APOBEC3F

APOBEC3F
利用可能な構造 PDB ヒトUniProt検索：PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 3WUS、4IOU、4J4J、5HX5、5HX4
識別子
エイリアス	APOBEC3F、A3F、ARP8、BK150C2.4.MRNA、KA6、アポリポタンパク質B mRNA編集酵素触媒サブユニット3F
外部ID	オミム：608993;ホモロジーン: 105867;ジーンカード：APOBEC3F; OMA :APOBEC3F - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 22番染色体（ヒト）[1] バンド 22q13.1 始める 39,040,604 bp [1] 終わり 39,055,972 bp [1]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 顆粒球 単球 脾臓 右卵巣 左卵巣 右卵管 リンパ節 右副腎 左副腎皮質 右副腎皮質 該当なし より多くの参照表現データ バイオGPS 該当なし
遺伝子オントロジー 分子機能 シチジンデアミナーゼ活性 亜鉛イオン結合 金属イオン結合 環状アミジン中の炭素-窒素（ペプチドではない）結合に作用する加水分解酵素活性 タンパク質結合 触媒活性 RNA結合 加水分解酵素活性 同一のタンパク質結合 細胞成分 細胞質 P体 アポリポタンパク質B mRNA編集酵素複合体 核 リボ核タンパク質複合体 生物学的プロセス 転座の負の調節 ウイルスプロセスの負の調節 免疫システムのプロセス 塩基変換または置換編集 ウイルスゲノム複製の負の制御 ウイルスに対する防御反応 DNAシトシン脱アミノ化 DNA脱メチル化 自然免疫反応 二本鎖DNA中間体を介した一本鎖ウイルスRNA複製の負の制御 宿主によるウイルスに対する防御反応の正の調節 シチジン脱アミノ化 シチジンからウリジンへの編集 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 200316 該当なし アンサンブル ENSG00000128394 該当なし ユニプロット Q8IUX4 該当なし RefSeq (mRNA) NM_001006666 NM_145298 該当なし RefSeq（タンパク質） NP_001006667 NP_660341 該当なし 場所（UCSC） 22章: 39.04 – 39.06 Mb 該当なし PubMed検索 [2] 該当なし
ウィキデータ
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DNA dC->dU編集酵素APOBEC-3Fは、ヒトではAPOBEC3F遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[3] [4] [5]}

この遺伝子はシチジンデアミナーゼ 遺伝子ファミリーのメンバーです。22番染色体上の遺伝子重複に起因すると考えられるクラスターに存在する7つの関連遺伝子または擬似遺伝子の1つです。このクラスターのメンバーは、CからUへのRNA編集シチジンデアミナーゼAPOBEC1と構造的および機能的に関連するタンパク質をコードしています。これらのタンパク質はRNA編集酵素であり、成長または細胞周期制御に関与していると考えられています。異なるアイソフォームをコードする選択的スプライシング転写バリアントが同定されています。^[5]

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000128394 – Ensembl、2017年5月
2. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
3. Jarmuz A, Chester A, Bayliss J, Gisbourne J, Dunham I, Scott J, Navaratnam N (2002年2月). 「22番染色体における類人猿特異的な孤児C→U RNA編集酵素遺伝子座」. Genomics . 79 (3): 285–96 . doi :10.1006/geno.2002.6718. PMID  11863358.
4. Holmes RK, Koning FA, Bishop KN, Malim MH (2007年1月). 「APOBEC3Fは、高頻度変異がない場合でもHIV-1逆転写産物の蓄積を阻害できる。APOBEC3Gとの比較」J Biol Chem . 282 (4): 2587–95 . doi : 10.1074/jbc.M607298200 . PMID  17121840.
5. 「Entrez Gene: APOBEC3F アポリポタンパク質 B mRNA 編集酵素、触媒ポリペプチド様 3F」。

ヒトAPOBEC3Fは、ヒト免疫不全ウイルス1型の複製を阻害するもう一つの宿主因子である。Zheng YH, Irwin D, Kurosu T, Tokunaga K, Sata T, Peterlin BM. J Virol. 2004年6月;78(11):6073-6. doi: 10.1128/JVI.78.11.6073-6076.2004.

外部リンク

• UCSC ゲノム ブラウザのヒト APOBEC3F ゲノムの位置と APOBEC3F 遺伝子の詳細ページ。

さらに読む

• Wedekind JE, Dance GS, Sowden MP, Smith HC (2003). 「哺乳類におけるメッセンジャーRNA編集：ファミリービジネスにおける役割を模索するAPOBECファミリーの新メンバー」Trends Genet . 19 (4): 207–16 . doi :10.1016/S0168-9525(03)00054-4. PMID  12683974.
• Franca R, Spadari S, Maga G (2006). 「細胞性抗ウイルス因子としてのAPOBECデアミナーゼ：新たな自然宿主防御機構」Med. Sci. Monit . 12 (5): RA92–8. PMID  16641889.
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