 |
| MDLチャイム | |
|---|---|
| 原作者 | エルゼビア |
| 開発者 | シミックス・テクノロジーズ |
| 初回リリース | 1996年（0.9ベータ版）1997年（1.0フルリリース）[ 1 ] （1996年） （1997年） |
| 安定版リリース | 2.6 SP7 / 2007年7月31日 （2007年7月31日） |
| オペレーティング·システム | クラシックMac OS、Microsoft Windows |
| プラットフォーム | Internet Explorer、Mozilla Firefox |
| Webサイト | http://accelrys.com/products/collaborative-science/biovia-discovery-studio/ |
MDL Chimeは、分子の3次元構造を表示するためにウェブブラウザで使用される無料のプラグインでした。[ 2 ] RasMolコード に基づいていました。[ 3 ]
プラグイン
Chimeは、生化学関連の幅広いウェブサイトで高分子の可視化に使用されており、その多くはWorld Index of Molecular Visualization Resources MolVisIndex.Orgにリンクされていました。Chimeは2006年まで、Protein Data Bank (PDB)に保存されている構造を調べるためにも使用されていました。
Chimeは1996年にはWindows 95とクラシックMac OSの両方でNetscapeとInternet Explorerの両方のブラウザで利用可能でしたが、 Mac OS Xへの移行には追いつかず、Internet Explorer以外のWindowsベースのブラウザのサポートは限られていました（ただし、Mozilla Firefoxでは問題なく動作します）。1997年に追加された重要な機能の一つは、IUPAC JCAMP-DXプロトコル形式で分光データを表示できる機能でした。これ以外では、その後のアップデートのほとんどは、WindowsとInternet Explorerの開発に合わせてインストールパッケージが更新されたものでした。アクセルリス社は2012年に、Chimeのサポートは終了したが、2012年末まではダウンロード可能と発表しました。[ 4 ] Chimeは、 Symyx Technologiesが2007年10月に科学出版社エルゼビアから買収したISIS製品ラインの一部でした。現在、Chimeはダッソー・システムズ・バイオビア（旧アクセルリス社）が所有しており、ディスカバリー・スタジオに統合されていますが、無料のブラウザプラグインとしては存在しなくなりました。
Chimeは、多くの機能を追加しながらもChimeコマンドの互換性をほとんど維持している、非独占的オープンソースJava分子可視化アプリケーションおよびJavaScriptアプレット であるJmol [ 5 ]に大部分置き換えられました。
参照
参考文献
- ^ 「Chime バージョン履歴」。
- ^ Dorland, Liz (2002). 「オンラインからのニュース：Chimeの新機能とは？」J. Chem. Educ. 79 (7): 778. Bibcode : 2002JChEd..79..778D . doi : 10.1021/ed079p778 .
- ^ホジソン、ジョン (1996). 「グラクソ・ウェルカムとMDLがウェブで絡み合う」 .ネイチャー・バイオテクノロジー. 14 (6): 690. doi : 10.1038/nbt0696-690 . S2CID 32321207 .
- ^ CHIME - No Fee 、 2012年4月24日時点のオリジナルよりアーカイブ
- ^ Herráez, A (2006)、「コンピュータにおける生体分子：Jmolの救出」、生化学と分子生物学教育、34 (4): 255– 61、doi : 10.1002/bmb.2006.494034042644、PMID 21638687、S2CID 36319720
外部リンク
- Chime の動作中のスクリーン キャプチャ。
- アクセルリスチャイム
- チャイムダウンロード
- RCSBタンパク質データバンク
- MolviZ.Org:豊富な分子コレクションを備えた分子可視化リソース
- ダブリンシティ大学のCHIMEとJmolのページ
