BMCドメイン

BMC
カルボキシソーム殻タンパク質 ccmk2
識別子
シンボル	BMC
ファム	PF00936
インタープロ	IPR000249
プロサイト	PDOC00876
CDD	cd06169
利用可能なタンパク質構造: PDB   IPR000249 PF00936 ( ECOD ; PDBsum )   アルファフォールド IPR000249 PF00936

分子生物学において、細菌マイクロコンパートメント（BMC）ドメインは、チオバチルス・ネアポリタヌス（Halothiobacillus neapolitanus）のCsoS1A、CsoS1B、CsoS1C、および他の細菌由来のそれらの相同タンパク質を含む、様々なシェルタンパク質に見られるタンパク質ドメインです。これらのシェルタンパク質は、細菌において代謝機能を担うカルボキシソームおよび関連構造の多面体構造を形成します。BMCドメインは約90個のアミノ酸残基で構成され、 βヘアピンで連結されたβ-α-βモチーフを特徴とします。

殻タンパク質の大部分は、各サブユニットに単一のBMCドメインで構成され、多面体殻の平らな面を形成するために集まった六量体構造を形成している。^{[ 1 ]}現在までに、2つの殻タンパク質がタンデムBMCドメインで構成され、それが三量体構造を形成し、疑似六量体の外観を与えることが発見されている。^{[ 2 ] [ 3 ]}

参考文献

1. Kerfeld CA, Sawaya MR, Tanaka S, Nguyen CV, Phillips M, Beeby M, Yeates TO (2005年8月). 「原始的細菌細胞小器官の殻を形成するタンパク質構造」. Science . 309 ( 5736): 936–8 . CiteSeerX  10.1.1.1026.896 . doi : 10.1126/science.11 ​​13397. PMID  16081736. S2CID  24561197 .
2. Heldt D, Frank S, Seyedarabi A, Ladikis D, Parsons JB, Warren MJ, Pickersgill RW (2009年9月). 「Clostridium kluyveriにおけるエタノール利用に関連する三量体細菌性マイクロコンパートメントシェルタンパク質EtuBの構造」. The Biochemical Journal . 423 (2): 199– 207. doi : 10.1042/BJ20090780 . hdl : 2262/45409 . PMID 19635047. S2CID 22548122 .  
3. Pang A, Warren MJ, Pickersgill RW (2011年2月). 「4Fe-4Sクラスター結合部位を持つ三量体細菌性マイクロコンパートメントタンパク質PduTの構造」. Acta Crystallographica D . 67 (Pt 2): 91–6 . doi : 10.1107/S0907444910050201 . PMID 21245529 . 

この記事には、パブリックドメインのPfamおよびInterPro : IPR000249からのテキストが含まれています。