23SメチルRNAモチーフ
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| 23SメチルRNAモチーフ | |
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| 識別子 | |
| シンボル | 23S-メチル |
| Rfam | RF01065 |
| その他のデータ | |
| RNA型 | シス-reg |
| ドメイン | 細菌 |
| それで | SO:0005836 |
| PDB構造 | PDBe |
23SメチルRNAモチーフは、 rRNAメチルトランスフェラーゼをコードすると予測される遺伝子の上流に位置する保存されたRNA構造で、おそらく23S rRNAに由来すると考えられる。[ 1 ] しかし、あるケースでは、rRNAメチルトランスフェラーゼ遺伝子から3キロベースも離れている。それでも、このRNAがシス調節要素である可能性が提案された。rRNAメチルトランスフェラーゼはRNAに結合できるため、おそらく23SメチルRNAにも結合すると考えられるため、これは魅力的な仮説である。この調節戦略は細菌においてリボソームリーダーと呼ばれるRNAモチーフを用いてリボソームサブユニットのレベルを制御するのに一般的である。さらに、23SメチルRNAは下流にrho非依存性転写終結因子を有しており、これが調節機構となっている可能性がある。[ 1 ]
23SメチルRNAは、ラクトバシラ目と呼ばれる細菌群にのみ存在します。[ 1 ]
参考文献
- ^ a b c Weinberg Z, Barrick JE, Yao Z, et al. (2007). 「CMfinder比較ゲノミクスパイプラインを用いた細菌中の22の候補構造化RNAの同定」 . Nucleic Acids Res . 35 (14): 4809– 4819. doi : 10.1093/nar/ gkm487 . PMC 1950547. PMID 17621584 .
外部リンク
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