ADARB1

ADARB1
利用可能な構造
PDB	オーソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	1ZY7、5ED1、5ED2、5HP3、5HP2
識別子
エイリアス	ADARB1、ADAR2、DRABA2、DRADA2、RED1、アデノシンデアミナーゼ、RNA特異的B1、アデノシンデアミナーゼRNA特異的B1、NEDHYMS
外部ID	オミム: 601218 ; MGI : 891999 ;ホモロジーン: 8280 ;ジーンカード: ADARB1 ; OMA : ADARB1 - オルソログ
EC番号	3.5.4.37
遺伝子の位置（ヒト）
キリスト	21番染色体（ヒト）
終わり	45,226,560 bp
遺伝子の位置（マウス）
キリスト	10番染色体（マウス）
終わり	77,254,104 bp
RNA発現パターン
	上位の表現
	脛骨動脈; 胃粘膜; 右冠動脈; 小脳虫部; 伏在静脈; 視床の外側核群; 下行胸部大動脈; 上行大動脈; アキレス腱; 左冠動脈;
	上位の表現
	内側背側核; 内側膝状体; 外側膝状体; 下丘; 小脳皮質; 延髄; 分界条核; 海馬歯状回顆粒細胞; 橋核; 視覚皮質;
	より多くの参照表現データ
	より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー
分子機能	金属イオン結合; アデノシンデアミナーゼ活性; タンパク質結合; RNA結合; 二本鎖RNA結合; mRNA結合; 加水分解酵素活性; 二本鎖RNAアデノシンデアミナーゼ活性; tRNA特異的アデノシンデアミナーゼ活性;
細胞成分	核質; 核小体; 核; 細胞質; 細胞質;
生物学的プロセス	RNA処理; 免疫システムのプロセス; mRNA処理; 塩基変換または置換編集; 細胞周期の調節; 細胞移動の負の調節; ウイルスに対する防御反応; タンパク質リン酸化の調節によるタンパク質キナーゼ活性の負の調節; ウイルスゲノム複製の正の制御; 自然免疫反応; アデノシンからイノシンへの編集; 細胞集団増殖の負の調節; 神経筋シナプス伝達; 顔面神経の形態形成; 舌下神経の形態形成; 脊髄腹側交連の形態形成; 多細胞生物の成長; 姿勢を制御する神経筋プロセス; 神経支配; 筋組織の形態形成; 運動行動; 運動ニューロンのアポトーシス過程;
	出典：Amigo / QuickGO
オーソログ
	104
	110532
	ENSG00000197381
	ENSMUSG00000020262
	P78563
	Q91ZS8
NM_001033049 NM_001112 NM_001160230 NM_015833 NM_015834
	NM_001346687 NM_001346688
	NM_001024837 NM_001024838 NM_001024839 NM_001024840 NM_130895
NP_001103 NP_001153702 NP_001333616 NP_001333617 NP_056648
	NP_056649
	NP_001020008 NP_570965 NP_001020009
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

二本鎖RNA特異的エディターゼ1は、ヒトではADARB1遺伝子によってコードされている酵素である。^[⁵^]^[⁶^]^[⁷^]この酵素はADARファミリーのメンバーである。

関数

この遺伝子は、アデノシンの部位特異的脱アミノ化によるグルタミン酸受容体サブユニットBのpre-mRNA編集を担う酵素をコードする。ラットを用いた研究では、この酵素が自身のpre-mRNA分子に作用してAAジヌクレオチドをAIジヌクレオチドに変換し、新たなスプライス部位を形成することが明らかになった。この遺伝子の選択的スプライシングにより、いくつかの転写バリアントが生じ、その中には Aluカセット挿入の有無、およびC末端領域の長短によって特徴付けられるものがある。^[⁷^]

ADARB1は、適切に機能するために小分子イノシトールヘキサキスリン酸（IP6 _）を必要とする。^{[ 8 ]} ADARB1は、主にタンパク質コード基質に作用するA-to-I RNA編集酵素である。^[⁹^]

参照

アデノシンデアミナーゼ（ADA）は、単離されたアデノシンに作用する酵素である。

参考文献

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000197381 – Ensembl、2017年5月
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000020262 – Ensembl、2017年5月
^ 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
^ 「マウスPubMedリファレンス：」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
^ Mittaz L, Scott HS, Rossier C, Seeburg PH, Higuchi M, Antonarakis SE (1997年4月). 「染色体21q22.3にマッピングされるグルタミン酸受容体のヒトRNA編集脱アミノ酵素（ADARB1）のクローニング」. Genomics . 41 (2): 210–7 . doi : 10.1006/geno.1997.4655 . PMID 9143496 .
^ Keegan LP, Leroy A, Sproul D, O'Connell MA (2004年2月). 「RNAに作用するアデノシンデアミナーゼ（ADAR）：RNA編集酵素」 . Genome Biology . 5 (2): 209. doi : 10.1186 / gb-2004-5-2-209 . PMC 395743. PMID 14759252 .
^ ^a ^b「Entrez遺伝子：ADARB1アデノシンデアミナーゼ、RNA特異的、B1（RED1ホモログラット）」。
^ Macbeth MR, Schubert HL, Vandemark AP, Lingam AT, Hill CP, Bass BL (2005年9月). 「イノシトールヘキサキスリン酸はADAR2コアに結合し、RNA編集に必要である」 . Science . 309 ( 5740): 1534–9 . Bibcode : 2005Sci...309.1534M . doi : 10.1126/science.11 13150. PMC 1850959. PMID 16141067 .
^ Licht K, Jantsch MF (2016年4月). 「RNA編集とRNA修飾による迅速かつ動的なトランスクリプトーム制御」 . The Journal of Cell Biology . 213 (1): 15– 22. doi : 10.1083/jcb.201511041 . PMC 4828693. PMID 27044895 .

さらに読む

Valenzuela A, Blanco J, Callebaut C, Jacotot E, Lluis C, Hovanessian AG, Franco R (1997). 「HIV-1エンベロープgp120とウイルス粒子はヒトCD26へのアデノシンデアミナーゼの結合を阻害する」.免疫機能と疾患における細胞ペプチダーゼ. 実験医学生物学の進歩. 第421巻. pp. 185– 92. doi : 10.1007/978-1-4757-9613-1_24 . ISBN 978-1-4757-9615-5. PMID 9330696 .
Melcher T, Maas S, Herb A, Sprengel R, Seeburg PH, Higuchi M (1996年2月). 「哺乳類RNA編集酵素」. Nature . 379 (6564): 460–4 . Bibcode : 1996Natur.379..460M . doi : 10.1038/379460a0 . PMID 8559253 . S2CID 4326456 .
O'Connell MA, Gerber A, Keller W (1997年1月). 「脳グルタミン酸受容体B pre-mRNAの編集に関与するヒト二本鎖RNA特異的エディターゼ1（hRED1）の精製」（PDF） . The Journal of Biological Chemistry . 272 (1): 473–8 . doi : 10.1074/jbc.272.1.473 . PMID 8995285 .
Valenzuela A, Blanco J, Callebaut C, Jacotot E, Lluis C, Hovanessian AG, Franco R (1997年4月). 「ヒトCD26へのアデノシンデアミナーゼの結合は、HIV-1エンベロープ糖タンパク質gp120およびウイルス粒子によって阻害される」 . Journal of Immunology . 158 (8): 3721–9 . doi : 10.4049/jimmunol.158.8.3721 . PMID 9103436 .
Lai F, Chen CX, Carter KC, Nishikura K (1997年5月). 「4つの選択的スプライシングを受けたDRADA2二本鎖RNAアデノシンデアミナーゼによるグルタミン酸受容体BサブユニットイオンチャネルRNAの編集」 . Molecular and Cellular Biology . 17 (5): 2413–24 . doi : 10.1128/MCB.17.5.2413 . PMC 232090. PMID 9111310 .
Yang JH, Sklar P, Axel R, Maniatis T (1997年4月). 「グルタミン酸受容体Bのpre-mRNA編集におけるヒトRNAアデノシンデアミナーゼの精製と特性解析」 .米国科学アカデミー紀要. 94 (9): 4354–9 . Bibcode : 1997PNAS...94.4354Y . doi : 10.1073/pnas.94.9.4354 . PMC 20726. PMID 9113993 .
Gerber A, O'Connell MA, Keller W (1997年5月). 「Aluカセットの挿入によって生成されるヒト二本鎖RNA特異的エディターゼ1（hRED1）の2つの形態」 . RNA . 3 ( 5): 453–63 . PMC 1369496. PMID 9149227 .
Villard L, Tassone F, Haymowicz M, Welborn R, Gardiner K (1997年3月). 「ヒトRED1 RNAエディターゼの地図上の位置、ゲノム構成、および発現パターン」.体細胞・分子遺伝学. 23 (2): 135–45 . doi : 10.1007/BF02679972 . PMID 9330641. S2CID 45104326 .
Blanco J, Valenzuela A, Herrera C, Lluís C, Hovanessian AG, Franco R (2000年7月). 「HIV-1 gp120はCD4およびCXCR4の発現によって調節されるメカニズムにより、アデノシンデアミナーゼのCD26への結合を阻害する」. FEBS Letters . 477 ( 1–2 ): 123–8 . Bibcode : 2000FEBSL.477..123B . doi : 10.1016/ S0014-5793 (00)01751-8 . PMID 10899322. S2CID 22229481 .
Herrera C, Morimoto C, Blanco J, Mallol J, Arenzana F, Lluis C, Franco R (2001年6月). 「ヒトリンパ球におけるCXCR4とCD26の共調節」 . The Journal of Biological Chemistry . 276 (22): 19532–9 . doi : 10.1074/jbc.M004586200 . PMID 11278278 .
Maas S, Patt S, Schrey M, Rich A (2001年12月). 「悪性神経膠腫におけるグルタミン酸受容体GluR-B mRNAの過少編集」 .米国科学アカデミー紀要. 98 (25): 14687–92 . Bibcode : 2001PNAS...9814687M . doi : 10.1073/pnas.251531398 . PMC 64742. PMID 11717408 .
Jayan GC, Casey JL (2002年4月). 「ADAR1およびADAR2の高発現によるRNA編集の増加とデルタ肝炎ウイルス複製の阻害」 . Journal of Virology . 76 (8): 3819–27 . doi : 10.1128/JVI.76.8.3819-3827.2002 . PMC 136091. PMID 11907222 .
Jaikaran DC, Collins CH, MacMillan AM (2002年10月). 「ADAR2によるアデノシンからイノシンへの編集には、GluR-B R/G部位における三元複合体の形成が必要である」(PDF) . The Journal of Biological Chemistry . 277 (40): 37624–9 . doi : 10.1074/jbc.M204126200 . PMID 12163487 .
Jayan GC, Casey JL (2002年12月). 「短鎖阻害RNAを介したADAR1のノックダウンはデルタ肝炎ウイルスRNA編集を阻害するが、ADAR2の発現は阻害しない」 . Journal of Virology . 76 (23): 12399–404 . doi : 10.1128/JVI.76.23.12399-12404.2002 . PMC 136899. PMID 12414985 .
Slavov D, Gardiner K (2002年10月). 「pre-mRNAアデノシンデアミナーゼADAR2遺伝子および転写産物の系統学的比較：編集部位配列および選択的スプライシングパターンにおける保全性と多様性」. Gene . 299 ( 1–2 ): 83–94 . doi : 10.1016/S0378-1119(02)01016-8 . PMID 12459255 .

外部リンク

UCSC ゲノムブラウザのヒトADARB1ゲノムの位置とADARB1遺伝子の詳細ページ。

ヒト21番染色体上の遺伝子に関するこの記事はスタブです。不足している情報を追加してWikipediaに貢献してください。

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000197381 – Ensembl、2017年5月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000020262 – Ensembl、2017年5月

[3] 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[4] 「マウスPubMedリファレンス：」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[pmid9143496-5] Mittaz L, Scott HS, Rossier C, Seeburg PH, Higuchi M, Antonarakis SE (1997年4月). 「染色体21q22.3にマッピングされるグルタミン酸受容体のヒトRNA編集脱アミノ酵素（ADARB1）のクローニング」. Genomics . 41 (2): 210–7 . doi : 10.1006/geno.1997.4655 . PMID 9143496 .

[pmid14759252-6] Keegan LP, Leroy A, Sproul D, O'Connell MA (2004年2月). 「RNAに作用するアデノシンデアミナーゼ（ADAR）：RNA編集酵素」 . Genome Biology . 5 (2): 209. doi : 10.1186 / gb-2004-5-2-209 . PMC 395743. PMID 14759252 .

[entrez-7] 「Entrez遺伝子：ADARB1アデノシンデアミナーゼ、RNA特異的、B1（RED1ホモログラット）」。

[pmid16141067-8] Macbeth MR, Schubert HL, Vandemark AP, Lingam AT, Hill CP, Bass BL (2005年9月). 「イノシトールヘキサキスリン酸はADAR2コアに結合し、RNA編集に必要である」 . Science . 309 ( 5740): 1534–9 . Bibcode : 2005Sci...309.1534M . doi : 10.1126/science.11 13150. PMC 1850959. PMID 16141067 .

[9] Licht K, Jantsch MF (2016年4月). 「RNA編集とRNA修飾による迅速かつ動的なトランスクリプトーム制御」 . The Journal of Cell Biology . 213 (1): 15– 22. doi : 10.1083/jcb.201511041 . PMC 4828693. PMID 27044895 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[

[

[

[ 8 ]

[