| コンテンツ | |
|---|---|
| 説明 | 抗生物質耐性遺伝子を追跡するデータベース。 |
キャプチャされたデータの種類 | 抗生物質耐性遺伝子 |
| 生物 | 細菌 |
| 接触 | |
| 主な引用 | PMID 18832362 |
| アクセス | |
| Webサイト | ardb.cbcb.umd.edu |
| その他 | |
| ブックマーク可能な エンティティ | はい |
ARDBは抗生物質耐性遺伝子データベースとも呼ばれ、作用機序、耐性プロファイル、オントロジー、オルソログ遺伝子クラスター（COG）、保存ドメインデータベース（CDD）注釈などの情報を使用して抗生物質耐性 遺伝子を追跡するデータベースです。 [1]外部データベースへのリンクも含まれています。このデータベースは、新しい耐性遺伝子の識別にも使用されます。 2009年のARDBの作成時には、包括的な注釈システムがありませんでした。そのため、 ARDB用に耐性プロファイルと作用機序のオントロジー用語が作成されました。オントロジーによって分類されるその他のものには、薬物標的修飾、薬物酵素破壊、薬物輸送などがあります。[1]薬物トランスポーターは、このホワイト ペーパーで概説されている規則に従って、MFS 排出ポンプ、SMR 排出ポンプ、ABC 排出ポンプ、RND 排出ポンプによってさらに細分化されます。[2]現在、ARDBには13,293個の遺伝子、377種類、257種類の抗生物質、632個のゲノム、933種、124属の耐性情報が含まれています。
ARDBはメンテナンスされなくなりました。ARDBのデータはすべてCARDに保存されており、開発者は代わりにCARDの使用を推奨しています。
参照
参考文献
- ^ ab Liu, B.; Pop, M. (2009-01-01). 「ARDB-抗生物質耐性遺伝子データベース」. Nucleic Acids Research . 37 (データベース): D443 – D447 . doi :10.1093/nar/gkn656. ISSN 0305-1048. PMC 2686595. PMID 18832362 .
- ^ Higgins, Christopher F. (2007年4月). 「多剤耐性トランスポーターの複数の分子メカニズム」. Nature 446 ( 7137 ): 749– 757. Bibcode :2007Natur.446..749H. doi :10.1038/nature05630. ISSN 0028-0836. PMID 17429392. S2CID 4414214.
