B3GAT2

B3GAT2
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2D0J
識別子
エイリアス	B3GAT2、GLCATS、β-1,3-グルクロン酸転移酵素2
外部ID	オミム：607497; MGI : 2389490;ホモロジーン: 50574;ジーンカード：B3GAT2; OMA :B3GAT2 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 染色体6（ヒト）[1] バンド 6q13 始める 70,856,679 bp [1] 終わり 70,957,060 bp [1]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 染色体1（マウス）[2] バンド 1|1 A5 始める 23,800,834 bp [2] 終わり 23,888,239 bp [2]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 心室帯 嗅内皮質 神経節隆起 口腔粘膜細胞 橋 ブロードマン領域46 中心後回 海馬本体 内皮細胞 脳梁 上位の表現 近位尿細管 右腎臓 心室帯 尿道 人間の腎臓 接合子 海馬歯状回顆粒細胞 一次視覚野 上前頭回 神経管 より多くの参照表現データ バイオGPS 該当なし
遺伝子オントロジー 分子機能 トランスフェラーゼ活性 金属イオン結合 ガラクトシルガラクトシルキシロシルタンパク質3-β-グルクロン酸転移酵素活性 細胞成分 膜の不可欠な構成要素 ゴルジ体 膜 ゴルジ膜 生物学的プロセス グリコサミノグリカン代謝プロセス タンパク質の糖化 コンドロイチン硫酸プロテオグリカン生合成プロセス コンドロイチン硫酸代謝プロセス 炭水化物の代謝プロセス 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 135152 280645 アンサンブル ENSG00000112309 ENSMUSG00000026156 ユニプロット Q9NPZ5 P59270 RefSeq (mRNA) NM_080742 NM_172124 RefSeq（タンパク質） NP_542780 NP_742122 場所（UCSC） 6番目の文字: 70.86 – 70.96 Mb 1章: 23.8 – 23.89 Mb PubMed検索 [3] [4]
ウィキデータ
人間の表示/編集 マウスの表示/編集

ガラクトシルガラクトシルキシロシルプロテイン3-β-グルクロン酸転移酵素2は、ヒトではB3GAT2遺伝子によってコードされる酵素である。^{[5] [6]}

この遺伝子産物はグルクロン酸転移酵素ファミリーに属する膜貫通タンパク質であり、Gal-β-1-4GlcNAcまたはGal-β-1-3GlcNAc残基を含む様々な糖タンパク質または糖脂質において、β-1,3結合型グルクロン酸を末端ガラクトースに転移する反応を触媒する。コードされているタンパク質は、神経系における細胞の移動および接着に関与する硫酸化三糖であるヒトナチュラルキラー1（HNK-1）糖鎖エピトープの合成に関与している。^[6]

神経堤研究におけるHNK-1抗体の利用

HNK-1エピトープに対する抗体は、特に鳥類の胚における神経堤の研究において大きな役割を果たしてきました。 ^[7] このエピトープに対する最初の抗体はNC-1であり、^[8]神経堤の移動経路の解析がはるかに容易になりました。鳥類、特に他の脊椎動物においては、HNK-1エピトープは神経堤に特異的ではないため、染色結果は慎重に解釈する必要があります。

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000112309 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000026156 – Ensembl、2017年5月
3. 「Human PubMed Reference:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. 井宮 健、石崎 剛、清木 剛、斎藤 文、稲澤 淳、岡 誠、川崎 剛 (2002年10月). 「HNK-1炭水化物エピトープの生合成に関与するマウスグルクロン酸転移酵素SのcDNAクローニング、ゲノム構造および染色体マッピング」. Gene . 296 ( 1– 2): 29– 36. doi :10.1016/S0378-1119(02)00840-5. PMID  12383500.
6. "Entrez Gene: B3GAT2 beta-1,3-グルクロニルトランスフェラーゼ 2 (グルクロノシルトランスフェラーゼ S)".
7. Bronner-Fraser M (1986年5月). 「モノクローナル抗体HNK-1を用いた鳥類胚における体幹神経堤移動の初期段階の解析」. Dev. Biol . 115 (1): 44– 55. doi :10.1016/0012-1606(86)90226-5. PMID  3516760.
8. Vincent M, Thiery JP (1984年6月). 「神経堤細胞とプラコダル細胞の細胞表面マーカー：末梢神経系と中枢神経系におけるさらなる進化」. Dev. Biol . 103 (2): 468–81 . doi :10.1016/0012-1606(84)90334-8. PMID  6202575.

外部リンク

• UCSC ゲノム ブラウザのヒト B3GAT2 ゲノムの位置と B3GAT2 遺伝子の詳細ページ。
• PDBe-KBは、ヒトガラクトシルガラクトシルキシロシルタンパク質3-β-グルクロノシルトランスフェラーゼ2（B3GAT2）のPDBに登録されているすべての構造情報の概要を提供します。

さらに読む

• 永瀬 剛志、菊野 亮、小原 修 (2002). 「未同定ヒト遺伝子のコード配列の予測. XXII. 巨大タンパク質をコードする50個の新規cDNAクローンの完全配列」. DNA Res . 8 (6): 319–27 . doi : 10.1093/dnares/8.6.319 . PMID  11853319.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウス完全長cDNA配列の生成と初期解析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC  139241. PMID  12477932 .
• Marcos I, Galán JJ, Borrego S, Antiñolo G (2003). 「ヒトGlcAT-S遺伝子のクローニング、特性解析、および染色体マッピング」J. Hum. Genet . 47 (12): 677–80 . doi : 10.1007/s100380200103 . PMID  12522689.
• Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK, et al. (2003). 「ヒト6番染色体のDNA配列と解析」. Nature . 425 (6960): 805–11 . Bibcode :2003Natur.425..805M. doi : 10.1038/nature02055 . PMID  14574404.
• 太田 剛志、鈴木 雄志、西川 剛志、他 (2004). 「21,243個の完全長ヒトcDNAの完全配列決定と特性解析」Nat. Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID  14702039.
• 角田 聡、岡 誠、川崎 毅 (2004). 「大腸菌におけるHNK-1炭水化物の生合成に関与する2種類の組換えヒトグルクロン酸転移酵素の精製と特性解析」. Protein Expr. Purif . 35 (1): 111–9 . doi :10.1016/j.pep.2003.12.021. PMID  15039073.
• 角田 誠、佐藤 勇、殿山 勇、他 (2005). 「HNK-1糖質の生合成に関与する2つのグルクロン酸転移酵素の異なる受容体特異性」.糖鎖生物学. 15 (2): 203–10 . doi : 10.1093/glycob/cwi001 . PMID  15470230.
• 木村 功、若松 明、鈴木 雄一、他 (2006). 「転写調節の多様化：ヒト遺伝子の推定代替プロモーターの大規模同定と特性解析」Genome Res . 16 (1): 55– 65. doi :10.1101/gr.4039406. PMC 1356129.  PMID 16344560  .
• 柴 剛志、角田 聡、石黒 正治、他 (2006). 「HNK-1糖鎖エピトープの生合成に関与するヒトグルクロン酸転移酵素GlcAT-Sの結晶構造」. Proteins . 65 (2): 499– 508. doi :10.1002/prot.21118. PMID  16897771. S2CID  31290955.