| バルトネグタウイルス型 | |
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ウイルスの分類 
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| 非公式グループ： | ウイルス以外の物質 |
| 非公式グループ： | ウイルス型 |
| 家族： | バルトグタビリフォルミダエ科 |
| 属: | バルトネグタウイルス型 |
| 種 | |
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| 同義語 | |
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バルトネグタビリフォルム・アンダーソンイ
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バルトネグタビリフォルム（Bartonegtaviriform）は、バルトグタビリフォルム科に属するウイルス型細菌の属である。この属には、バルトネラ属細菌内に存在する遺伝子導入因子であるバルトネグタビリフォルム・アンダーソン（BaGTA）1。 [1]
名前
科名のBartogtaviriformidaeは、宿主BartonellaのBarto、遺伝子伝達媒介物のgta 、そしてウイルス型であるviriformidaeを組み合わせた造語である。[2]
属名のBartonegtaviriformは、宿主BartonellaのBartone、遺伝子伝達媒介物のgta、そしてウイルス型であることを示すviriformを組み合わせたものである。 [2]
種小名のアンダーソンは、 BaGTA粒子を最初に発見したGTA研究者バート・アンダーソンにちなんで名付けられました。[2]
遺伝子導入剤
GTAは「家畜化された」プロファージの一種と考えることができます。つまり、祖先はバクテリオファージ ゲノムに由来しますが、適応的利益を与えるために宿主によって改変されたものであり、したがって、細菌ゲノムで観察される多くのファージ由来の適応機能の1つを表しています。 [3]
系統発生
ゲノム配列解析により、バルトネラ属細菌はすべてバルトネラ特異的GTA（BaGTA）の存在を特徴とすることが明らかになった。このGTAは、これまで報告されているGTAシステムとは相同性がない。BaGTAは、ランオフ複製起点（ROR）の上流にコードされている。RORはバルトネラゲノムのもう一つの保存された特徴であり、BaGTAの活性との関連が示唆されている。系統解析により、BaGTAはこれらの人獣共通細菌性病原体を特徴付ける適応放散に関連する重要な革新であることが判明した。BaGTAはバルトネラの病原性と直接関連しているわけではないが、VirBタイプIV分泌システム（ T4SS ）やその同族バルトネラエフェクタータンパク質など、バルトネラ群集内の宿主相互作用因子の交換と多様化を促進すると考えられている。BaGTAの維持は、遺伝子交換の可能性を高めるための淘汰によって促進され、感染時の宿主特異的防御システムへの適応を促進すると考えられる。[3]
役割
ゲノミクスに基づく明確な議論は、バルトネラの生物学においてBaGTAが中心的な役割を果たしていることを指摘しているが、その活性を直接示す実験的証拠は乏しく、その活性と制御の根底にある分子メカニズムは依然として不明である。[3]
ゲノム
BaGTA粒子はRcGTAよりも大きく、14kbのDNA断片を含んでいます。この容量は原理的にはBaGTAが14kbのGTAクラスターをパッケージ化して伝達することを可能にすると考えられますが、DNA被覆率の測定ではクラスターの被覆率が低下していることが示されています。隣接する領域で被覆率が高いのは、局所的なDNA複製によるものと考えられます。[4]
参考文献
- ^ 「ウイルス分類：2022年版」国際ウイルス分類委員会（ICTV） 2023年3月。 2023年8月13日閲覧。
- ^ abc 「Proposal 2022.001G.GTA_viriforms Download」.国際ウイルス分類委員会 (ICTV) . 2023年8月18日閲覧。
- ^ abc Québatte M, Christen M, Harms A, Körner J, Christen B, Dehio C (2017年6月). 「遺伝子導入剤は細菌病原体の最も適した集団内での進化を促進する」. Cell Systems . 4 (6): 611–621.e6. doi :10.1016/j.cels.2017.05.011. PMC 5496983. PMID 28624614 .
- ^ Berglund EC, Frank AC, Calteau A, Vinnere Pettersson O, Granberg F, Eriksson AS, Näslund K, Holmberg M, Lindroos H, Andersson SG (2009年7月). 「宿主適応遺伝子のランオフ複製は、マウス感染Bartonella grahamiiのゲノムにおける遺伝子導入因子と関連している」. PLOS Genetics . 5 (7) e1000546. doi : 10.1371/journal.pgen.1000546 . PMC 2697382. PMID 19578403 .
