| β-アガラーゼ | |||||||||
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| 識別子 | |||||||||
| EC番号 | 3.2.1.81 | ||||||||
| CAS番号 | 37288-57-6 | ||||||||
| データベース | |||||||||
| インテンズ | IntEnzビュー | ||||||||
| ブレンダ | ブレンダエントリー | ||||||||
| エクスパス | NiceZymeビュー | ||||||||
| ケッグ | KEGGエントリー | ||||||||
| メタサイクル | 代謝経路 | ||||||||
| プリアモス | プロフィール | ||||||||
| PDB構造 | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
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アガラーゼ（EC 3.2.1.81、AgaA、AgaB、エンド-β-アガラーゼ、アガロース3-グリカノヒドロラーゼ）は、系統名アガロース4-グリカノヒドロラーゼの酵素です。寒天分解細菌に存在し、寒天分解経路における最初の酵素です。[1]アガラーゼは、寒天を主要な炭素 源として利用することを可能にし、海洋での生存を可能にします。
アガラーゼは、アガロース中のα結合またはβ結合を分解してオリゴ糖を生成するかによって、α-アガラーゼとβ-アガラーゼに分類されます。分泌されると、α-アガラーゼは還元末端に3.6個の無水-L-ガラクトースを持つオリゴ糖を生成しますが、β-アガラーゼはD-ガラクトース残基を生成します。[2]
環境における機能
予想通り、寒天分解菌の多くは海洋微生物です。これは陸上に存在する大多数の微生物では無駄な環境への適応です（ただし、ホウレンソウの根圏に生息するパエニバチルス属の一種[3]など、そのような例はあります）。ビブリオ属の種[4]からアルテロモナス属の種[5]に至るまで、アガラーゼの存在により、寒天分解菌は海中に豊富な食料源を確保できます。また、研究では、グルコースが細胞外アガラーゼの分泌を阻害し（転写は阻害しない）、細胞内でアガラーゼを分解することで細菌の増殖を制限できることも示されています。[5]さらに、リン酸制限がアガラーゼに及ぼす影響を調べた研究では、リン酸を制限すると細胞内アガラーゼ産生と細胞外分泌がともに増加するのに対し、マグネシウム制限では増加しないことが示されています。[6]これは、海中のグルコースやリン酸の濃度が非常に低い一方で、マグネシウムの濃度は一般的にはるかに高く、寒天分解細菌のアガラーゼ生産に適しているため、この種の細菌が通常占めるニッチをさらに強調しています。海ではグルコースを使用する必要がないため、多くの生物はグルコースを使用しません。
アガラーゼの最適pHは5.5ですが、4.0から9.0の許容範囲で安定しています。[4]
参照
参考文献
- ^ Parro V, Mellado RP (1994). 「ストレプトマイセスにおけるアガラーゼ過剰生産に対するグルコースの影響」. Gene . 145 (1): 49– 55. doi :10.1016/0378-1119(94)90321-2. PMID 8045423.
- ^ Hassairi I、Ben Amar R、Nonus M、Gupta BB (2001)。 「 Altermonas agarlyticus GJ1B株からのα-アガラーゼの生成と分離」。バイオリソーステクノロジー。79 (1): 47–51。書誌コード:2001BiTec..79...47H。土井：10.1016/S0960-8524(01)00037-2。PMID 11396907。
- ^ Hozoda A, Sakai M, Kanazawa S (2003). 「ホウレンソウ根圏に生息する寒天分解性Paenibacillus属細菌の分離と特性解析」.生物科学, バイオテクノロジー, 生化学. 67 (5): 1048–1055 . doi : 10.1271/bbb.67.1048 .
- ^ ab 青木 剛志、荒木 剛志、北御門 正之 (1990). 「ビブリオ属菌AP-2由来の新規β-アガラーゼの精製と特性解析」.ヨーロッパ生化学ジャーナル. 187 (2): 461– 465. doi : 10.1111/j.1432-1033.1990.tb15326.x . PMID 2298219.
- ^ ab Leon O, Quintana L, Peruzzo G, Slebe JC (1992). 「Alteromonas sp. C-1株由来の細胞外アガラーゼの精製と特性」.応用環境微生物学. 58 (12): 4060– 4063. Bibcode :1992ApEnM..58.4060L. doi :10.1128/aem.58.12.4060-4063.1992. PMC 183228. PMID 16348832 .
- ^ Parro V, Mellado RP, Harwood CR (1998). 「リン酸制限がStreptomyces lividans TK21によるアガラーゼ生産に及ぼす影響」. FEMS Microbiology Letters . 158 (1): 107– 113. doi : 10.1111/j.1574-6968.1998.tb12808.x .
外部リンク
- 米国国立医学図書館医学件名表題集（MeSH）のベータアガラーゼ
