逆位反復配列欠損クレード

逆位反復配列欠損クレード
ガレガ・オフィシナリス
科学的分類この分類を編集する
王国： 植物界
クレード: 維管束植物
クレード: 被子植物
クレード: 真正双子
クレード: ロシド類
注文： ファバレス
家族： マメ科
亜科: ファボイデア科
クレード: メソパピリオン科
クレード: 非タンパク質アミノ酸蓄積系統
クレード: ホロガレギナ
クレード: 逆反復欠損クレード(Wojciechowski et al . 2000, [ 1 ] 2004 [ 2 ] ) Wojciechowski 2013 [ 3 ]
部族[ 1 ] [ 5 ]
同義語
  • Galegeae sensu lato sensuポールヒル、1981
  • IR欠乏クレード
  • IRLC
  • 温帯草本クレード
  • THC

逆位反復配列欠損系統（IRLC）は、顕花植物亜科マメ科の非公式な単系統系統である。この系統のよく知られたメンバーには、ヒヨコマメ、ソラマメ、カラスノエンドウ、レンズマメ、エンドウ豆、フジ、アルファルファ、クローバー、フェヌグリーク、リコリス、ロコウィードなどがある。この系統の名称は非公式であり、ICBNやICPNが認可した名称のような特定の分類上の順位があるとは考えられていない。[ 3 ]この系統は、ほとんどの陸上植物に見られるプラスチドゲノムの2つの25kb逆位反復配列のうちの1つを欠損していることを特徴とする。[ 6 ]これは分子系統発生において一貫して解明されている。[ 1 ] [ 2 ] [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ]この系統群は、3900万±240万年前（始新世）に他のマメ科植物の系統から分岐したと予測されている。[ 14 ]これには、Astragalus、Hedysarum、Medicago、Oxytropis、Swainsona、Trifoliumなどのいくつかの大型の温帯属が含まれる。

説明

この系統群は、5つの伝統的な族（Cicereae、Fabeae、Galegeae、Hedysareae、Trifolieae）と、伝統的にMillettieae族に配置されていたいくつかの属（Afgekia、Callerya、Endosamara、Sarcodum、Wisteria、およびおそらくAntheroporum）で構成されています。[ 3 ]これらの属の最初の5つはWisterieae族に移動されたため、改訂によりMillettieae族はIRLC系統群の外側に含まれます。[ 4 ]この系統群は次のように定義されます。

「最も包括的なクラウンクレードは、ガレガ・オフィシナリス、グリチルリザ・レピドタ、ソラマメに見られるものと相同なプラスチドゲノムの構造変異（約25kbの逆位反復領域の1つのコピーの喪失）を示しており、これらの分類群は、この名前で定義されたクラウンクレードに含まれる現生種である。」[ 3 ]

用途

この系統群には、エンドウ豆、レンズ豆、ひよこ豆、甘草、アルファルファなどの食用植物が含まれます。

参考文献

  1. ^ a b c Wojciechowski MF, Sanderson MJ, Steele KP, Liston A (2000). 「パピリオノイドマメ科植物の『温帯草本族』の分子系統学：スーパーツリーアプローチ」 Herendeen PS, Bruneau A (編). 『マメ科植物系統学の進歩 第9部』キュー王立植物園. pp.  277– 298. ISBN 184246017X. 2014年1月16日にオリジナル（PDF）からアーカイブ。2014年1月16日閲覧。
  2. ^ a b Wojciechowski MF, Lavin M, Sanderson MJ (2004). 「プラスチドmatK遺伝子の解析に基づくマメ科植物（マメ科）の系統発生は、科内の多くのよく支持されているサブクレードを解明する」 Am J Bot . 91 (11): 1846– 1862. Bibcode : 2004AmJB...91.1846W . doi : 10.3732/ajb.91.11.1846 . PMID 21652332 . 
  3. ^ a b c dウォイチェホフスキ MF. （2013年）。「マメ科の新しい分類に向けて: 非リンネ式系統命名法を使用したクレードの命名」。S Afr J ボット。89 : 85– 93。Bibcode : 2013SAJB...89...85W。土井：10.1016/j.sajb.2013.06.017。
  4. ^ a b Compton, James A.; Schrire, Brian D.; Könyves, Kálmán; Forest, Félix; Malakasi, Panagiota; Sawai Mattapha & Sirichamorn, Yotsawate (2019). 「Calleryaグループの再定義とWisterieae族（Fabaceae）の修正：形態と核および葉緑体DNA配列データに基づく」 . PhytoKeys ( 125): 1– 112. Bibcode : 2019PhytK.125....1C . doi : 10.3897/phytokeys.125.34877 . PMC 6610001. PMID 31303810 .  
  5. ^ a b Cardoso D, Pennington RT, de Queiroz LP, Boatwright JS, Van Wyk BE, Wojciechowski MF, Lavin M (2013). 「パピリオノイドマメ科植物の深枝関係の再構築」 . S Afr J Bot . 89 : 58– 75. Bibcode : 2013SAJB...89...58C . doi : 10.1016/j.sajb.2013.05.001 . hdl : 10566/3193 .
  6. ^ a b Lavin M, Doyle JJ, Palmer JD (1990). 「マメ科Papilionoideae亜科における葉緑体DNA逆位反復配列の消失の進化的意義」 ( PDF) . Evolution . 44 (2): 390– 402. doi : 10.2307/2409416 . hdl : 2027.42/137404 . JSTOR 2409416. PMID 28564377 .  
  7. ^ Liston A. (1995). 「ポリメラーゼ連鎖反応を用いたマメ科植物葉緑体ゲノムにおける逆位反復配列の消失の調査」 . Crisp MD, Doyle JJ (編). 『マメ科植物系統学の進歩 第7部：系統発生』 . キュー王立植物園, 英国. pp.  31– 40. ISBN 0947643796. 2014年1月17日時点のオリジナルよりアーカイブ。2014年1月16日閲覧。
  8. ^ Käss E, Wink M (1996). 「マメ科植物の分子進化： rbcL配列に基づく3亜科の系統発生」. Biochem Syst Ecol . 24 (5): 365– 378. Bibcode : 1996BioSE..24..365K . doi : 10.1016/0305-1978(96)00032-4 .
  9. ^ Sanderson MJ, Wojciechowski MF (1996). 「温帯マメ科植物クレードにおける多様化率：Astragalus（マメ科）には「これほど多くの種」が存在するのか？」Am J Bot . 83 (11): 1488– 1502. doi : 10.2307/2446103 . JSTOR 2446103 . 
  10. ^ドイル JJ、ドイル JL、バレンジャー JA、ディクソン EE、梶田 T、大橋 H (1997)。「マメ科における葉緑体遺伝子rbcLの系統発生: 分類学的相関と根粒形成の進化への洞察」。Jボットです。84 (4): 541–554。Bibcode : 1997AmJB...84..541D。土井：10.2307/2446030。JSTOR 2446030。PMID 21708606。  
  11. ^ Pennington RT, Lavin M, Ireland H, Klitgaard B, Preston J, Hu JM (2001). 「葉緑体trnLイントロンの配列に基づく基底パピリオン型マメ科植物の系統関係」 Syst Bot . 26 (3): 537– 556. doi : 10.1043/0363-6445-26.3.537 (2025年7月12日現在非アクティブ).{{cite journal}}: CS1 maint: DOIは2025年7月時点で非アクティブです（リンク）
  12. ^ McMahon MM, Sanderson MJ (2006). 「2228種のマメ科植物のGenBank配列の系統学的スーパーマトリックス解析」Syst Biol . 55 (5): 818– 836. doi : 10.1080/10635150600999150 . PMID 17060202 . 
  13. ^ Cardoso D, de Queiroz LP, Pennington RT, de Lima HC, Fonty É, Wojciechowski MF, Lavin M (2012). 「パピリオノイドマメ科植物の系統発生の再考：包括的にサンプリングされた初期分岐系統からの新たな知見」Am J Bot . 99 (12): 1991– 2013. Bibcode : 2012AmJB...99.1991C . doi : 10.3732/ajb.1200380 . PMID 23221500 . 
  14. ^ Lavin M, Herendeen PS, Wojciechowski MF (2005). 「マメ科植物の進化速度解析は、第三​​紀における系統の急速な多様化を示唆している」 . Syst Biol . 54 (4): 575–94 . doi : 10.1080/10635150590947131 . PMID 16085576 . 
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