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ビッグメカニズムは、2014年に開始された4500万ドルのDARPA研究プログラムであり、がん研究論文を読んでがんモデルに統合し、ビッグデータの自動収集と知識ベースのNLP、キュレーションとオントロジー、システムと数理生物学などのさまざまな分野を統合して、研究概要と論文を読んで因果メカニズムの一部を抽出するソフトウェアを2017年末までに開発することを目指しています。[ 1 ]
このプログラムは、ヒト癌の約3分の1の根底にあるRas遺伝子ファミリーの変異に焦点を当てています。現在、細胞複製と細胞死に影響を与えるタンパク質間の相互作用配列の大まかなロードマップが示されていますが、因果関係は十分に解明されていません。[ 1 ]
このプログラムは3つの段階で実行される。第1段階は文献を読み取り、それを形式的な表現に変換すること。第2段階は知識を計算モデルに統合すること。第3段階は実験的に検証可能な説明と予測を生成すること。研究チームは、これら3つのタスクすべてを対象とした4つの独立したシステムを開発している。[ 1 ]
2015年2月、評価会議において第一段階の進捗状況が検討されました。複数のタスクが検討されました。一つは実験手順の詳細を抽出し、「実証する」や「提案する」といった表現を評価することでした。もう一つは、文の意味と関係性をマッピングする作業でした。最も優れた機械読み取りシステムは、小規模なコーパスから関連情報の40%を抽出し、各文章がモデルとどのように関連しているかを正しく判断しました。[ 1 ]
第二段階は2015年夏に開始され、メンバーは単一の参照モデルの作成に取り組む。第三段階は最も困難な段階である。これは、人工知能コミュニティが仮説生成器の開発にあまり成功していないためである。分子生物学は、ほとんどのドメイン知識が技術的であり、文書化されているため、より受け入れやすいかもしれない。 [ 1 ]