MARCH6

MARCHF6
識別子
別名	MARCHF6、DOA10、MARCH-VI、RNF176、TEB4、膜結合リングCH型フィンガー6、MARCH6、FAME3
外部ID	OMIM : 613297; MGI : 2442773; HomoloGene : 4301; GeneCards : MARCHF6; OMA :MARCHF6 - オーソログ
遺伝子の位置（ヒト） 染色体 5番染色体（ヒト）[1] バンド 5p15.2 開始 10,353,695 bp [1] 終了 10,440,388 bp [1]
遺伝子の位置（マウス） 染色体 15番染色体（マウス）[2] バンド 15|15 B2 開始 31,456,037 bp [2] 終了 31,531,199 bp [2]
RNA発現パターン Bgee ヒト マウス（相同遺伝子） 最もよく発現している ブロードマン野23 内皮細胞 臀筋 海馬固有領域I 中側頭回 小脳虫部 迷走神経背側運動核 脳梁 橋 中心後回 最もよく発現している 長指伸筋 帯状回 足底筋 外側中隔核 正中隆起 腹内側核 鉤状核 弓状核 扁桃体 前扁桃体領域 より多くの参照発現データ BioGPS 該当なし
遺伝子オントロジー 分子機能 酵素結合 ユビキチン特異的プロテアーゼ結合 亜鉛イオン結合 ユビキチン結合酵素結合 ユビキチンタンパク質リガーゼ活性 金属イオン結合 ユビキチンタンパク質転移酵素活性 転移酵素活性 タンパク質結合 細胞成分 膜の不可欠な成分 小胞体膜の不可欠な構成要素 ERユビキチンリガーゼ複合体 膜 小胞体 小胞体膜 小胞体品質管理コンパートメント 生物学的プロセス タンパク質K48結合ユビキチン化 プロテアソームによるタンパク質分解プロセス ERAD経路 タンパク質ユビキチン化 小胞体マンノーストリミング ユビキチン依存性ERAD経路 プロテアソームを介したユビキチン依存性タンパク質分解プロセス 出典：Amigo / QuickGO
相同遺伝子 種 ヒト マウス アントレ 10299 223455 アンサンブル ENSG00000145495 ENSMUSG00000039100 ユニプロット O60337 Q6ZQ89 RefSeq (mRNA) NM_001270660 NM_001270661 NM_005885 NM_172606 RefSeq（タンパク質） NP_001257589 NP_001257590 NP_005876 NP_766194 NP_001389808 場所（UCSC） Ch5: 10.35～10.44 MB 15章: 31.46 – 31.53 MB PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
人間の表示/編集 マウスの表示/編集

E3ユビキチンタンパク質リガーゼMARCH6は、ヒトではMARCH6遺伝子によってコードされる酵素である。^{[5] [6]}

Excelの遺伝子名エラー

他のMARCH遺伝子やセプチン遺伝子と同様に、MARCH6遺伝子を含む遺伝子データをMicrosoft Excelで解析する際には注意が必要です。^[7]これは、Excelのオートコレクト機能が「MARCH6」というテキストを日付として扱い、標準の日付形式に変換するためです。この変換により元のテキストを復元することはできません。2016年の研究では、選択されたジャーナルに掲載された論文の最大19.6%が遺伝子名エラーの影響を受けていることが分かりました。^[8]この問題は、別名（MARCHF6など）を使用するか、先頭にアポストロフィ（'）を追加するか、セルをテキストとして事前フォーマットすることで回避できます。

参照

• 生物学ポータル

• EC番号一覧（EC 3）

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000145495 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000039100 – Ensembl、2017年5月
3. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Bartee E、Mansouri M、Hovey Nerenberg BT、Gouveia K、Fruh K (2004 年 1 月)。 「ウイルス免疫回避タンパク質に関連するヒトユビキチンリガーゼによる主要組織適合性複合体クラスIの下方制御」。J・ヴィロル。78 (3): 1109–20 .土井:10.1128/JVI.78.3.1109-1120.2004。PMC 321412。PMID  14722266。 
6. 「Entrez Gene: MARCH6膜結合リングフィンガー（C3HC4）6」。
7. Zeeberg BR, Riss J, Kane DW, Bussey KJ, Uchio E, Linehan WM, et al. (2004年6月). 「バイオインフォマティクスにおけるExcelの使用時に、誤った識別子：遺伝子名エラーが誤って導入される可能性がある」. BMC Bioinformatics . 5 (1): 80. doi : 10.1186/1471-2105-5-80 . PMC 459209. PMID  15214961 . 
8. Ziemann M, Eren Y, El-Osta A (2016年8月). 「遺伝子名の誤りは科学文献で広く見られる」. Genome Biology . 17 (1): 177. doi : 10.1186/s13059-016-1044-7 . PMC 4994289. PMID  27552985 . 

さらに読む

• Kreft SG, Wang L, Hochstrasser M (2006). 「酵母小胞体局在ユビキチンリガーゼDoa10の膜トポロジーとヒト相同遺伝子TEB4 (MARCH-VI)との比較」J. Biol. Chem . 281 (8): 4646–53 . doi : 10.1074/jbc.M512215200 . PMID  16373356.
• Hassink G、Kikkert M、van Voorden S 他(2005)。 「TEB4 は、C4HC3 RING フィンガーを含む小胞体のユビキチン リガーゼです。」生化学。 J.​ 388 (Pt 2): 647–55 .土井:10.1042/BJ20041241。PMC  1138973。PMID  15673284。
• Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大：哺乳類遺伝子コレクション（MGC）」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC  528928. PMID 15489334  .
• 太田 剛志、鈴木 雄志、西川 剛志、他 (2004). 「21,243個の完全長ヒトcDNAの完全配列決定と特性解析」Nat. Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID  14702039.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
• Swanson R, Locher M, Hochstrasser M (2001). 「ER関連タンパク質分解とMatalpha2リプレッサー分解の両方に機能する、核膜／小胞体に保存されたユビキチンリガーゼ」Genes Dev . 15 (20): 2660–74 . doi :10.1101/gad.933301. PMC 312819.  PMID 11641273  .
• 長瀬 剛志、石川 功、宮島 暢、他 (1998). 「未同定ヒト遺伝子のコード配列の予測 IX. in vitroで巨大タンパク質をコードできる脳由来の新規cDNAクローン100個の完全配列」DNA Res . 5 (1): 31–9 . doi : 10.1093/dnares/5.1.31 . PMID  9628581.

外部リンク

• UCSC ゲノム ブラウザにおける MARCH6 ヒト遺伝子の位置。
• UCSC ゲノム ブラウザにおける MARCH6 ヒト遺伝子の詳細。