ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
MDM4 利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2CR8、2VJE、2VJF、2VYR、3DAB、3EQY、3FDO、3FE7、3FEA、3JZO、3JZP、3JZQ、3LBJ、3MQR、3U15、4RXZ、2MWY、2N06、2N0W、2N14、2N0U
識別子 エイリアス MDM4 、HDMX、MDMX、MRP1、p53調節因子、p53のMDM4調節因子、BMFS6 外部ID オミム ：602704; MGI : 107934; ホモロジーン : 1794; ジーンカード ：MDM4; OMA :MDM4 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） キリスト 染色体1（マウス） [2] バンド 1 E4|1 57.75 cM 始める 132,887,222 bp [2] 終わり 132,958,299 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） 上位の表現 乳首 卵母細胞 結腸上皮 海綿骨 太ももの皮膚 幽門 アキレス腱 腓骨神経 噴門 心膜
上位の表現 二次卵母細胞 一次卵母細胞 接合子 性器結節 球形嚢 胚の尾 顆粒球 網膜の神経層 耳板 精母細胞
より多くの参照表現データ
バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能
酵素結合 タンパク質結合 金属イオン結合 ユビキチンタンパク質リガーゼ活性 亜鉛イオン結合 細胞成分 生物学的プロセス
G0からG1への遷移 DNA損傷応答、p53クラスメディエーターによるシグナル伝達 タンパク質の安定化 細胞集団の増殖 アポトーシス過程の負の調節 RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御 低酸素に対する細胞反応 タンパク質分解プロセスの負の調節 細胞集団増殖の負の調節 タンパク質のユビキチン化 DNA損傷応答、p53クラスメディエーターによるシグナル伝達により細胞周期停止に至る p53クラスメディエーターによるシグナル伝達の制御 タンパク質の脱ユビキチン化 タンパク質を含む複合体集合体 心臓弁の発達 房室弁の形態形成 心内膜クッションの形態形成 心室中隔の発達 心房中隔の発達 出典：Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001204171 NM_001204172 NM_001278516 NM_001278517 NM_001278518 NM_001278519 NM_002393
NM_008575 NM_001302801 NM_001302802 NM_001302803 NM_001302804
RefSeq（タンパク質） NP_001191100 NP_001191101 NP_001265445 NP_001265446 NP_001265447 NP_001265448 NP_002384
NP_001289730 NP_001289731 NP_001289732 NP_001289733 NP_032601
場所（UCSC） 1 章: 204.52 – 204.56 Mb 1 章: 132.89 – 132.96 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
タンパク質Mdm4 は、 ヒトでは MDM4 遺伝子によってコードされる タンパク質 である。 [5] [6]
関数 アポトーシス に関与するヒトMDM4遺伝子は、 RINGフィンガードメイン と推定 核局在シグナル を含む490アミノ酸のタンパク質をコードしている。すべてのMdmタンパク質が含むMDM4推定核局在シグナルは、タンパク質の C末端 領域に位置する。mRNAは 胸腺 で高発現し 、試験した他のすべての組織では低発現であった。in vitro翻訳によって産生されたMDM4タンパク質は、 MDM4タンパク質の N末端 領域に位置する結合ドメインを介してp53と相互作用する。MDM4はp53結合タンパク質MDM2と高い構造類似性を示す [6]。
相互作用 MDM4はE2F1 [7] 、 Mdm2 [8 ] [9] [10] [11] 、 P53 [5] [10] と 相互作用する ことが示されている 。
参考文献
^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000198625 – Ensembl 、2017年5月 ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000054387 – Ensembl 、2017年5月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ 「マウスPubMedリファレンス：」。 米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター 。 ^ ab Shvarts A、Bazuine M、Dekker P、Ramos YF、Steegenga WT、Merckx G、van Ham RC、van der Houven van Oordt W、van der Eb AJ、Jochemsen AG (1997 年 9 月)。 「新しい p53 結合タンパク質 Mdmx のヒトホモログの単離と同定」 (PDF) 。 ゲノミクス 。 43 (1): 34–42 . 土井 :10.1006/geno.1997.4775。 hdl : 2066/26148 。 PMID 9226370。S2CID 11794685 。 ^ ab 「Entrez Gene: MDM4 Mdm4、形質転換された3T3細胞二重分4、p53結合タンパク質（マウス）」。 ^ Strachan GD, Jordan-Sciutto KL, Rallapalli R, Tuan RS, Hall DJ (2003年2月). 「E2F-1転写因子はMDMXタンパク質との相互作用によって負に制御される」. J. Cell. Biochem . 88 (3): 557– 68. doi :10.1002/jcb.10318. PMID 12532331. S2CID 38805122. ^ カダキア M、ブラウン TL、マクゴーリー MM、ベルベリッチ SJ (2002 年 12 月)。 「MdmX は Smad トランス活性化を阻害します。」 がん遺伝子 。 21 (57): 8776–85 . 土井 :10.1038/sj.onc.1205993。 PMID 12483531。S2CID 38919290 。 ^ 谷村 誠・大塚 聡・三井 健・白水 健・吉村 明・大坪 正治 (1999年3月). 「MDM2はRINGフィンガードメインを介してMDMXと相互作用する」. FEBS Lett . 447 (1): 5– 9. doi :10.1016/S0014-5793(99)00254-9. PMID 10218570. S2CID 20021952. ^ ab Badciong JC, Haas AL (2002年12月). 「MdmXはMdm2のユビキチン化を相乗的に促進するRINGフィンガーユビキチンリガーゼである」. J. Biol. Chem . 277 (51): 49668–75 . doi : 10.1074/jbc.M208593200 . PMID 12393902. ^ Linke K, Mace PD, Smith CA, Vaux DL, Silke J, Day CL (2008年5月). 「MDM2/MDMX RINGドメインヘテロダイマーの構造は、トランスユビキチン化にはダイマー化が必要であることを示している」. Cell Death Differ . 15 (5): 841–8 . doi : 10.1038/sj.cdd.4402309 . PMID 18219319.
さらに読む
Meulmeester E, Pereg Y, Shiloh Y, Jochemsen AG (2006). 「ATMを介したリン酸化はHAUSPによるMdmx/Mdm2の安定化を阻害し、p53の活性化を促進する」. Cell Cycle . 4 (9): 1166–70 . doi : 10.4161/cc.4.9.1981 . PMID 16082221. 丸山 憲治, 菅野 誠 (1994). 「オリゴキャッピング：真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡便法」. 遺伝子 . 138 ( 1–2 ): 171–4 . doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298. Shvarts A、Steegenga WT、Riteco N、van Laar T、Dekker P、Bazuine M、van Ham RC、van der Houven van Oordt W、Hateboer G、van der Eb AJ、Jochemsen AG (1996)。 「MDMX: MDM2 のいくつかの機能的特性を備えた新規の p53 結合タンパク質」。 エンボ J . 15 (19): 5349–57 . 土井 :10.1002/j.1460-2075.1996.tb00919.x。 PMC 452278 。 PMID 8895579。 鈴木雄三、中川吉智、丸山健、須山明生、菅野誠一 (1997). 「全長エンリッチドcDNAライブラリーおよび5'末端エンリッチドcDNAライブラリーの構築と特性解析」. Gene . 200 ( 1–2 ): 149–56 . doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149. 谷村 聡, 大塚 聡, 三井 健, 白水 健, 吉村 明, 大坪 正之 (1999). 「MDM2はRINGフィンガードメインを介してMDMXと相互作用する」. FEBS Lett . 447 (1): 5– 9. doi :10.1016/S0014-5793(99)00254-9. PMID 10218570. S2CID 20021952. Ongkeko WM, Wang XQ, Siu WY, Lau AW, Yamashita K, Harris AL, Cox LS, Poon RY (1999). 「MDM2とMDMXはp53関連タンパク質p73に結合し安定化する」. Curr. Biol . 9 (15): 829–32 . Bibcode :1999CBio....9..829O. doi : 10.1016/S0960-9822(99)80367-4 . PMID 10469568. S2CID 30064916. Sharp DA, Kratowicz SA, Sank MJ, George DL (2000). 「構造的に関連するMDMXタンパク質との相互作用によるMDM2オンコタンパク質の安定化」 J. Biol. Chem . 274 (53): 38189–96 . doi : 10.1074/jbc.274.53.38189 . PMID 10608892. Jackson MW, Lindstrom MS, Berberich SJ (2001). 「MdmXのARFへの結合はMdm2タンパク質の安定性とp53のトランス活性化に影響を与える」. J. Biol. Chem . 276 (27): 25336–41 . doi : 10.1074/jbc.M010685200 . PMID 11297540. Parant J, Chavez-Reyes A, Little NA, Yan W, Reinke V, Jochemsen AG, Lozano G (2001). 「Mdm4-nullマウスにおけるTrp53欠損による胎生致死の回復は、MDM2と重複しないp53制御経路を示唆している」 Nat. Genet . 29 (1): 92–5 . doi :10.1038/ng714. PMID 11528400. S2CID 5642284. Gentiletti F, Mancini F, D'Angelo M, Sacchi A, Pontecorvi A, Jochemsen AG, Moretti F (2002). 「NIH3T3マウス線維芽細胞におけるMDMXの安定性はp53誘導性カスパーゼ切断によって制御される」. Oncogene . 21 (6): 867–77 . doi :10.1038/sj.onc.1205137. PMID 11840332. S2CID 22179624. Harris RA, Yang A, Stein RC, Lucy K, Brusten L, Herath A, Parekh R, Waterfield MD, O'Hare MJ, Neville MA, Page MJ, Zvelebil MJ (2002). 「ヒト乳がん細胞株タンパク質発現マップデータベースのクラスター分析」. Proteomics . 2 (2): 212– 23. doi :10.1002/1615-9861(200202)2:2<212::AID-PROT212>3.0.CO;2-H. PMID 11840567. S2CID 44946014. Gu J、Kawai H、Nie L、北尾 H、Wiederschain D、Jochemsen AG、Parant J、Lozano G、Yuan ZM (2002)。 「p53の機能的不活化におけるMDM2とMDMXの相互依存性」。 Ｊ．Ｂｉｏｌ．化学 。 277 (22): 19251–4 . 土井 : 10.1074/jbc.C200150200 。 PMID 11953423。 Migliorini D, Lazzerini Denchi E, Danovi D, Jochemsen A, Capillo M, Gobbi A, Helin K, Pelicci PG, Marine JC (2002). 「Mdm4（Mdmx）はマウス初期胚発生におけるp53誘導性成長停止および神経細胞死を制御する」 Mol. Cell. Biol . 22 (15): 5527–38 . doi :10.1128/MCB.22.15.5527-5538.2002. PMC 133932. PMID 12101245 . Wistow G, Bernstein SL, Wyatt MK, Fariss RN, Behal A, Touchman JW, Bouffard G, Smith D, Peterson K (2002). 「NEIBankプロジェクトのためのヒトRPE/脈絡膜の発現配列タグ解析：6000以上の非冗長転写産物、新規遺伝子、およびスプライスバリアント」 Mol. Vis . 8 : 205–20 . PMID 12107410. Sabbatini P, McCormick F (2002). 「MDMXはp300/CBPを介したp53のアセチル化を阻害する」 DNA Cell Biol . 21 (7): 519–25 . doi :10.1089/104454902320219077. PMID 12162806. Li C, Chen L, Chen J (2002). 「DNA損傷はp53依存性および非依存性のメカニズムによりMDMXの核移行を誘導する」 Mol. Cell. Biol . 22 (21): 7562–71 . doi :10.1128/MCB.22.21.7562-7571.2002. PMC 135668. PMID 12370303 . Badciong JC, Haas AL (2003). 「MdmXはMdm2のユビキチン化を相乗的に促進するRINGフィンガーユビキチンリガーゼである」. J. Biol. Chem . 277 (51): 49668–75 . doi : 10.1074/jbc.M208593200 . PMID 12393902. カダキア M、ブラウン TL、マクゴーリー MM、ベルベリッチ SJ (2003)。 「MdmX は Smad トランス活性化を阻害します。」 がん遺伝子 。 21 (57): 8776–85 . 土井 :10.1038/sj.onc.1205993。 PMID 12483531。S2CID 38919290 。
