APAF1

APAF1
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 1C15 , 1CWW , 1CY5 , 1Z6T , 2P1H , 2YGS , 3J2T , 3YGS , 4RHW , 3JBT
識別子
エイリアス	APAF1、APAF-1、CED4、アポトーシスペプチダーゼ活性化因子1
外部ID	オミム: 602233 ; MGI : 1306796 ;ホモロジーン: 7626 ;ジーンカード: APAF1 ; OMA : APAF1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 12番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 12q23.1 始める 98,645,290 bp [ 1 ] 終わり 98,735,433 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 10番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 10 C2|10 45.47 cM 始める 90,989,311 bp [ 2 ] 終わり 91,082,770 bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 単球 心室帯 血 骨髄細胞 神経節隆起 結腸上皮 顆粒球 アキレス腱 海綿骨 睾丸 上位の表現 顆粒球 真皮 移動性腸管神経堤細胞 尿管 空腸 精管 耳小胞 骨髄間質 原腸胚 回腸 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 熱ショックタンパク質結合 ADP結合 タンパク質結合 同一のタンパク質結合 ATP結合 ヌクレオチド結合 アポトーシス過程に関与するシステイン型エンドペプチダーゼ活性化因子活性 細胞成分 細胞質 細胞質 細胞外エクソソーム 核 アポトソーム 細胞外領域 分泌顆粒腔 フィコリン-1に富む顆粒腔 タンパク質含有複合体 生物学的プロセス トランスフォーミング成長因子β刺激に対する細胞応答 ニューロンのアポトーシス過程 アポトーシス過程の調節 細胞分化 低酸素症への反応 栄養素への反応 G1 DNA損傷チェックポイントシグナル伝達への応答 エージング アポトーシスシグナル伝達経路の正の調節 グリア細胞のアポトーシス過程 神経系の発達 多細胞生物の発達 心筋細胞のアポトーシス過程 内因性アポトーシスシグナル伝達経路 小胞体ストレスに対する内因性アポトーシスシグナル伝達経路 神経管閉鎖 脳の発達 アポトーシス過程の正の調節 アポトーシスシグナル伝達経路 前脳の発達 アポトーシスDNA断片化の調節 タンパク質ホモオリゴマー化 アポトーシス過程に関与するシステイン型エンドペプチダーゼ活性の活性化 シトクロムcによるアポトーシス過程に関与するシステイン型エンドペプチダーゼ活性の活性化 アポトーシス過程 好中球脱顆粒 G0からG1への遷移の負の制御 腎臓の発達 出典：Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 317 11783 アンサンブル ENSG00000120868 ENSMUSG00000019979 ユニプロット O14727 O88879 RefSeq (mRNA) NM_001160 NM_013229 NM_181861 NM_181868 NM_181869 NM_001042558 NM_001282947 NM_009684 RefSeq（タンパク質） NP_001151 NP_037361 NP_863651 NP_863658 NP_863659 NP_001036023 NP_001269876 NP_033814 場所（UCSC） 12章: 98.65 – 98.74 Mb 10章: 90.99 – 91.08 Mb PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
人間の表示/編集 マウスの表示/編集

アポトーシスプロテアーゼ活性化因子1 （ APAF1とも呼ばれる）は、 C.エレガンスのCED-4遺伝子のヒト相同遺伝子である。 ^{[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]}

関数

このタンパク質は、シトクロム c および dATP の存在下でのカスパーゼ 3 の活性化因子として、Xiaodong Wangの研究室で同定されました。 ^{[ 8 ]}この遺伝子は、アポトーシス調節ネットワークの中心的なハブの 1 つを形成する細胞質タンパク質をコードしています。このタンパク質は、（N 末端から）カスパーゼリクルートドメイン（CARD）、ATPaseドメイン（ NB-ARC ）、いくつかの短いヘリカルドメイン、およびWD40 反復ドメインのいくつかのコピーを含みます。シトクロム cおよびdATPに結合すると、このタンパク質はオリゴマーのアポトーソームを形成します。アポトーソームはプロカスパーゼ 9タンパク質に結合して切断し、その成熟した活性化フォームを放出します。この反応の正確なメカニズムはまだ議論されていますが、 Guy Salvesenによって発表された研究では、アポトーソームがカスパーゼ 9 の二量体化とそれに続く自己触媒作用を誘導する可能性が示唆されています。^{[ 9 ]}活性化カスパーゼ9は、細胞をアポトーシスに導くカスパーゼカスケードを刺激する。

選択的スプライシングの結果、異なるアイソフォームをコードする複数の転写産物変異体が生じる。^{[ 5 ]}

構造

APAF1は、6つのヘリックスからなるギリシャキーモチーフを持つCARDドメイン、ロスマンフォールドヌクレオチド結合ドメイン、短いヘリックスモチーフ、および翼状ヘリックスドメインを含む。 ^{[ 10 ]}

相互作用

APAF1 は以下と相互作用することが示されています。

• APIP , ^{[ 11 ]}
• BCL2様1 ^{[ 12 ] [ 13 ]}
• カスパーゼ9、^{[ 14 ] [ 11 ] [ 15 ] [ 12 ] [ 13 ]}
• HSPA4、^{[ 16 ]}および
• NLRP1 ^{[ 14 ]}​

参考文献

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さらに読む

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