TAF11

TAF11
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 1BH8、1BH9​​
識別子
エイリアス	TAF11、MGC:15243、TAF2I、TAFII28、PRO2134、TATAボックス結合タンパク質関連因子11
外部ID	オミム: 600772 ; MGI : 1916026 ;ホモロジーン: 55918 ;ジーンカード：TAF11 ; OMA : TAF11 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 6番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 6p21.31 始める 34,877,462 bp [ 1 ] 終わり 34,889,192 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 17番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 17|17 A3.3 始める 28,120,096 bp [ 2 ] 終わり 28,128,818 bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 羊水 脛骨 口腔粘膜細胞 人間のペニス 舌の上側 眼瞼結膜 幽門 乳管 尿道 壁側胸膜 上位の表現 心室帯 接合子 胚の尾 胚 胚 回腸上皮 性器結節 卵黄嚢 顆粒球 二次卵母細胞 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 タンパク質ヘテロ二量体形成活性 転写コアクチベーター活性 タンパク質結合 ビタミンD受容体結合 タンパク質N末端結合 甲状腺ホルモン受容体結合 DNA結合 転写因子結合 細胞成分 ゴルジ体 転写因子TFIID複合体 核 核質 生物学的プロセス RNAポリメラーゼII開始前複合体の組み立て RNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写開始 転写の制御、DNAテンプレート RNAポリメラーゼIIによる転写 ウイルス転写の宿主による正の調節 転写、DNAテンプレート RNAポリメラーゼIIによるsnRNA転写 p53クラスメディエーターによるシグナル伝達の制御 核酸テンプレート転写の正の制御 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 6882 68776 アンサンブル ENSG00000064995 ENSMUSG00000024218 ユニプロット Q15544 Q99JX1 RefSeq (mRNA) NM_001270488 NM_005643 NM_026836 NM_001379368 RefSeq（タンパク質） NP_001257417 NP_005634 NP_081112 NP_001366297 場所（UCSC） 6章: 34.88 – 34.89 Mb 17章28.12～28.13節 PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
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転写開始因子TFIIDサブユニット11は TAFII28としても知られ、ヒトではTAF11遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]}

関数

RNAポリメラーゼIIによる転写の開始には、70種類以上のポリペプチドの活性が必要である。これらの活性を調整するタンパク質は転写因子IID（TFIID）であり、これはコアプロモーターに結合してポリメラーゼを適切な位置に配置し、転写複合体の残りの部分を組み立てるための足場として機能し、制御シグナルのチャネルとして機能する。TFIIDは、TATA結合タンパク質（TBP）と、TBP関連因子（TAF）として知られる進化的に保存されたタンパク質群から構成される。TAFは、基礎転写に関与したり、コアクチベーターとして機能したり、プロモーター認識に機能したり、あるいは一般転写因子（GTF）を修飾して複合体の組み立てと転写開始を促進したりする。この遺伝子は、すべてのTFIID複合体に存在し、TBPと相互作用するTFIIDの小サブユニットをコードしている。このサブユニットは、別の小サブユニットであるTAF13とも相互作用し、ヒストンコア構造に類似した構造を持つヘテロ二量体を形成する。^{[ 7 ]}

タフィI28
結合したPCMBを含むhtafii18/htafii28ヘテロダイマーの結晶構造
識別子
シンボル	タフィI28
ファム	PF04719
ファム一族	CL0012
インタープロ	IPR006809
SCOP2	1bh9 /スコープ/ SUPFAM
利用可能なタンパク質構造: PDB   IPR006809 PF04719 ( ECOD ; PDBsum )   アルファフォールド IPR006809 PF04719

分子生物学において、TAFII28はTATAボックス結合タンパク質関連因子を指します。TATA結合タンパク質および他のTAFと共に、転写因子TFIIDを形成します。これらは共に転写開始前複合体の形成に関与します。保存領域は、ほとんどのメンバータンパク質のC末端に存在します。

構造

hTAFII28とhTAFII18の結晶構造は、この領域がこれら2つのサブユニットの結合に関与していることを示しています。この保存領域には、ヒストンH3と同様に配置された4つのαヘリックスと3つのループが含まれています。^{[ 5 ] [ 8 ]}

相互作用

TAF11 は以下と相互作用することが示されています。

• GTF2F1 , ^{[ 9 ]}
• POLR2A ^{[ 9 ]}および
• TAF13、^{[ 5 ] [ 8 ]}
• TAF15 , ^{[ 10 ]}
• TATA結合タンパク質、^{[ 5 ] [ 11 ] [ 12 ]} および
• ^転写因子IIB [ ^{9 ]}

参考文献

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さらに読む

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