クリスタリン

目に見つかったタンパク質
PDBファイル 1HY0に基づく、アヒル デルタ 1 クリスタリン の結晶構造。

解剖学においてクリスタリンは水溶性の構造タンパク質であり、水晶体角膜に存在し、 その構造の透明性を担っています。[1]また、心臓などの他の部位や、悪性乳がんの腫瘍にも存在が確認されています。[2] [3]水晶体の透明性の物理的起源と白内障 との関連性は、活発な研究分野です。[4]水晶体の損傷が神経再生を促進する可能性があることが示されているため、[5]クリスタリンは神経研究の分野となっています。これまでに、クリスタリンβb2(crybb2)が神経突起促進因子 である可能性が実証されています[6]

関数

クリスタリンの主な機能は、少なくとも眼の水晶体においては、光を遮ることなく屈折率を高めることであると考えられます。しかし、これが唯一の機能ではありません。クリスタリンは、水晶体内だけでなく体の他の部位においても、複数の代謝機能や調節機能を有することが明らかになっています。 [7]現在、βγ-クリスタリンドメインを含むタンパク質の多くが、ギリシャ鍵モチーフを新規カルシウム結合モチーフとするカルシウム結合タンパク質として特徴付けられています。 [8]

酵素活性と進化

ヒトクリスタリン遺伝子は染色体2と22に存在する。[9]

クリスタリンには活性酵素もあれば、活性を欠くものの他の酵素と相同性を示すものもある。 [10] [11]異なる生物群のクリスタリンは多数の異なるタンパク質と関連しており、鳥類や爬虫類のクリスタリンは乳酸脱水素酵素アルギニノコハク酸リアーゼ、哺乳類のクリスタリンはアルコール脱水素酵素キノン還元酵素、頭足動物のクリスタリンはグルタチオン S-トランスフェラーゼアルデヒド脱水素酵素と関連している。これらの酵素やその変異体は透明で溶解性が高く、動物の水晶体の材料となる可能性があった。[12]もともと1つの機能を持って進化したタンパク質が別の無関係な機能を果たすようにリクルートされることは、適応外適応の一例である[13]

クリスタリンは酵素から進化したように見えますが、ヒトゲノムにおけるクリスタリンのほとんどは遺伝子重複によって生じています。特に注目すべきは、ヒトゲノムには2つの遺伝子クラスターがあり、1つは2番染色体上に、もう1つは22番染色体上に存在することです。[14]

分類

ヒトのアルファ、ベータ、ガンマクリスタリンの配列アライメント。

脊椎動物の眼水晶体由来のクリスタリンは、主にα、β、γの3種類に分類されます。これらの区別は、ゲル濾過クロマトグラフィーカラムからの溶出順序に基づいています。これらはユビキタスクリスタリンとも呼ばれます。βクリスタリンとγクリスタリン( CRYGCなど)は、配列、構造、ドメイントポロジーが類似しているため、 βγ-クリスタリンと呼ばれるタンパク質スーパーファミリーにまとめられています。α-クリスタリンファミリーとβγ-クリスタリンは、水晶体に存在する主要なタンパク質ファミリーを構成しています。これらはすべての脊椎動物綱に存在しますが(ただし、鳥類の水晶体ではγ-クリスタリンは少ないか、存在しません)、δ-クリスタリンは爬虫類と鳥類にのみ存在します。[15] [16]

これらのクリスタリンに加えて、一部の生物の水晶体にのみ存在する、分類群特異的なクリスタリンも存在します。これらには、デルタ、イプシロン、タウ、イオタクリスタリンが含まれます。例えば、アルファ、ベータ、デルタクリスタリンは鳥類と爬虫類の水晶体に存在し、アルファ、ベータ、ガンマファミリーは他のすべての脊椎動物の水晶体に存在します。

アルファクリスタリン

タンパク質ファミリー
アルファクリスタリンA鎖、N末端
識別子
シンボルクリスタリン
ファムPF00525
インタープロIPR003090
利用可能なタンパク質構造:
ファム  構造 / ECOD  
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBサム構造の概要

アルファクリスタリンは、2種類の関連サブユニット(AおよびB)からなる大きな凝集体として存在し、特にC末端側において、小型(15~30kDa)の熱ショックタンパク質(sHSP)と非常に類似しています。これらのファミリー間の関係は、小型HSPファミリーからの典型的な遺伝子重複と分岐であり、これにより新たな機能への適応が可能になりました。分岐はおそらく眼の水晶体の進化以前に起こったと考えられ、アルファクリスタリンは水晶体外の組織にも少量存在しています。[15]

アルファクリスタリンは、変性タンパク質の沈殿を防ぎ、細胞のストレス耐性を高めるなど、シャペロンのような特性を持っています。 [17]これらの機能は、水晶体の透明性の維持と白内障の予防に重要であることが示唆されています。[18]これは、アルファクリスタリンの変異が白内障の形成と関連しているという観察によって裏付けられています[要出典]

αクリスタリンのN末端ドメインは二量体形成やシャペロン活性には必要ではないが、高次凝集体の形成には必要であると思われる。[19] [20]

ベータクリスタリンとガンマクリスタリン

タンパク質ファミリー
ベータ/ガンマクリスタリン
識別子
シンボルクリスタリン
ファムPF00030
インタープロIPR001064
プロサイトPDOC00197
SCOP24gcr / スコープ / SUPFAM
利用可能なタンパク質構造:
ファム  構造 / ECOD  
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBサム構造の概要

ベータクリスタリンとガンマクリスタリンは別のファミリーを形成します。[21] [22]構造的には、ベータクリスタリンとガンマクリスタリンは2つの類似したドメインで構成され、これらのドメインはそれぞれ2つの類似したモチーフで構成され、2つのドメインは短い連結ペプチドで連結されています。約40アミノ酸残基からなる各モチーフは、特徴的なギリシャ鍵型パターンで折り畳まれています。しかし、ベータクリスタリンは複雑な分子群からなるオリゴマーであるのに対し、ガンマクリスタリンはより単純なモノマーです。[23] [24]

ヒトクリスタリンのリスト[25]
UniProtエントリ名 代替遺伝子名 長さ
AIM1L_人間 AIM1L クライBG2 616
AIM1_人間 AIM1 クライブG1 1723
ARLY_HUMAN アメリカ手話 464
CRBA1_人間 クライバ1 クライバ1 215
CRBA2_人間 クライバ2 197
CRBB1_人間 クライBB1 252
CRBA4_人間 クライバ4 196
CRBB2_人間 クリBB2 クリB2 クリB2A 205
CRBB3_人間 クライブ3 クライブ3 211
CRBG3_人間 クライビージー3 1022
CRBS_HUMAN クライグス クライグ8 178
CRGA_人間 クライガ クライグ1 174
CRGC_ヒューマン クライグ クライグ3 174
CRGB_人間 CRYGB CRYG2 175
CRGN_人間 クライン 182
CRGD_HUMAN クライグド クライグ4 174
CRYAA_HUMAN CRYAA CRYA1 HSPB4 173
泣き虫人間 クライアブ クライア2 175
CRYL1_HUMAN CRYL1 泣き声 319
クライムヒューマン クリム・THBP 314
HSPB2_人間 HSPB2 182
HSPB3_人間 HSPB3 HSP27 HSPL27 150
HSPB8_人間 HSPB8 クライアック E2IG1 HSP22 PP1629 196
HSPB7_人間 HSPB7 CVHSP 170
HSPB9_人間 HSPB9 159
HSPB1_人間 HSPB1 HSP27 HSP28 205
HSPB6_人間 HSPB6 160
IFT25_人間 HSPB11 C1orf41 IFT25 HSPC034 144
MAF_人間 MAF 373
ODFP1_人間 ODF1 ODFP 250
QORL1_人間 クライズル1 4P11 349
QOR_HUMAN クライズ 329
ZEB1_人間 ZEB1 AREB6 TCF8 1124
Q9UFA7_人間 DKFZp434A0627 クライグス hCG_16149 120
B4DU04_人間 AIM1 hCG_33516 542
A8KAH6_人間 HSPB2 hCG_39461 182
Q6ICS9_人間 HSPB3 hCG_1736006 150
Q68DG0_人間 DKFZp779D0968 HSPB7 174
Q8N241_人間 HSPB7 hCG_23506 245
B4DLE8_人間 クライビージー3 1365
C3VMY8_人間 クライアブ 175
R4UMM2_ヒューマン クライBB2 205
B3KQL3_人間 119
Q24JT5_人間 クライガ 105
V9HWB6_人間 HEL55 160
B4DNC2_人間 196
V9HW27_人間 HEL-S-101 175
H0YCW8_人間 クライアブ 106
E9PHE4_人間 クリア 136
E9PNH7_人間 クライアブ 106
E7EWH7_人間 クリア 153
B4DL87_人間 170
V9HW43_人間 HEL-S-102 205
E9PR44_人間 クライアブ 174
Q8IVN0_人間 86
B7ZAH2_人間 542
C9J5A3_人間 HSPB7 124
E9PRS4_人間 クライアブ 69
K7EP04_人間 HSPB6 137
I3L3Y1_人間 クライム 97
H0YG30_人間 HSPB8 152
H9KVC2_ヒューマン クライム 272
E9PS12_人間 クライアブ 77
E9PIR9_ヒューマン AIM1L 787
B4DUL6_人間 80
I3NI53_人間 クライム 140
Q9NTH7_人間 DKFZp434L1713 264
J3KQW1_ヒューマン AIM1L 296
Q96QW7_人間 AIM1 316
I3L2W5_人間 クライム 165
B1AHR5_人間 クライBB3 113
B4DLI1_人間 403
I3L325_人間 クライム 241
Q7Z3C1_人間 DKFZp686A14192 191
B4DWM9_ヒューマン 154
Q71V83_人間 クリア 69
Q6P5P8_人間 AIM1 326
C9JDH2_ヒューマン クライバ2 129
B4DIA6_人間 155
Q13684_人間 56
F8WE04_人間 HSPB1 186
J3QRT1_人間 クライバ1 75
E9PRA8_人間 クライアブ 155
E9PJL7_人間 クライアブ 130
C9J5N2_人間 クライビージー3 229
I3L3J9_人間 クライム 26
C9J659_人間 クライビージー3 131
D3YTC6_人間 HSPB7 165

参考文献

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さらに読む

  • Graw J (1997). 「クリスタリン:遺伝子、タンパク質、そして疾患」.生化学. 378 (11): 1331– 1348. doi :10.1515/bchm.1997.378.11.1299. PMID  9426193.
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