アポリポタンパク質C-II

利用可能なタンパク質構造:
ファム	構造 / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBサム	構造の概要

アポCII
アポCII
	SDS存在下でのヒトアポリポタンパク質C-IIのNMR構造
識別子
シンボル	アポCII
ファム	PF05355
インタープロ	IPR008019
SCOP2	1by6 / スコープ / SUPFAM
ファム
利用可能なタンパク質構造:
ファム	構造 / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBサム	構造の概要

APOC2
利用可能な構造
PDB	オーソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	1SOH、1BY6、1I5J、1O8T
識別子
エイリアス	APOC2、APO-CII、APOC-II、アポリポタンパク質C2
外部ID	オミム：608083; MGI : 88054;ホモロジーン: 47928;ジーンカード：APOC2; OMA :APOC2 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
キリスト	19番染色体（ヒト）
終わり	44,949,565 bp
遺伝子の位置（マウス）
キリスト	7番染色体（マウス）
終わり	19,411,866 bp
RNA発現パターン
	上位の表現
	肝臓の右葉; ; 黒質; ; C1セグメント; ; 十二指腸; ; 尾状核; ; 被殻; ; 扁桃体; ; 睾丸; ; 側坐核; ; 視床下部;
	上位の表現
	卵黄嚢; ; 十二指腸; ; 肝臓; ; 空腸; ; 回腸; ; 精母細胞; ; 結腸; ; 顆粒球; ; 肺胞; ; 肺胞の壁;
	より多くの参照表現データ
	該当なし
遺伝子オントロジー
分子機能	リパーゼ阻害活性; ホスホリパーゼ結合; タンパク質ホモ二量体化活性; リポタンパク質リパーゼ活性化因子活性; ホスホリパーゼ活性化因子活性; 酵素活性化活性; 脂質結合;
細胞成分	カイロミクロン; 超低密度リポタンパク質粒子; 球状高密度リポタンパク質粒子; 細胞外領域; 初期エンドソーム; 低密度リポタンパク質粒子; 高密度リポタンパク質粒子; 中間密度リポタンパク質粒子; 細胞外空間;
生物学的プロセス	高密度リポタンパク質粒子クリアランス; 脂質輸送; トリグリセリド分解プロセスの正の調節; カイロミクロン残渣除去; 脂質代謝; リン脂質の排出; リポタンパク質リパーゼ活性の正の調節; 脂肪酸生合成プロセスの正の調節; 超低密度リポタンパク質粒子のクリアランスの負の調節; レチノイド代謝プロセス; 受容体を介したエンドサイトーシスの負の制御; 脂質分解プロセス; ホスホリパーゼ活性の正の調節; リン脂質分解過程の正の調節; コレステロールの排出; 超低密度リポタンパク質粒子のリモデリング; コレステロール輸送の負の調節; コレステロール恒常性; 超低密度リポタンパク質粒子のリモデリングの正の制御; トリグリセリドリッチリポタンパク質粒子のリモデリング; トリグリセリド恒常性; 脂質代謝プロセスの負の調節; コレステロール逆輸送; 触媒活性の負の調節; リポタンパク質輸送; カイロミクロンのリモデリング; 高密度リポタンパク質粒子のリモデリング; カイロミクロンアセンブリ; 触媒活性の正の調節;
	出典：Amigo / QuickGO
オーソログ
	344
	11813
	ENSG00000234906
	ENSMUSG00000002992
	P02655
	Q05020
	NM_000483
	NM_001277944 ; NM_001309795
	NP_000474 ; NP_000474.2
	NP_001296728 ; NP_001264873 ; NP_001296724
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

ホモサピエンスにおけるタンパク質コード遺伝子

タンパク質ファミリー

アポリポタンパク質 C-II ( Apo-CII、または Apoc-II )、あるいはアポリポタンパク質 C2は、ヒトではAPOC2遺伝子によってコード化されているタンパク質です。

この遺伝子によってコードされるタンパク質は血漿中に分泌され、超低密度リポタンパク質（VLDL）およびカイロミクロン（Kylomicron）の構成要素となります。このタンパク質は毛細血管内のリポタンパク質リパーゼ（LIP ）を活性化し^[5] 、トリグリセリドを加水分解して遊離脂肪酸とグリセロールを細胞に供給します。この遺伝子の変異は、黄色腫、膵炎、肝脾腫を特徴とする高リポタンパク質血症IB型を引き起こしますが、動脈硬化のリスクは増加しません。臨床検査では、血中トリグリセリド、コレステロール、カイロミクロンの上昇が認められます^[6]。

インタラクティブな経路マップ

以下の遺伝子、タンパク質、代謝物をクリックすると、それぞれの記事にリンクします。^{[§ 1]}

^インタラクティブなパスウェイマップは、WikiPathways: "Statin_Pathway_WP430"で編集できます。

参照

アポリポタンパク質C

参考文献

^ abc GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000234906 – Ensembl、2017年5月
^ abc GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000002992 – Ensembl、2017年5月
^ 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
^ 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
^ Kim SY, Park SM, Lee ST (2006). 「アポリポプロテインC-IIはマトリックスメタロプロテアーゼの新規基質である」. Biochem. Biophys. Res. Commun . 339 (1): 47– 54. Bibcode :2006BBRC..339...47K. doi :10.1016/j.bbrc.2005.10.182. PMID 16314153.
^ 「Entrez Gene: APOC2 アポリポタンパク質 C-II」。

Jackson RL, Baker HN, Gilliam EB, Gotto AM (1977). 「ヒト血漿中の超低密度アポリポタンパク質C-IIの一次構造」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 74 (5): 1942–5 . Bibcode :1977PNAS...74.1942J. doi : 10.1073/pnas.74.5.1942 . PMC 431048. PMID 194244 .
Lycksell PO, Ohman A, Bengtsson-Olivecrona G, et al. (1992). 「アポリポタンパク質CIIのカルボキシ末端機能断片の配列特異的1H-NMR帰属と二次構造」. Eur. J. Biochem . 205 (1): 223–31 . doi : 10.1111/j.1432-1033.1992.tb16772.x . PMID 1555583.
Hegele RA, Connelly PW, Maguire GF, et al. (1992). 「高脂血症患者において同定されたアポリポタンパク質CII変異、CIILys19----Thr」. Dis. Markers . 9 (2): 73– 80. PMID 1782747.
Crecchio C, Capurso A, Pepe G (1990). 「血漿アポリポタンパク質CII欠損症（Apo CII-Bari）の原因遺伝子変異の同定」Biochem. Biophys. Res. Commun . 168 (3): 1118–27 . Bibcode :1990BBRC..168.1118C. doi :10.1016/0006-291X(90)91145-I. PMID 1971748.
Bengtsson-Olivecrona G, Sletten K (1990). 「ヒトアポリポタンパク質CIIおよびCIIIのウシ類似体の一次構造．アイソフォームに関する研究とタンパク質分解過程の証拠」. Eur. J. Biochem . 192 (2): 515–21 . doi : 10.1111/j.1432-1033.1990.tb19255.x . PMID 2209608.
Wei CF, Tsao YK, Robberson DL, et al. (1986). 「ヒトアポリポプロテインC-II遺伝子の構造．RNA:DNAハイブリッドの電子顕微鏡解析，完全ヌクレオチド配列，およびアポリポプロテイン遺伝子間の5'相同配列の同定」．J . Biol. Chem . 260 (28): 15211–21 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)95724-8 . PMID 2415514.
Fojo SS, Lohse P, Parrott C, et al. (1989). 「アポリポプロテインC-II欠損症患者におけるアポリポプロテインC-II/Padova遺伝子のナンセンス変異」. J. Clin. Invest . 84 (4): 1215–9 . doi :10.1172/JCI114287. PMC 329780. PMID 2477392 .
Jackson CL, Bruns GA, Breslow JL (1986). 「アポリポタンパク質C-IIのcDNAおよびゲノムクローンの単離」 . Segrest JP, Albers JA (編).血漿リポタンパク質パートA：調製、構造、および分子生物学. Methods in Enzymology. 第128巻. Elsevier. pp. 788–800. doi :10.1016/0076-6879(86)28106-9. ISBN 9780121820282. PMID 3014272。
Fojo SS, Law SW, Brewer HB (1987). 「ヒトプレプロアポリポプロテインC-II遺伝子．完全な核酸配列とゲノム構成」. FEBS Lett . 213 (1): 221–6 . Bibcode :1987FEBSL.213..221F. doi : 10.1016/0014-5793(87)81495-3 . PMID 3030808. S2CID 42223577.
Fojo SS, Stalenhoef AF, Marr K, et al. (1989). 「アポリポタンパク質C-II欠損症患者におけるApoC-II遺伝子（ApoC-II Nijmegen）の欠失変異」. J. Biol. Chem . 263 (34): 17913–6 . doi : 10.1016/S0021-9258(19)81302-9 . PMID 3192518.
Fojo SS、Beisiegel U、Beil U 他（1988年）。「アポ C-II 欠損症患者のアポリポタンパク質 (Apo) C-II 遺伝子 (アポ C-II ハンブルク) におけるドナースプライス部位変異」。Ｊ．クリン．投資する。82 (5): 1489–94 .土井:10.1172/JCI113756。PMC 442713。PMID 3263393。
Connelly PW, Maguire GF, Hofmann T, Little JA (1987). 「非機能性ヒトアポリポタンパク質、アポリポタンパク質C-IITorontoの構造」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 84 (1): 270–3 . Bibcode :1987PNAS...84..270C. doi : 10.1073/pnas.84.1.270 . PMC 304185. PMID 3467353 .
Fairwell T, Hospattankar AV, Brewer HB, Khan SA (1987). 「ヒト血漿アポリポタンパク質C-II：全固相合成と化学的・生物学的特性評価」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 84 (14): 4796– 800. Bibcode :1987PNAS...84.4796F. doi : 10.1073/pnas.84.14.4796 . PMC 305192. PMID 3474626 .
Fojo SS, Taam L, Fairwell T, et al. (1986). 「ヒトプレプロアポリポプロテインC-II. 主要血漿アイソフォームの解析」. J. Biol. Chem . 261 (21): 9591–4 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)67554-4 . PMID 3525527.
Das HK, Jackson CL, Miller DA, et al. (1987). 「ヒトアポリポタンパク質C-II遺伝子配列は、その第3イントロンに19番染色体特異的な新規ミニサテライトを含む」J. Biol. Chem . 262 (10): 4787–93 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)61264-5 . PMID 3558370.
Connelly PW, Maguire GF, Little JA (1988). 「アポリポプロテインCIISt. Michael. 家族性アポリポプロテインCII欠損症と早期血管疾患の関連」. J. Clin. Invest . 80 (6): 1597–606 . doi :10.1172 / JCI113246. PMC 442428. PMID 3680515.
Baggio G, Manzato E, Gabelli C, et al. (1986). 「アポリポプロテインC-II欠乏症候群。2名の罹患患者におけるアポリポプロテインC-II投与後の臨床的特徴、リポタンパク質特性、リパーゼ活性、および高トリグリセリド血症の改善」J. Clin. Invest . 77 (2): 520–7 . doi :10.1172 / JCI112332. PMC 423374. PMID 3944267.
Menzel HJ, Kane JP, Malloy MJ, Havel RJ (1986). 「アフリカ系住民におけるアポリポタンパク質C-IIの変異一次構造」J. Clin. Invest . 77 (2): 595– 601. doi :10.1172/JCI112342. PMC 423392. PMID 3944271 .
Sharpe CR, Sidoli A, Shelley CS, et al. (1984). 「ヒトアポリポタンパク質AI、AII、CII、CIII. cDNA配列およびmRNA存在量」Nucleic Acids Res . 12 (9): 3917–32 . doi :10.1093/nar/12.9.3917. PMC 318799. PMID 6328445 .
Jackson CL, Bruns GA, Breslow JL (1984). 「ヒトアポリポプロテインCII cDNAクローンの単離と配列、ならびにそれを用いたアポリポプロテインCII遺伝子の単離とヒト19番染色体へのマッピング」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 81 (10): 2945–9 . Bibcode :1984PNAS...81.2945J. doi : 10.1073/pnas.81.10.2945 . PMC 345197. PMID 6328478 .

外部リンク

UCSC ゲノムブラウザのヒト APOC2 ゲノムの位置と APOC2 遺伝子の詳細ページ。

[WikiPathways-7] ^インタラクティブなパスウェイマップは、WikiPathways: "Statin_Pathway_WP430"で編集できます。

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000234906 – Ensembl、2017年5月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000002992 – Ensembl、2017年5月

[3] 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[4] 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。

[pmid16314153-5] Kim SY, Park SM, Lee ST (2006). 「アポリポプロテインC-IIはマトリックスメタロプロテアーゼの新規基質である」. Biochem. Biophys. Res. Commun . 339 (1): 47– 54. Bibcode :2006BBRC..339...47K. doi :10.1016/j.bbrc.2005.10.182. PMID 16314153.

[entrez-6] 「Entrez Gene: APOC2 アポリポタンパク質 C-II」。