ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子
| AP1B1 |
|---|
 |
| 利用可能な構造 |
|---|
| PDB | オーソログ検索: PDBe RCSB |
|---|
|
|
| 識別子 |
|---|
| エイリアス | AP1B1、ADTB1、AP105A、BAM22、CLAPB2、アダプター関連タンパク質複合体1ベータ1サブユニット、アダプター関連タンパク質複合体1サブユニットベータ1、KIDAR |
|---|
| 外部ID | オミム:600157; MGI : 1096368;ホモロジーン: 21972;ジーンカード:AP1B1; OMA :AP1B1 - オルソログ |
|---|
|
| 遺伝子の位置(マウス) |
|---|
 | | キリスト | 11番染色体(マウス)[2] |
|---|
| | バンド | 11|11 A1 | 始める | 4,936,824 bp [2] |
|---|
| 終わり | 4,992,791 bp [2] |
|---|
|
| RNA発現パターン |
|---|
| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
|---|
| 上位の表現 | - 中前頭回
- 小脳の傍小葉
- ブロードマン領域10
- 前頭極
- 横行結腸粘膜
- 右副腎皮質
- 脾臓
- リンパ節
- 左副腎
- 食道粘膜
|
| | 上位の表現 | - 網膜の神経層
- 胎児肝造血前駆細胞
- 骨髄間質
- 海馬歯状回顆粒細胞
- 一次視覚野
- 上前頭回
- リップ
- 卵黄嚢
- 小脳皮質
- 嗅内皮質
|
| | より多くの参照表現データ |
|
|---|
| バイオGPS |  | | より多くの参照表現データ |
|
|---|
|
| 遺伝子オントロジー |
|---|
| 分子機能 |
- トランスポーター活性
- タンパク質結合
- タンパク質キナーゼ結合
- クラスリン結合
| | 細胞成分 |
- トランスゴルジネットワーク膜
- 膜
- ゴルジ膜
- リソソーム膜
- クラスリン被覆小胞膜
- 膜コート
- 細胞質小胞膜
- 細胞質小胞
- クラスリンアダプター複合体
- ゴルジ体
- 細胞質
- 細胞内膜小器官
| | 生物学的プロセス |
- MHCクラスIIを介した外因性ペプチド抗原の抗原処理と提示
- ウイルスによる宿主防御の緩和
- 心臓の発達
- 左右対称性の判定
- タンパク質輸送
- 細胞内タンパク質輸送
- 小胞輸送
| | 出典:Amigo / QuickGO |
|
| オーソログ |
|---|
| 種 | 人間 | ねずみ |
|---|
| エントレズ | | |
|---|
| アンサンブル | | |
|---|
| ユニプロット | | |
|---|
| RefSeq (mRNA) | |
|---|
NM_145730 NM_001127 NM_001166019 |
| |
|---|
NM_001243043 NM_001243044 NM_007454 NM_001355659 NM_001355660 |
|
|---|
| RefSeq(タンパク質) | NP_001118 NP_001159491 NP_663782 NP_001365491 NP_001365492
|
|---|
NP_001365493 NP_001365494 NP_001365495 |
| |
|---|
NP_001229972 NP_001229973 NP_031480 NP_001342588 NP_001342589 |
|
|---|
| 場所(UCSC) | 22章: 29.33 – 29.42 Mb | 11章: 4.94 – 4.99 MB |
|---|
| PubMed検索 | [3] | [4] |
|---|
|
| ウィキデータ |
|
AP-1複合体サブユニットβ-1は、ヒトではAP1B1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7]
アダプタータンパク質複合体1は、ゴルジ体に位置する被覆小胞の細胞質面に存在し、膜へのクラスリンのリクルートメントと、膜貫通受容体の細胞質末端における選別シグナルの認識の両方を媒介する。この複合体は、2つの大型アダプチンサブユニット、1つの中型アダプチンサブユニット、および1つの小型アダプチンサブユニットからなるヘテロ四量体である。この遺伝子によってコードされるタンパク質は、この複合体の大型サブユニットの1つとして機能し、アダプチンタンパク質ファミリーのメンバーである。[8]この遺伝子は髄膜腫遺伝子の候補である。この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする2つの転写バリアントが見つかっており、代替的なポリアデニル化シグナルを利用するバリアントも存在する。[7]
相互作用
AP1B1はKIF13A [9]およびAP1G1 [10] [11] [12]と相互作用することが示されている。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000100280 – Ensembl、2017年5月
- ^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000009090 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ Peyrard M, Fransson I, Xie YG, Han FY, Ruttledge MH, Swahn S, Collins JE, Dunham I, Collins VP, Dumanski JP (1995年1月). 「ヒトβアダプチン遺伝子ファミリーの22q12染色体由来の新規メンバー、髄膜腫候補遺伝子の特性評価」Hum Mol Genet . 3 (8): 1393–9 . doi :10.1093/hmg/3.8.1393. PMID 7987321.
- ^ Peyrard M, Pan HQ, Kedra D, Fransson I, Swahn S, Hartman K, Clifton SW, Roe BA, Dumanski JP (1997年2月). 「染色体22q12由来のヒトβ'-アダプチン遺伝子(BAM22)のプロモーター構造とゲノム構成」. Genomics . 36 (1): 112–7 . doi :10.1006/geno.1996.0431. PMID 8812422.
- ^ ab 「Entrez Gene: AP1B1 アダプター関連タンパク質複合体 1、ベータ 1 サブユニット」。
- ^ 「AP1S1アダプター関連タンパク質複合体1サブユニットシグマ1 [ホモサピエンス(ヒト)] - 遺伝子 - NCBI」。www.ncbi.nlm.nih.gov . 2024年11月30日閲覧。
- ^ 中川 剛志; 瀬藤 正之; 徐 大輔; 小笠原 健; 堂前 暢; 滝尾 健; 広川 暢志 (2000年11月). 「新規モーターKIF13Aは、AP-1複合体との直接相互作用を介してマンノース-6-リン酸受容体を細胞膜へ輸送する」. Cell . 103 (4). 米国: 569–81 . doi : 10.1016/S0092-8674(00)00161-6 . ISSN 0092-8674. PMID 11106728.
- ^ 高津 秀治; 桜井 正治; 真 秀和; 村上 健; 中山 健 (1998年9月). 「新規クラスリンアダプター関連タンパク質の同定と特性評価」. J. Biol. Chem . 273 (38). 米国: 24693–700 . doi : 10.1074 /jbc.273.38.24693 . ISSN 0021-9258. PMID 9733768.
- ^ Fölsch, H; Ohno H; Bonifacino JS; Mellman I (1999年10月). 「新規クラスリンアダプター複合体は極性上皮細胞における基底外側への標的化を媒介する」. Cell . 99 (2). 米国: 189–98 . doi : 10.1016/S0092-8674(00)81650-5 . ISSN 0092-8674. PMID 10535737.
- ^
さらに読む
- Kirchhausen T (2000). 「クラスリン」. Annu. Rev. Biochem . 69 : 699–727 . doi :10.1146/annurev.biochem.69.1.699. PMID 10966473.
- Geyer M, Fackler OT, Peterlin BM (2001). 「HIV-1 Nefにおける構造と機能の関係」. EMBO Rep . 2 (7): 580–5 . doi :10.1093/embo-reports/kve141. PMC 1083955. PMID 11463741 .
- Bénichou S, Benmerah A (2003). 「HIV nefとカポジ肉腫関連ウイルスK3/K5タンパク質:エンドサイトーシス経路の「寄生虫」」Med Sci (パリ) . 19 (1): 100–6 . doi : 10.1051/medsci/2003191100 . PMID 12836198.
- Lim DS, Kirsch DG, Canman CE, et al. (1998). 「ATMは細胞質小胞内のβ-アダプチンに結合する」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 95 (17): 10146–51 . Bibcode :1998PNAS...9510146L. doi : 10.1073/pnas.95.17.10146 . PMC 21476. PMID 9707615 .
- 高津 秀、桜井 正、Shin HW、他 (1998). 「新規クラスリンアダプター関連タンパク質の同定と特性解析」J. Biol. Chem . 273 (38): 24693–700 . doi : 10.1074/jbc.273.38.24693 . PMID 9733768.
- Craig HM, Pandori MW, Guatelli JC (1998). 「HIV-1 Nefと細胞内ジロイシンに基づく選別経路との相互作用は、CD4ダウンレギュレーションと最適なウイルス感染能に必要である」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 95 (19): 11229–34 . Bibcode :1998PNAS...9511229C. doi : 10.1073/pnas.95.19.11229 . PMC 21624. PMID 9736718 .
- Bresnahan PA, Yonemoto W, Ferrell S, et al. (1999). 「HIV-1 Nef中のジロイシンモチーフはCD4ダウンレギュレーションの内在化シグナルとして作用し、AP-1クラスリンアダプターに結合する」. Curr. Biol . 8 (22): 1235–8 . doi : 10.1016/S0960-9822(07)00517-9 . PMID 9811606.
- Greenberg M, DeTulleo L, Rapoport I, et al. (1999). 「HIV-1 Nefのジロイシンモチーフは、クラスリン被覆小窩への選別とCD4のダウンレギュレーションに必須である」. Curr. Biol . 8 (22): 1239–42 . doi : 10.1016/S0960-9822(07)00518-0 . PMID 9811611.
- Laporte SA, Oakley RH, Zhang J, et al. (1999). 「β2アドレナリン受容体/βアレスチン複合体はエンドサイトーシス中にクラスリンアダプターAP-2をリクルートする」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 96 (7): 3712–7 . Bibcode :1999PNAS...96.3712L. doi : 10.1073/pnas.96.7.3712 . PMC 22359. PMID 10097102 .
- Fölsch H, Ohno H, Bonifacino JS, Mellman I (1999). 「新規クラスリンアダプター複合体は極性上皮細胞における基底外側への標的化を媒介する」. Cell . 99 (2): 189–98 . doi : 10.1016/S0092-8674(00)81650-5 . PMID 10535737.
- Kim ST, Lim DS, Canman CE, Kastan MB (2000). 「ATMキナーゼファミリーメンバーの基質特異性と推定基質の同定」. J. Biol. Chem . 274 (53): 37538–43 . doi : 10.1074/jbc.274.53.37538 . PMID 10608806.
- Lai MM, Luo HR, Burnett PE, et al. (2000). 「カルシニューリン結合タンパク質Cainはシナプス小胞エンドサイトーシスの負の調節因子である」. J. Biol. Chem . 275 (44): 34017–20 . doi : 10.1074/jbc.C000429200 . PMID 10931822.
- Nakagawa T, Setou M, Seog D, et al. (2001). 「新規モーターKIF13Aは、AP-1複合体との直接相互作用を介してマンノース-6-リン酸受容体を細胞膜へ輸送する」. Cell . 103 (4): 569–81 . doi : 10.1016/S0092-8674(00)00161-6 . PMID 11106728.
- 高津 浩、二ツ森 正治、吉野 健、他 (2001). 「類似サブユニット相互作用がクラスリンアダプター複合体およびCOPI複合体の組み立てに寄与する:酵母スリーハイブリッドシステムを用いた解析」Biochem. Biophys. Res. Commun . 284 (4): 1083–9 . doi :10.1006/bbrc.2001.5081. PMID 11409905.
- Doray B, Kornfeld S (2001). 「AP-1アダプター複合体のγサブユニットはクラスリンに結合する:被覆小胞の集合における協同的結合への示唆」Mol. Biol. Cell . 12 (7): 1925–35 . doi :10.1091/mbc.12.7.1925. PMC 55640. PMID 11451993 .
- Jardine H, MacNee W, Donaldson K, Rahman I (2002). 「肺胞上皮細胞におけるTGF-β1誘導性グルタチオン枯渇の分子メカニズム.AP-1/AREおよびFra-1の関与」J. Biol. Chem . 277 (24): 21158–66 . doi : 10.1074/jbc.M112145200 . PMID 11912197.
外部リンク