アトラントゲナタ

アトラントゲナタ; 時間範囲:暁新世～現世プレꞒ Ꞓ お S D C P T J K ページ北白亜紀起源の可能性
科学的分類
王国：	動物界
門:	脊索動物
クラス：	哺乳類
インフラクラス:	胎盤
マグノーダー：	Atlantogenata ; Waddell 他、1999
サブグループ
	アフロテリア; 異節動物;
同義語
	アトラントゲンタ（フィリップス、2001）; ノトプラセンタリア(Arnason、2008) ; ゼナフロテリア（アッシャー、2005）;

哺乳類の大目

アトラントゲナタ（「大西洋周辺で生まれた」）^[5]は、有胎盤哺乳類の大目であり、異節上目（Xenarthra）およびアフリカ上目（Afrotheria）のコホートまたは上目を含む。^[1]これらのグループは、おそらく白亜紀にそれぞれ南アメリカ大陸とアフリカ大陸で起源と拡散した。ボレオユーテリア（Boreoeutheria）と共に有胎盤類（Placentalia）を構成する。このグループの単系統性は、いくつかの遺伝学的証拠によって裏付けられている。^[6]^[7]

代替仮説としては、解剖学的およびその他の生理学的証拠によって一般的に裏付けられているように、BoreoeutheriaとAfrotheriaが合体してEpitheriaを形成する、あるいはBoreoeutheriaとXenarthraが合体してExafroplacentaliaまたはNotolegiaを形成するという仮説がある。^[8]

いくつかの研究によると、分岐前後の転移因子挿入に関する最新の解析は、有胎盤哺乳類の3つの上目（アフリカ獣類、北真獣類、異節類）がほぼ同時に起源（三分岐）したとする第4の仮説を強く支持している。 ^[9]^[10]しかし、2016年の解析では、このような矛盾した系統発生は進化モデルの適合性の低さに起因するものであり、アトラントゲナタ仮説が最も支持されていると結論付けられた。分子時計解析に基づくと、クラウングループのアトラントゲナタは8400万年から9700万年前に分岐したと推定される。^[11]

胎盤

アトラントゲナタ

	異節動物

	アフロテリア

ボレオエウテリア

	ローラシアテリア

	エウアルコントグリレス

以下に現存するアトラントゲナーテ科の系統発生を示します。

アトラントゲナタ

異節動物

シングラータ

	ダシポダ科

	クラミフォリダエ科

ピロサ

ベルミリングア

	キクロペディ科

	アリクイ科

フォリボラ

	ブラディポダエ科

	チョロエポディダエ科

アフロテリア

参考文献

^ ab Waddell, Peter J.; Cao, Ying; Hasegawa, Masami; Mindell, David P. (1999). 「ミトコンドリアタンパク質配列全体と拡張統計フレームワークを用いた鳥類および胎盤哺乳類における白亜紀の超序列分岐時期の評価」Systematic Biology . 48 (1): 119– 137. doi : 10.1080/106351599260481 . PMID 12078636.
^ フィリップス, マシュー・J.; リン, ユーシン; ハリソン, ガブリエル; ペニー, デイビッド (2001). 「バンディクートとフクロギツネのミトコンドリアゲノムは、オーストラリア有袋類の単系統性を裏付ける」.ロンドン王立協会紀要. シリーズB: 生物科学. 268 (1475): 1533– 1538. doi :10.1098/rspb.2001.1677.
^ Arnason U., Adegoke JA, Gullberg A., Harley EH, Janke A., Kullberg M. (2008.)「胎盤哺乳類のミトゲノミクス関係とその分岐の分子的推定」Gene.; 421(1-2):37–51
^ Asher RJ (2005.)「食虫類の胎盤哺乳類：形質進化と化石史」KD Rose、JD Archibold共著『胎盤哺乳類の台頭：主要現存クレードの起源と関係』ボルチモアおよびロンドン、ジョンズ・ホプキンス大学出版ISBN 978-0-8018-8022-3
^ イアン・R・ティザード（2023年）『比較哺乳類免疫学：哺乳類の免疫システムの進化と多様性』アカデミック・プレス、411頁。ISBN 978-0-32395-220-0. 2024年12月16日閲覧。
^ Waddell, Peter J.; Okada, Norohiro; Hasegawa, Masami (1999). 「胎盤哺乳類の系統関係の解明に向けて」. Systematic Biology . 48 (1): 1– 5. doi : 10.1093/sysbio/48.1.1 . PMID 12078634.
^ Murphy, WJ; Pringle, TH; Crider, TA; Springer, MS; Miller, W. (2007). 「ゲノムデータを用いた胎盤哺乳類の系統発生の根源の解明」. Genome Research . 17 (4): 413– 421. doi :10.1101/gr.5918807. PMC 1832088. PMID 17322288 .
^ Wildman, Derek E.; Chen, Caoyi; Erez, Offer; Grossman, Lawrence I.; Goodman, Morris; Romero, Roberto (2006). 「系統解析による哺乳類胎盤の進化」. Proceedings of the National Academy of Sciences . 103 (9): 3203– 3208. Bibcode :2006PNAS..103.3203W. doi : 10.1073/pnas.0511344103 . PMC 1413940. PMID 16492730 .
^ 西原秀雄; 丸山誠; 岡田暢 (2009). 「レトロポゾン解析と最近の地質学的データは、哺乳類の3上目がほぼ同時に分岐したことを示唆している」. Proceedings of the National Academy of Sciences . 106 (13): 5235–40 . Bibcode :2009PNAS..106.5235N. doi : 10.1073/pnas.0809297106 . PMC 2655268. PMID 19286970 .
^ チュラコフ、G.クリーグス、JO;バーチ、R.ゼマン、A.ブロシウス、JR。 JR シュミッツ (2009)。「有胎盤哺乳類におけるモザイクレトロポゾン挿入パターン」。ゲノム研究。19 (5): 868–875。土井:10.1101/gr.090647.108。PMC 2675975。PMID 19261842。
^ Tarver, James E.; dos Reis, Mario; Mirarab, Siavash; Moran, Raymond J.; Parker, Sean; O'Reilly, Joseph E.; King, Benjamin L.; O'Connell, Mary J.; Asher, Robert J.; Warnow, Tandy; Peterson, Kevin J.; Donoghue, Philip CJ; Pisani, Davide (2016年1月8日). 「胎盤哺乳類の相互関係と系統学的推論の限界」. Genome Biology and Evolution . 8 (2): 330– 344. doi :10.1093/gbe/evv261. ISSN 1759-6653. PMC 4779606. PMID 26733575 .

さらに読む

ニコラエフ, セルゲイ; モントーヤ＝ブルゴス, フアン I.; マルグリーズ, エリオット H.; NISC比較シーケンシングプログラム; ルージュモン, ジャック; ニフェラー, ブルーノ; アントナラキス, スティリアノス E. (2007). 「ENCODE多種シーケンスデータによる哺乳類の初期史の解明」. PLoS Genetics . 3 (1): e2. doi : 10.1371/journal.pgen.0030002 . PMC 1761045 . PMID 17206863.
Springer, Mark S.; Murphy, William J.; Eizirik, Eduardo; O'Brien, Stephen J. (2003). 「胎盤哺乳類の多様化と白亜紀-第三紀境界」. Proceedings of the National Academy of Sciences . 100 (3): 1056– 1061. Bibcode :2003PNAS..100.1056S. doi : 10.1073/pnas.0334222100 . PMC 298725. PMID 12552136 .
Waddell, Peter J.; Kishino, Hirohisa; Ota, Rissa (2001). 「比較哺乳類ゲノミクスのための系統学的基盤」. Genome Informatics . 12 : 141–154 . PMID 11791233. 2019年7月10日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2015年8月27日閲覧。
Wildman, Derek E.; Chen, Caoyi; Erez, Offer; Grossman, Lawrence I.; Goodman, Morris; Romero, Roberto (2006). 「系統解析による哺乳類胎盤の進化」. Proceedings of the National Academy of Sciences . 103 (9): 3203– 3208. Bibcode :2006PNAS..103.3203W. doi : 10.1073/pnas.0511344103 . PMC 1413940. PMID 16492730 .

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[Waddell1999c-1] Waddell, Peter J.; Cao, Ying; Hasegawa, Masami; Mindell, David P. (1999). 「ミトコンドリアタンパク質配列全体と拡張統計フレームワークを用いた鳥類および胎盤哺乳類における白亜紀の超序列分岐時期の評価」Systematic Biology . 48 (1): 119– 137. doi : 10.1080/106351599260481 . PMID 12078636.

[2] フィリップス, マシュー・J.; リン, ユーシン; ハリソン, ガブリエル; ペニー, デイビッド (2001). 「バンディクートとフクロギツネのミトコンドリアゲノムは、オーストラリア有袋類の単系統性を裏付ける」.ロンドン王立協会紀要. シリーズB: 生物科学. 268 (1475): 1533– 1538. doi :10.1098/rspb.2001.1677.

[3] Arnason U., Adegoke JA, Gullberg A., Harley EH, Janke A., Kullberg M. (2008.)「胎盤哺乳類のミトゲノミクス関係とその分岐の分子的推定」Gene.; 421(1-2):37–51

[4] Asher RJ (2005.)「食虫類の胎盤哺乳類：形質進化と化石史」KD Rose、JD Archibold共著『胎盤哺乳類の台頭：主要現存クレードの起源と関係』ボルチモアおよびロンドン、ジョンズ・ホプキンス大学出版ISBN 978-0-8018-8022-3

[5] イアン・R・ティザード（2023年）『比較哺乳類免疫学：哺乳類の免疫システムの進化と多様性』アカデミック・プレス、411頁。ISBN 978-0-32395-220-0. 2024年12月16日閲覧。

[6] Waddell, Peter J.; Okada, Norohiro; Hasegawa, Masami (1999). 「胎盤哺乳類の系統関係の解明に向けて」. Systematic Biology . 48 (1): 1– 5. doi : 10.1093/sysbio/48.1.1 . PMID 12078634.

[7] Murphy, WJ; Pringle, TH; Crider, TA; Springer, MS; Miller, W. (2007). 「ゲノムデータを用いた胎盤哺乳類の系統発生の根源の解明」. Genome Research . 17 (4): 413– 421. doi :10.1101/gr.5918807. PMC 1832088. PMID 17322288 .

[8] Wildman, Derek E.; Chen, Caoyi; Erez, Offer; Grossman, Lawrence I.; Goodman, Morris; Romero, Roberto (2006). 「系統解析による哺乳類胎盤の進化」. Proceedings of the National Academy of Sciences . 103 (9): 3203– 3208. Bibcode :2006PNAS..103.3203W. doi : 10.1073/pnas.0511344103 . PMC 1413940. PMID 16492730 .

[9] 西原秀雄; 丸山誠; 岡田暢 (2009). 「レトロポゾン解析と最近の地質学的データは、哺乳類の3上目がほぼ同時に分岐したことを示唆している」. Proceedings of the National Academy of Sciences . 106 (13): 5235–40 . Bibcode :2009PNAS..106.5235N. doi : 10.1073/pnas.0809297106 . PMC 2655268. PMID 19286970 .

[10] チュラコフ、G.クリーグス、JO;バーチ、R.ゼマン、A.ブロシウス、JR。 JR シュミッツ (2009)。「有胎盤哺乳類におけるモザイクレトロポゾン挿入パターン」。ゲノム研究。19 (5): 868–875。土井:10.1101/gr.090647.108。PMC 2675975。PMID 19261842。

[11] Tarver, James E.; dos Reis, Mario; Mirarab, Siavash; Moran, Raymond J.; Parker, Sean; O'Reilly, Joseph E.; King, Benjamin L.; O'Connell, Mary J.; Asher, Robert J.; Warnow, Tandy; Peterson, Kevin J.; Donoghue, Philip CJ; Pisani, Davide (2016年1月8日). 「胎盤哺乳類の相互関係と系統学的推論の限界」. Genome Biology and Evolution . 8 (2): 330– 344. doi :10.1093/gbe/evv261. ISSN 1759-6653. PMC 4779606. PMID 26733575 .