ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
| ADAMTS12 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | ADAMTS12、PRO4389、トロンボスポンジン1型モチーフ12を有するADAMメタロペプチダーゼ |
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| 外部ID | オミム:606184; MGI : 2146046;ホモロジーン: 12808;ジーンカード:ADAMTS12; OMA :ADAMTS12 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | キリスト | 15番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 15|15 A1 | 始める | 11,064,790 bp [2] |
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| 終わり | 11,349,231 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| 上位の表現 | - 睾丸
- 子宮内膜間質細胞
- 臓側胸膜
- 生殖腺
- ランゲルハンス島
- 脂肪組織
- 皮下脂肪組織
- 腓骨神経
- 腹部の脂肪
- 壁側胸膜
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| | 上位の表現 | - 真皮
- 骨髄間質
- 頭蓋冠
- 輸出管
- 前庭感覚上皮
- 乳腺
- 外頸動脈
- 大動脈弁
- 内頸動脈
- 耳石器官
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| | より多くの参照表現データ |
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| バイオGPS |  | | より多くの参照表現データ |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- 金属イオン結合
- ペプチダーゼ活性
- タンパク質結合
- メタロエンドペプチダーゼ活性
- 加水分解酵素活性
- メタロペプチダーゼ活性
- 亜鉛イオン結合
| | 細胞成分 |
- 細胞外領域
- 細胞外マトリックス
- コラーゲン含有細胞外マトリックス
| | 生物学的プロセス |
- 内皮管の形態形成の調節
- プロテオグリカンの分解プロセス
- 肝細胞増殖因子受容体シグナル伝達経路の負の制御
- 血管内皮増殖因子刺激に対する細胞応答の負の調節
- 腫瘍壊死因子に対する細胞反応
- BMP刺激に対する細胞応答
- 肝細胞増殖因子刺激に対する細胞応答の負の調節
- タンパク質分解
- 軟骨細胞分化の負の制御
- インターロイキン-1に対する細胞応答
- 炎症反応の調節
- 細胞タンパク質分解過程に関与するタンパク質分解
- 細胞-マトリックス接着
- 細胞の移動
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オーソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | |
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ENSG00000151388 ENSG00000281690 |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_030955 NM_001324511 NM_001324512 |
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| RefSeq(タンパク質) | |
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NP_001311440 NP_001311441 NP_112217 |
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| 場所(UCSC) | 5章: 33.52 – 33.89 MB | 15章: 11.06 – 11.35 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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トロンボスポンジンモチーフ12を持つディスインテグリンおよびメタロプロテアーゼは、ヒトではADAMTS12遺伝子によってコードされる酵素である。[5]
この遺伝子は、ADAMTS(トロンボスポンジンモチーフを有するディスインテグリンおよびメタロプロテアーゼ)タンパク質ファミリーのメンバーをコードします。このファミリーのメンバーは、プロペプチド領域、メタロプロテアーゼドメイン、ディスインテグリン様ドメイン、およびトロンボスポンジン1型(TS-1)モチーフなど、いくつかの異なるタンパク質モジュールを共有しています。このファミリーの各メンバーはC末端TS-1モチーフの数が異なり、中には独自のC末端ドメインを持つものもあります。この遺伝子によってコードされる酵素は8つのTS-1モチーフを含んでいます。胎児発育中の肺細胞や腫瘍形成過程において、タンパク質分解活性を介して、あるいは細胞接着の調節に関与する分子として、役割を果たしている可能性があります。[5]
参考文献
- ^ abc ENSG00000281690 GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000151388, ENSG00000281690 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000047497 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ ab "Entrez Gene: ADAMTS12 ADAMメタロペプチダーゼ(トロンボスポンジン1型モチーフ付き)、12".
さらに読む
- Tang BL (2001). 「ADAMTS:細胞外マトリックスプロテアーゼの新規ファミリー」. Int. J. Biochem. Cell Biol . 33 (1): 33– 44. doi :10.1016/S1357-2725(00)00061-3. PMID 11167130.
- Llamazares M, Obaya AJ, Moncada-Pazos A, et al. (2008). 「ADAMTS12メタロプロテアーゼはRas依存性ERKシグナル伝達経路の調節を介して抗腫瘍特性を示す」. J. Cell Sci . 120 (Pt 20): 3544–52 . doi : 10.1242/jcs.005751 . hdl : 10651/42564 . PMID 17895370.
- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, et al. (2006). 「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、in vivo、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」. Cell . 127 (3): 635–48 . doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573.
- Liu CJ, Kong W, Xu K, et al. (2006). 「ADAMTS-12は軟骨オリゴマーマトリックスタンパク質と会合し、それを分解する」J. Biol. Chem . 281 (23): 15800–8 . doi : 10.1074/jbc.M513433200 . PMC 1483932. PMID 16611630 .
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクトの現状、品質、そして拡大:哺乳類遺伝子コレクション(MGC)」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 .
- Clark HF, Gurney AL, Abaya E, et al. (2003). 「分泌タンパク質発見イニシアチブ(SPDI):新規ヒト分泌タンパク質および膜貫通タンパク質の同定に向けた大規模取り組み:バイオインフォマティクスによる評価」Genome Res . 13 (10): 2265–70 . doi :10.1101/gr.1293003. PMC 403697. PMID 12975309 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- Dias Neto E, Correa RG, Verjovski-Almeida S, et al. (2000). 「ORF発現配列タグを用いたヒトトランスクリプトームのショットガンシーケンシング」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 97 (7): 3491–6 . Bibcode :2000PNAS...97.3491D. doi : 10.1073/pnas.97.7.3491 . PMC 16267. PMID 10737800 .
外部リンク