アンドレアス・ドレーガー
ドイツのバイオインフォマティクス研究者（1980年生まれ）
アンドレアス・ドレーガー
ドレーガー、2019年沖縄国際システム生物学会議（ICSB）に出席
生まれる（1980年9月20日）1980年9月20日（45歳）
ヴィプラ、東ドイツ
母校
知られている感染症の数理モデル化、JSBML
子供たち三つ
受賞歴
  • iGEM銅メダル（2016年）および金メダル（2014年）
  • F1000プレゼンテーション賞（2016）
  • 論文賞（2011年）
科学者としてのキャリア
フィールド
機関
論文生化学ネットワークの計算モデリング （2011）
博士課程の指導教員アンドレアス・ツェル
その他の学術アドバイザー
Webサイトuni-tuebingen.de/en/127116

アンドレアス・ドレーガー（ドイツ語: [anˈdʁeːas ˈdʁɛːɡɐ] ; 1980年9月20日生まれ）は、マルティン・ルター・ハレ＝ヴィッテンベルク大学のデータ分析とバイオインフォマティクスの研究グループを率いるドイツのバイオインフォマティクス研究者である。

教育

高校生の頃、ドレーガーはコンピュータサイエンスと、 1990年代後半の遺伝学およびバイオテクノロジーの最近の進歩に魅了されていました。これらの技術を組み合わせることができる新しい学位プログラムを知ったとき、彼はすぐにインスピレーションを受けました。そこで、ドレーガーは2000年から2006年まで、ハレ（ザーレ）のマルティン・ルター・ハレ＝ヴィッテンベルク大学でバイオインフォマティクスを学びました。彼はベルリンのマックス・プランク分子遺伝学研究所でゲノム配列解析のインターンとして働きました。彼はシカゴのイリノイ大学の微生物学科で重金属耐性細菌についての論文を準備しました。ドレーガーはテュービンゲンのバイオインフォマティクスセンター（ZBIT）で仮想肝臓における代謝ネットワークの動的シミュレーションに焦点を当てた博士号を取得しました。この間、 2010年に横浜の慶応義塾大学でソフトウェア工学の客員研究員として勤務した。日本から帰国後、テュービンゲン大学理学部は彼の論文を2011年の博士論文賞として表彰した。[a]

キャリア

2011年初頭、ドレーガー氏はポスドク研究員として独立した研究プロジェクトの資金提供を受けました。2013年には、ラホヤでマリー・キュリー研究員としてさらに2年間のポスドクプログラムに参加しました。UCSD （カリフォルニア大学サンディエゴ校）のシステム生物学研究グループに所属していました。2015年にテュービンゲンに戻り、同大学で独立した研究グループを設立しました。2018年には、テュービンゲンに新設されたバイオインフォマティクスと医療情報学の学部間研究所（IBMI）において、感染症および抗菌薬耐性病原体の計算システム生物学の准教授に任命されました。彼の研究グループは、テュービンゲンのエクセレンス・クラスター「感染症と闘うための微生物の制御」（CMFI）に所属していました。 2024年2月、ドレーガーは大学教授に任命され、それ以来ハレ＝ヴィッテンベルクのマルティン・ルター大学でデータ分析とバイオインフォマティクスの教授職を務めており、[b]彼のグループはテュービンゲン大学のドイツ国立感染研究センター（DZIF）に所属し続けている。

研究

アンドレアス・ドレーガーの研究は、抗生物質耐性の背後にある代謝メカニズムの数理モデルに焦点を当てています。彼の研究グループの中心的側面は、鼻腔から肺までの気道内に生息するヒトマイクロバイオームです。ドレーガーは、生命を脅かす細菌[1] [2]およびウイルス感染症[3] [4]と戦うための新しい方法を見つけることを目指しています 。呼吸器の院内感染症は、抗生物質治療に対する多剤耐性を持つ細菌が関与することが多いため、最優先事項となっています。この生息地に生息する特に有害な細菌には、緑膿菌[5] [2]や黄色ブドウ球菌[1]などがあります。もう1つの研究分野は、嚢胞性線維症患者などのリスクグループに関するものです。この取り組みに代謝ネットワークモデリングを適用するには、病原体、常在細菌、およびそれらの宿主間の相互作用の根底にあるプロセスを包括的に理解する必要があります。[6] [7]

この作業には、システム生物学全般におけるコンピュータモデルの作成、分析、共有に特化したソフトウェアの開発も必要です。このため、このグループは、国際的な研究者のComputational Modeling in Biology Networkによる取り組みの一環である、システム生物学におけるいくつかの標準化の取り組みにも積極的に参加しています。 [8] Drägerは、FAIRデータの原則（検索可能、アクセス可能、相互運用可能、再利用可能）に従って開発されたコンピュータモデルの相互運用性と再利用性の向上が、生物学におけるコンピュータシミュレーションの信頼性の高い実装の前提条件であると考えています。[9]この目的のために、Drägerと彼のグループは、JSBMLやSBSCLなどの科学的オープンソースソフトウェアを開発しています。[10] 2015年に、科学界は彼をシステム生物学ファイル形式SBMLの開発の編集者に選出し、2018年にはグラフィカルモデリング言語SBGNの編集者に選出しました。[11] 2016年、ドレーガーは国際計算生物学会（ISCB）内のシステムモデリング（SysMod） [12]に特別な関心を持つ年次コミュニティミーティングの創設者の一人となり、 2018年から2022年に退任するまで事実上の議長を務めました。[13]

COVID-19パンデミックの間、ドレーガー社によるヒト細胞内SARS-CoV-2の計算モデル化に関する研究[14] [15]は、医薬品開発の潜在的標的を予測したため、 国際的な関心を集めました[c] [d] [e ] [f] [g] [h] [i] 。その標的の一つがヒト酵素グアニル酸キナーゼです。ドレーガー社はこのテーマに関する継続的な研究を、パンデミックへの備えに焦点を当てて行っています[16] 。

コミットメントとボランティア活動

彼は3年以上にわたり、ナゴルトの「オットー・ハーン」高校の高校生にバイオインフォマティクスとシステム生物学の講座を提供し、その中には青少年研究コンテストでの指導も含まれていました。[j]

  • Google Scholarに索引付けされたAndreas Drägerの出版物
  • アンドレアス・ドレーガーの研究グループ
  • システム生物学のためのソフトウェア
  • アンドレアス・ドレーゲルの YouTube チャンネル

ニュースや公共メディアへの出演（抜粋）

  1. ^ “Zentrale Promotionsfeier der Universität Tübingen” [テュービンゲン大学の中央卒業式].ニュースレター Uni Tübingen aktuell Nr. 2011 年 4 月: Termine und Veranstaltungen (ドイツ語)。テュービンゲン大学。 2011年7月16日。
  2. ^ マルティン・ルーサー大学 ハレ・ヴィッテンベルク(2024-03-27). 「Neue Professorinnen und Professoren an der Universität Halle」。Neue Professorinnen und Professoren an der Universität Halle (ドイツ語)。ハレ（ザーレ）。2024 年 8 月 8 日に取得。
  3. ^ ウィッティヒ、フランク (2021-03-18). 「ブライベンはメディカメンテに死ぬのか？」 [薬はどこにありますか?]。odysso – Wissen im SWR (ドイツ語)。SWRフェルンゼヘン。
  4. ^ オーガスティン、ビルギット (2021-02-03). 「コロナ: ウイルスは感染症ですか?」 [コロナ: 新薬はウイルスに対してどの程度効果があるのでしょうか?]。訪問してください（ドイツ語）。北ドイツ放送局。
  5. ^ ペトルノワ、ツヴェテリーナ (2021-01-17). 「Ексклузивно: Първа стъпка към откриването лекарство срещу COVID-19」[独占: 新型コロナウイルス感染症の治療薬発見に向けた第一歩]。Тази неделя (ブルガリア語)。bTV (ブルガリア)。
  6. ^ ベレムリスキ、ニコライ (2021-01-17). 「СЛАБОТО МЯСТО НА COVID-19: Близо ли сме до победата над заразата?」 [新型コロナウイルス感染症の弱点: 私たちは疫病の克服に近づいていますか?]。неделята (ブルガリア語)。Nova (ブルガリアのテレビチャンネル)。
  7. ^ “Ученые РФ и ФРГ нали способы уничтожать COVID-19” [ロシアとドイツの科学者は、新型コロナウイルス感染症を破壊する方法を発見した]。Смотрим（ロシア語）。ロシア-24。 2021-11-01.
  8. ^ ハンネマン、コーネリア (2021-01-10). 「Entdeckung könnte Weg zu Colon-Medikament ebnen」[発見はコロナ治療薬への道を開く可能性がある]。ヴィッセン（ドイツ語）。Nテレビ。
  9. ^ プリーゼ、アンナ (2021-01-09). 「Neuer Ansatz für Colon-Therapie an Tübinger Uni」[テュービンゲン大学におけるコロナ治療への新しいアプローチ]。SWR アクトゥエル(ドイツ語)。SWRフェルンゼヘン。
  10. ^ “Mit Stolz präsentieren sie erste Ergebnisse” [彼らは誇らしげに最初の結果を発表する]. Schwarzwälder Bote (ドイツ語)。シュヴァルツヴェルダー ボーテ メディエンゼルシャフト mbH。 2021年7月21日。

参考文献

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  2. ^ ab Payne, Dawson D.; Renz, Alina; Dunphy, Laura J.; Lewis, Taylor; Dräger, Andreas; Papin, Jason A. (2021). 「Pseudomonas aeruginosa PA14のゲノムスケール代謝ネットワーク再構築の最新版：ムチン誘導性細菌代謝シフトの特徴づけ」(PDF) . npj Systems Biology and Applications . 7 (1): 37. doi :10.1038/s41540-021-00198-2. PMC 8501023. PMID 34625561.  S2CID 232224404  .  
  3. ^ バーナルデス、ジョアナ P.ミシュラ、ネーハ。トラン、フロリアン。バーマー、トーマス。よろしくね、レナ。ブラーゼ、ジョアンナ I.ボルドーニ、ドーラ。フランツェンブルク、ジャネット。ガイセン、ウルフ;ジョセフス・スポールディング、ジョナサン。ケーラー、フィリップ。クンストナー、アクセル。ロザティ、エリサ。アシェンブレナー、アンナ C.バッハー、ペトラ。バラン、ネイサン。ボイセン、テイデ。ブラント、ブルクハルト。ブルース、ニクラス。ドール、ジョナサン。ドレーゲル、アンドレアス;エルケ、グンナル。デヴィッド・エリングハウス。フィッシャー、ジュリア。フォースター、マイケル。フランケ、アンドレ。フランツェンブルク、セーレン。フレイ、ノーバート。フリードリヒス、アネット。フス、ジャニナ。グリュック、アンドレアス。ハム、ジェイコブ。フィン・ヒンリヒセン。ヘプナー、マーク P.うーん、サイモン。ユエンカー、ラルフ。カイザー、シーナ。カン、イン・H。ライナー、ノール。ランゲ、クリストフ。ラウエ、ゲオルグ。リエ、クレメス。リンドナー、マティアス。マリノス、ゲオルギオス。ロバート・マーケウィッツ。ナッターマン、ジェイコブ。いや、ライナー。ピッカーズ、ピーター。ラーベ、クラウス F.レンツ、アリーナ。ロッケン、クリストフ。ラップ、ジャン。シャファツィク、アニカ。シェフォルド、アレクサンダー。シュルテ・シュレッピング、ジョナス。シュンク、ドマゴジ。スコワッシュ、ディルク。ウラス、トーマス。ワンディンガー、クラウス・ピーター。ウィティヒ、マイケル。ツィンマーマン、ヨハネス。ブッシュ、ハウケ。ホイヤー、ビンバ F.カレタ、クリストフ。ヤン・ハイケンドルフ。コックス、マタイス。ヤン・リブニカー。シュライバー、ステファン。シュルツェ、ヨアヒム。ローゼンスティル、フィリップ。バノビッチ、ニコラス E.デサイ、トゥシャール。エッケルベルク、オリバー;ハニファ、ムズリファ。ホーバス、ピーター。クロプスキー、ジョナサン A.ラフィアティス、ロバート。ルンデバーグ、ヨアキム。マイヤー、カースティン。ナウィン、マルティン C.マルコ、ニコリック。オルドバス・モンタネス、ホセ。ピア、ダナ。タタ、プルショタマ・ラオ。ローリンズ、エマ。レゲブ、アビブ;リーフマン、ポール。サマコヴリス、クリストス。シュルツェ、ヨアヒム。シャレク、アレックス。シェパード、ダグラス。スペンス、ジェイソン。タイヒマン、サラ。タイス、ファビアン。アレクサンダー・ツァンコフ。ファン・デン・ベルゲ、マールテン州。フォン・パーペン、マイケル。ジェフリー・ホイットセット。サラゴシ、ローレ・エマニュエル。アンジェロフ、天使。バルス、ロバート。バルトロメウス、アレクサンダー。ベッカー、アンケ。ベズダン、ダニエラ。ボニファシオ、エツィオ。ボーク、ピア。クラベル、トーマス。コルム・タッチェ、マリア。ディーフェンバッハ、アンドレアス。ディルタイ、アレクサンダー。フィッシャー、ニコール。フェルストナー、コンラッド。フリック、ジュリア・ステファニー。ガグヌール、ジュリアン。グースマン、アレクサンダー。ハイン、トルステン。フンメル、マイケル。ヤンセン、ステファン。カリノフスキー、ヨルン。カリーズ、ルネ。ケール、ビルテ。ケラー、アンドレアス。キム・ヘルムート、サラ。クリストフ・クライン。コールバッカー、オリバー。コーベル、ジャン・O.クルス、インゴ。ラントターラー、マルクス。リー、ヤン。ルートヴィヒ、カースティン。マカレウィッツ、オリウィア。マーツ、マンジャ。アリス、マクハーディ。メルテス、クリスチャン。ネーテン、マルクス。ニュルンベルク、ピーター。オーラー、ウーヴェ。オソウスキー、ステファン。オーバーマン、ヨルグ。ピーター、シルケ。フェファー、クラウス。ポエッチ、アンナ R.ピューラー、アルフレッド。ラジェフスキー、ニクラス。ラルサー、マルクス。リース、オラフ。リプケ、ステファン。ヌネス・ダ・ロシャ、ウリセス。サリバ、アントワーヌ・エマニュエル。サンダー、レイフ・エリック。サウィツキー、ビルギット。フィリップ・シファー。シュルテ、エヴァ・クリスティーナ。アレクサンダー・シルバ;スティーグル、オリバー。ストイ、イェンス。ヴェレスチャイルド、ヤンネ。フォーゲル、ヨルク。クライスト、マックス・フォン。ウォーカー、アンドレアス；ウォルター、ヨーン；ヴィエツォレク、ダグマー；ジーブール、ジョン（2020）。「縦断的マルチオミクス解析により巨核球の反応が特定される。「重症COVID-19の経過の特徴として赤血球系細胞と形質芽球が挙げられます」。免疫。53 (6): 1296–1314.e9。土井：10.1016/j.immuni.2020.11.017。ISSN  1074-7613。PMC  7689306。PMID  33296687。S2CID 227163641  。
  4. ^ Ostaszewski, Marek; et al. (2021). 「COVID19 Disease Map：ウイルス–宿主相互作用メカニズムの計算知識リポジトリ」. Molecular Systems Biology . 17 (10) e10387. doi :10.15252/msb.202110387. PMC 8524328. PMID 34664389.  S2CID 239027089  .  
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  13. ^ ニアラキス、アンナ;タカール、ジュリー。バルベリス、マッテオ。ロドリゲス・マルティネス、マリア。ヘリカル、トマーシュ。マーク・バートウィッスル。チャウイヤ、クロディーヌ。カルゾーネ、ローレンス。ドレーゲル、アンドレアス (2022)。 「健康と病気における計算モデリング。第 6 回年次 SysMod 会議のハイライト」(PDF)。バイオインフォマティクス。38 (21): 4990–4993。土井:10.1093/bioinformatics/btac609。
  14. ^ Renz, Alina; Widerspick, Lina; Dräger, Andreas (2020). 「FBAは、SARS-CoV-2に対する抗ウイルス療法の潜在的標的としてグアニル酸キナーゼを明らかにする」(PDF) . Bioinformatics . 36 (Suppl 2): i813 – i821 . doi :10.1093/bioinformatics/btaa813. PMC 7773487. PMID 33381848.  S2CID 229929774  .  
  15. ^ Renz, Alina; Widerspick, Lina; Dräger, Andreas (2021). 「SARS-CoV-2変異体感染のゲノムスケール代謝モデルは、グアニル酸キナーゼが強力な抗ウイルス標的となる可能性を確認」Genes . 12 (6): 796. doi : 10.3390/genes12060796 . PMC 8225150 . PMID  34073716. S2CID  235300463. 
  16. ^ Leonidou, Nantia; Renz, Alina; Mostolizadeh, Reihaneh; Dräger, Andreas (2023). 「新たなワークフローは、感染細胞における代謝変化を介してSARS-CoV-2に対する薬剤標的を予測する」. PLOS Computational Biology . 19 (3​​) e1010903. doi : 10.1371/journal.pcbi.1010903 . PMC 10035753. PMID  36952396. S2CID  257715107. 
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