アルファサテリテ科
ウイルスのファミリー
アルファサテリテ科
ウイルスの分類 この分類を編集する
非公式グループ： ウイルス以外の物質
非公式グループ： 衛星核酸
家族： アルファサテリテ科

アルファサテリテ科は、一本鎖DNAサテライト核酸のファミリーであり、ゲノム複製に別のウイルス（ヘルパーウイルス）の存在に依存しています。そのため、これらのウイルスのゲノムは最小限で、ゲノム冗長性は非常に低くなっています。ゲノムは単一の環状DNA分子です。最初のアルファサテライトは1999年に記載され、ワタ葉巻病とアゲラタム黄脈病に関連していました。 [1] [2]ベゴモウイルスの分子レベルでの特徴づけが進むにつれて、記載されるアルファサテライトの数も増加しています。

これらのウイルスは以前はDNA 1コンポーネントとして知られていました。[3]

これらのウイルスは一般的に旧世界で発見されています。新世界からもいくつか分離されていますが、宿主ウイルスとの関連性については依然として研究が続いています。

ゲノム

ゲノムの長さは1300～1400ヌクレオチドで、ヘアピン構造、単一のオープンリーディングフレーム（ORF）、アデニンに富む領域という3つの保存された特徴を持っています。[4]

ヘアピン構造は、ナノウイルスに共通するノナヌクレオチドTAGTATTACを含むループ構造を有し、ジェミニウイルスのTAATATTAC配列とは1ヌクレオチド異なります。ジェミニウイルスとナノウイルスの両方において、この配列は複製開始点（ori）を含み、ローリングサークル複製開始タンパク質によって切断されてウイルスDNAの複製が開始されます。ヘアピン構造に基づいて、アルファサテライトは5つのクレードに分類されます。[5]

オープンリーディングフレームは、ナノウイルスに見られるものと同様のローリングサークル型複製開始タンパク質（Rep）をコードしています。コードされているタンパク質は分子量約36.6キロダルトンで、約315個のアミノ酸から構成されています。分離株間のアミノ酸配列は86.3～100.0%の相同性を示し、高度に保存されています。 [5]

アデニンリッチ領域はrep遺伝子のすぐ下流にあり、長さは約153～169ヌクレオチドで、アデニン含有量は52.3～58.4%です。この領域の系統解析では、ゲノム全体の系統解析で見られる系統群に対応する3つの系統群に分類できることが示されています。[5]このゲノム領域は冗長性があると考えられます。[6]

アルファサテライトウイルスのゲノム中に推定上の第2ORFが存在することが報告されている。[7]この発見の意義（もしあるとすれば）は不明である。

組み換えはアルファサテライト間で起こる。[8]

ウイルス学

ウイルスゲノムはヘルパーウイルスのコートタンパク質内に封入されているため、特徴的なウイルス粒子は存在しない。[5]

ベゴモウイルスに関連するアルファサテライトは、植物内での移動や昆虫媒介にベゴモウイルスを必要とするが、宿主植物内で自己複製することができる。これらは植物に病気を引き起こしたり、ベゴモウイルスによる感染経路を変化させたりすることはないと思われる。ベゴモウイルスによる感染の重症度を軽減する可能性がある。[9] [10]

アルファサテライトはナノウイルス科に関連して記載されている。これらはやや短い（1100～1300ヌクレオチド）傾向があるが、rep遺伝子に加えてタンパク質もコードする。ナノウイルス科は複数の構成要素からなるゲノムであるため、当初はこれらは別個のゲノムとして認識されていなかった。[11] [12] [13]

アルファサテライトはRNAサイレンシングの標的となる可能性がある。[14]

分類学

アルファサテライト類はアルファサテライト科に分類されます。この科には3亜科、18属、85種が含まれます。以下の亜科と属が認められています（-satellitinaeは亜科、-satellit は属を表します）。[15]

  • ジェミニアルファサテリチナエ
    • エイジエシス衛星
    • クレクルサテライト
    • コレクサテライト
    • ドラフライサテライト
    • ゴスムサテライト
    • ソマサテライト
    • ウィフライサテライト
  • ナノアルファサテリチナ
    • クロスタンサテライト
    • ファベネ衛星
    • ミルベサテライト
    • ミヴェドワーサテライト
    • ソフォイエサテライト
    • サブクローブ衛星
  • ペトロモアルファサテリチナエ
    • バブサテライト
    • ココサテライト
    • コプラサテライト
    • コバリサテライト
    • マスカーサテライト

進化

アルファサテライトとナノウイルスのREPタンパク質の類似性を考慮すると、アルファサテライトはナノウイルスから進化した可能性が高い。[5]

用途

これらのウイルスは、ウイルス遺伝子サイレンシング研究の開発に使用されてきた。[16]

参考文献

  1. ^ Saunders K, Stanley J (1999年11月). 「A nanovirus-like DNA component associated with yellow vein disease of Ageratum conyzoides: evidence for interfamilial recombination between plant DNA viruses. Virology . 264 (1): 142– 52. doi : 10.1006/viro.1999.9948 . PMID  10544139.
  2. ^ Mansoor S, Khan SH, Bashir A, et al. (1999年6月). 「パキスタンにおけるワタ葉巻病に関連する新規環状一本鎖DNAの同定」. Virology . 259 (1): 190–9 . doi : 10.1006/viro.1999.9766 . PMID  10364503.
  3. ^ Stanley J (2004年2月). 「ジェミニウイルス疾患複合体に関連するサブウイルスDNA」. Vet. Microbiol . 98 (2): 121–9 . doi :10.1016/j.vetmic.2003.10.005. PMID  14741124.
  4. ^ Briddon RW, Bull SE, Amin I, et al. (2004年7月). 「DNA 1の多様性：単分節ベゴモウイルス-DNAベータ複合体に関連するサテライト様分子」. Virology . 324 (2): 462–74 . doi : 10.1016/j.virol.2004.03.041 . PMID  15207631.
  5. ^ abcde Xie Y, Wu P, Liu P, Gong H, Zhou X (2010). 「中国雲南省におけるモノパータイトベゴモウイルス／ベータサテライト複合体に関連するアルファサテライトの特性評価」Virol. J. 7 : 178. doi : 10.1186/1743-422X-7-178 . PMC 2922188. PMID 20678232  . 
  6. ^ Shahid MS, Ali L, Andleeb S (2009). 「パキスタンにおけるワタ葉巻病に関連するアルファサテライトのaリッチ領域の機能」(PDF) . EurAsia J BioSci . 3 : 152–6 . 2014年3月8日時点のオリジナル(PDF)からアーカイブ。 2014年3月8日閲覧。
  7. ^ Romay G, Chirinos D, Geraud-Pouey F, Desbiez C (2010年11月). 「非定型アルファサテライトと二分節型新世界ベゴモウイルスの関連性」 . Arch. Virol . 155 (11): 1843–7 . doi :10.1007/s00705-010-0760-7. PMID  20665058. S2CID  20039085.
  8. ^ Kumar J, Kumar A, Roy JK, Tuli R, Khan JA (2010年8月). 「Cyamopsis tetragonolobaに感染するベゴモウイルスおよび関連サテライトDNA分子の同定と分子特性解析」.ウイルス遺伝子. 41 (1): 118–25 . doi :10.1007/s11262-010-0482-7. PMID  20405195. S2CID  6790138.
  9. ^ Idris AM, Shahid MS, Briddon RW, Khan AJ, Zhu JK, Brown JK (2011年3月). 「モノパータイトベゴモウイルスに関連する異常なアルファサテライトは症状を緩和し、ベータサテライトの蓄積を減少させる」(pdf) . J. Gen. Virol . 92 (Pt 3): 706–17 . doi : 10.1099/vir.0.025288-0 . PMID  21084498.
  10. ^ Nawaz-Ul-Rehman MS, Nahid N, Mansoor S, Briddon RW, Fauquet CM (2010年9月). 「ベゴモウイルスに関連する2つの非病原性アルファサテライトの転写後遺伝子サイレンシング抑制活性」. Virology . 405 (2): 300–8 . doi : 10.1016/j.virol.2010.06.024 . PMID  20598726.
  11. ^ Katul L, Maiss E, Vetten HJ (1995年2月). 「推定レプリカーゼ遺伝子を含むソラマメ壊死性黄化ウイルスDNA成分の配列解析」(pdf) . J. Gen. Virol . 76 (Pt 2): 475–9 . doi : 10.1099/0022-1317-76-2-475 . PMID  7844570.
  12. ^ Katul L, Timchenko T, Gronenborn B, Vetten HJ (1998年12月). 「10種類の環状ssDNA成分（うち4種類は推定複製関連タンパク質をコードする）がソラマメ壊死性黄化ウイルスゲノムと関連している」（pdf） . J. Gen. Virol . 79 (Pt 12): 3101–9 . doi : 10.1099/0022-1317-79-12-3101 . PMID  9880028.
  13. ^ 佐野雄三、和田正之、橋本雄三、松本毅、小島正之（1998年12月）「ミルクベッチドワーフウイルスゲノムに関連する10個の環状ssDNA成分の配列」（pdf） J . Gen. Virol . 79 (Pt 12): 3111–8 . doi : 10.1099/0022-1317-79-12-3111 . PMID  9880029.
  14. ^ Amin I, Hussain K, Akbergenov R, et al. (2011年8月). 「ワタ葉巻病ベゴモウイルス-ベータサテライト複合体の構成要素によってコードされるRNAサイレンシング抑制因子」. Mol. Plant Microbe Interact . 24 (8): 973–83 . doi : 10.1094/MPMI-01-11-0001 . PMID  21751853.
  15. ^ 「ウイルス分類：2022年版」国際ウイルス分類委員会（ICTV） 2023年3月。 2023年8月14日閲覧。
  16. ^ Huang CJ, Zhang T, Li FF, Zhang XY, Zhou XP (2011年2月). 「ジェミニウイルスアルファサテライトを用いたニコチアナ・タバカムにおける効率的なウイルス誘導性遺伝子サイレンシングシステムの開発と応用」. J Zhejiang Univ Sci B. 12 ( 2): 83– 92. doi :10.1631/jzus.B1000157. PMC 3030953. PMID 21265040  . 
  • ViralZone アルファサテリチダエ
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