヒトではDLGAP1遺伝子によってコードされるタンパク質です。DAP-1は脳のシナプトソーム標本に多く存在し、シナプス後密度に存在することが知られています。[5]
関数
この遺伝子は、グアニル酸キナーゼ関連タンパク質(GKAP)と呼ばれるタンパク質をコードしています。GKAPはSHANK2およびPSD-95タンパク質に結合し、ニューロンのシナプス後密度の形成を促進します。[6] Dlgap1は、14アミノ酸からなる5つのリピート配列と、3つのプロテインリッチ領域を有しています。
相互作用
DLGAP1 は以下と相互作用することが示されています。
PSD95およびS-SCAMとの相互作用はGUKドメイン[13]によって媒介され、これが他のGUK含有タンパク質とも相互作用する可能性があることを意味しているのではないかと仮説が立てられている。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000170579 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000003279 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「Entrez Gene: DLGAP1 ディスク、大型 (ショウジョウバエ) ホモログ関連タンパク質 1」。
- ^ Hines RM, El-Husseini A (2006). 「シナプスにおける神経タンパク質のクラスタリングを制御するメカニズム」El-Husseini A, Dityatev A (編).シナプス形成の分子メカニズムベルリン: Springer. pp. 72– 75. ISBN 978-0-387-32560-6。
- ^ ab Takeuchi M, Hata Y, Hirao K, Toyoda A, Irie M, Takai Y (1997年5月). 「SAPAPs. シナプス後密度に局在するPSD-95/SAP90関連タンパク質ファミリー」. J. Biol. Chem . 272 (18): 11943–51 . doi : 10.1074/jbc.272.18.11943 . PMID 9115257.
- ^ ab Satoh K, Yanai H, Senda T, Kohu K, Nakamura T, Okumura N, Matsumine A, Kobayashi S, Toyoshima K, Akiyama T (1997年6月). 「DAP-1はhDLGおよびPSD-95のグアニル酸キナーゼ様ドメインと相互作用する新規タンパク質である」. Genes Cells . 2 (6): 415–24 . doi : 10.1046/j.1365-2443.1997.1310329.x . PMID 9286858.
- ^ ab Wu H, Reissner C, Kuhlendahl S, Coblentz B, Reuver S, Kindler S, Gundelfinger ED, Garner CC (2000年11月). 「分子内相互作用がSAP97のGKAPへの結合を制御する」. EMBO J. 19 ( 21): 5740–51 . doi :10.1093/emboj/19.21.5740. PMC 305801. PMID 11060025 .
- ^ ab Kim E, Naisbitt S, Hsueh YP, Rao A, Rothschild A, Craig AM, Sheng M (1997年2月). 「GKAPは、PSD-95/SAP90ファミリーのチャネルクラスター分子のグアニル酸キナーゼ様ドメインと相互作用する新規シナプスタンパク質である」. J. Cell Biol . 136 (3): 669– 78. doi :10.1083/jcb.136.3.669. PMC 2134290. PMID 9024696 .
- ^ abcd Naisbitt S, Valtschanoff J, Allison DW, Sala C, Kim E, Craig AM, Weinberg RJ, Sheng M (2000年6月). 「シナプス後密度95/グアニル酸キナーゼドメイン関連タンパク質複合体とミオシンVおよびダイニンの軽鎖との相互作用」. J. Neurosci . 20 (12): 4524–34 . doi : 10.1523/JNEUROSCI.20-12-04524.2000 . PMC 6772433. PMID 10844022 .
- ^ ab Boeckers TM, Winter C, Smalla KH, Kreutz MR, Bockmann J, Seidenbecher C, Garner CC, Gundelfinger ED (1999年10月). 「プロリンリッチシナプス関連タンパク質ProSAP1およびProSAP2は、SAPAP/GKAPファミリーのシナプスタンパク質と相互作用する」. Biochem. Biophys. Res. Commun . 264 (1): 247– 52. Bibcode :1999BBRC..264..247B. doi :10.1006/bbrc.1999.1489. PMID 10527873.
- ^ Hirao K, Hata Y, Ide N, Takeuchi M, Irie M, Yao I, et al. (1998). 「N-メチル-D-アスパラギン酸受容体および神経細胞接着タンパク質と相互作用する新規PDZドメイン含有分子」J Biol Chem . 273 (33): 21105–10 . doi : 10.1074/jbc.273.33.21105 . PMID 9694864.
さらに読む
- Kim E, Naisbitt S, Hsueh YP, et al. (1997). 「GKAPは、PSD-95/SAP90ファミリーのチャネルクラスター分子のグアニル酸キナーゼ様ドメインと相互作用する新規シナプスタンパク質である」. J. Cell Biol . 136 (3): 669–78 . doi :10.1083/jcb.136.3.669. PMC 2134290. PMID 9024696 .
- 竹内 正之、畑 勇、平尾 健、他 (1997). 「SAPAPs. シナプス後密度に局在するPSD-95/SAP90関連タンパク質ファミリー」. J. Biol. Chem . 272 (18): 11943–51 . doi : 10.1074/jbc.272.18.11943 . PMID 9115257.
- Naisbitt S, Kim E, Weinberg RJ, et al. (1997). 「興奮性シナプスにおいてシナプス後肥厚部タンパク質であるグアニル酸キナーゼ関連タンパク質の特性解析。このタンパク質はシナプス後肥厚部タンパク質95/シナプス関連タンパク質90と直接相互作用する。」J. Neurosci . 17 (15): 5687–96 . doi : 10.1523/JNEUROSCI.17-15-05687.1997 . PMC 6573205. PMID 9221768 .
- Satoh K, Yanai H, Senda T, et al. (1997). 「hDLGおよびPSD-95のグアニル酸キナーゼ様ドメインと相互作用する新規タンパク質、DAP-1」. Genes Cells . 2 (6): 415–24 . doi : 10.1046/j.1365-2443.1997.1310329.x . PMID 9286858.
- Hirao K, Hata Y, Ide N, et al. (1998). 「N-メチル-D-アスパラギン酸受容体および神経細胞接着タンパク質と相互作用する新規な多重PDZドメイン含有分子」. J. Biol. Chem . 273 (33): 21105–10 . doi : 10.1074/jbc.273.33.21105 . PMID 9694864.
- Deguchi M, Hata Y, Takeuchi M, et al. (1998). 「BEGAIN(脳濃縮グアニル酸キナーゼ関連タンパク質)、新規神経細胞PSD-95/SAP90結合タンパク質」J. Biol. Chem . 273 (41): 26269–72 . doi : 10.1074/jbc.273.41.26269 . PMID 9756850.
- 川辺 浩、畑 勇、竹内 正之、他 (1999). 「nArgBP2は、シナプス関連タンパク質90/シナプス後密度95関連タンパク質(SAPAP)と相互作用するポンシン/ArgBP2/ビネキシンファミリーの新規神経タンパク質である」. J. Biol. Chem . 274 (43): 30914–8 . doi : 10.1074/jbc.274.43.30914 . PMID 10521485.
- Boeckers TM, Winter C, Smalla KH, et al. (1999). 「プロリンリッチシナプス関連タンパク質ProSAP1およびProSAP2は、SAPAP/GKAPファミリーのシナプスタンパク質と相互作用する」Biochem. Biophys. Res. Commun . 264 (1): 247– 52. Bibcode :1999BBRC..264..247B. doi :10.1006/bbrc.1999.1489. PMID 10527873.
- Naisbitt S, Valtschanoff J, Allison DW, et al. (2000). 「シナプス後密度95/グアニル酸キナーゼドメイン関連タンパク質複合体とミオシンVおよびダイニンの軽鎖との相互作用」J. Neurosci . 20 (12): 4524–34 . doi : 10.1523/JNEUROSCI.20-12-04524.2000 . PMC 6772433 . PMID 10844022.
- Wu H, Reissner C, Kuhlendahl S, et al. (2000). 「分子内相互作用がSAP97のGKAPへの結合を制御する」. EMBO J. 19 ( 21): 5740–51 . doi :10.1093/emboj/19.21.5740. PMC 305801. PMID 11060025 .
- 原口 功、佐藤 功、柳井 秀、他 (2001). 「hDLG関連タンパク質DAPはダイニン軽鎖および神経型一酸化窒素合成酵素と相互作用する」. Genes Cells . 5 (11): 905– 911. doi : 10.1046/j.1365-2443.2000.00374.x . PMID 11122378.
- Lo KW, Naisbitt S, Fan JS, et al. (2001). 「8kDaダイニン軽鎖は保存された(K/R)XTQTモチーフを介して標的に結合する」J. Biol. Chem . 276 (17): 14059–66 . doi : 10.1074/jbc.M010320200 . PMID 11148209.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- Im YJ, Lee JH, Park SH, et al. (2004). 「Shank PDZ-リガンド複合体の結晶構造はクラスI PDZ相互作用と新規PDZ-PDZ二量体形成を明らかにする」J. Biol. Chem . 278 (48): 48099–104 . doi : 10.1074/jbc.M306919200 . PMID 12954649.
- Ballif BA, Villén J, Beausoleil SA, et al. (2005). 「マウス脳発達過程のリン酸化プロテオミクス解析」Mol. Cell. Proteomics . 3 (11): 1093– 101. doi : 10.1074/mcp.M400085-MCP200 . PMID 15345747.
- 鈴木 剛、李 和、張 英二、他 (2005). 「新規足場タンパク質TANCは、ショウジョウバエのrolling pebbles(rols)のラットホモログである可能性があり、様々なシナプス後肥厚部タンパク質と多タンパク質複合体を形成する」Eur. J. Neurosci . 21 (2): 339–50 . doi :10.1111/j.1460-9568.2005.03856.x. PMID 15673434. S2CID 28773407.
- Sabio G ; Arthur JS; Kuma Y; et al. (2005). 「p38gammaはGKAPとの相互作用を調節することにより、細胞骨格におけるSAP97の局在を制御する」EMBO J. 24 ( 6): 1134–45 . doi :10.1038/sj.emboj.7600578. PMC 556394. PMID 15729360 .