アンドレイ・シャリ
アンドレイ・シャリ | |
|---|---|
 ISMB 2012で講演する Šali 氏。 | |
| 生まれる | 1963年（62～63歳） |
| 母校 | ロンドン大学バークベック・カレッジ |
| 科学者としてのキャリア | |
| 機関 | カリフォルニア大学サンフランシスコ校、ハーバード大学、ロックフェラー大学、ロンドン大学バークベック・カレッジ、リュブリャナ大学 |
| 論文 | アミノ酸配列からタンパク質の三次元構造をモデル化する （1991） |
| 博士課程の指導教員 | トム・ブランデル |
| Webサイト | www.salilab.org |
アンドレイ・シャリ（1963年、スロベニア、クラーニ生まれ）は計算構造生物学者です。2003年より、カリフォルニア大学サンフランシスコ校のバイオエンジニアリング・治療科学科の教授を務めています。[ 1 ]また、 Structure誌の編集者も務めています。
教育
シャリは1987年にリュブリャナ大学で化学の理学士号を取得し、1991年にロンドン大学バークベック・カレッジで分子生物物理学の博士号を取得（トム・ブランデルの指導の下）。その後、ハーバード大学で博士研究員としてマーティン・カルプラスの指導の下研究を行った。
研究
サリはハーバード大学でのポスドク研究を経て、1995年にロックフェラー大学の教員に着任した。彼は物理法則と進化法則に基づいた計算を用いて、タンパク質の構造と機能を研究している。例えば、空間制約を満たすことによる比較タンパク質構造モデリング（MODELLERプログラム[ 3 ]に実装）や、高分子集合体の統合的構造決定（IMPプログラム[ 4 ]に実装）を開発している。
研究のインパクト
サリ氏は、タンパク質の構造モデリングと解析のための計算手法の開発と応用を通じて、構造生物学に大きく貢献しています。彼の研究グループが開発した最もよく使われている2つのプログラムは、比較タンパク質構造モデリング用の「MODELLER」と統合構造決定用の「IMP」です。
2022年1月現在、シャリは約400本の論文を発表しており[ 5 ]、Google Scholarによると約89,000回引用されています。彼のヒルシュ指数は132です（つまり、132本の論文が少なくとも132回引用されているということです）。
2018年、シャリは生物物理学と計算生物学への貢献が認められ、米国科学アカデミーの会員に選出された。[ 6 ]
Šali Labの著名な卒業生
| 名前 | 研究室のポジション | 間隔 | 現在の場所 | 現在の位置 |
|---|---|---|---|---|
| フランク・アルバー | ポストドクター研究員 | カリフォルニア大学ロサンゼルス校（米国カリフォルニア州） | 教授 | |
| アンドラス・フィザー | ポストドクター研究員 | 1997年9月から2002年12月 | アルバート・アインシュタイン医科大学、ニューヨーク州ブロンクス | 教授 |
| レイチェル・カーチン | ポストドクター研究員 | 2003年8月から2006年8月 | ジョンズ・ホプキンス大学 | 教授 |
| ドミトリー・コルキン | ポストドクター研究員 | 2002年9月から2007年7月 | ウースター工科大学 | 教授 |
| マーク・A・マルティ・レノム | ポストドクター研究員 非常勤助教授 | 1999年2月から2006年6月 | スペイン、バルセロナ国立ゲノム解析センター（CNAG） | グループリーダー |
| MS マドゥスダン | ポストドクター研究員 | 2000年2月から2008年3月 | IISER、プネ、インド | 准教授 |
| マヤ・トプフ | ポストドクター研究員 | 2003年から2006年 | 構造システム生物学センター（ドイツ、ハンブルク） | 教授 |
| デビッド・バーカン | 博士課程学生 | 2006年9月から2011年10月 | プロタゴニスト・セラピューティクス | スタッフサイエンティスト |
参考文献
- ^ Andrej Šaliの出版物はMicrosoft Academicに索引付けされている
- ^ Sali, Andrej (1984).アミノ酸配列に基づくタンパク質の三次元構造モデリング（博士論文）. ロンドン、バークベック・カレッジ.
- ^ Šali, A.; Blundell, TL (1993). 「空間的制約の充足による比較タンパク質モデリング」. Journal of Molecular Biology . 234 (3): 779– 815. doi : 10.1006/jmbi.1993.1626 . PMID 8254673 .
- ^ Russel, D.; Lasker, K.; Webb, B.; Velázquez-Muriel, J.; Tjioe, E.; Schneidman-Duhovny, D.; Peterson, B.; Sali, A. (2012). 「Putting the Pieces Together: 高分子アセンブリの構造決定のための統合モデリングプラットフォームソフトウェア」 . PLOS Biology . 10 (1) e1001244. doi : 10.1371/journal.pbio.1001244 . PMC 3260315. PMID 22272186 .
- ^アンドレイ・シャリの出版物
- ^ 「Andrej Sali」 . 米国科学アカデミー. 2018年7月23日閲覧。
外部リンク
