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| ビスキット科学 | |
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| 開発者 | ライク・グリュンベルク、ヨハン・レックナー他 |
| 安定版リリース | 3.0.1 [1]
/ 2025年3月18日 (2025年3月18日) |
| リポジトリ |
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| 書かれた | パイソン |
| オペレーティング·システム | UNIX、Linux、Mac OS X |
| タイプ | バイオインフォマティクスツール |
| ライセンス | GPL |
| Webサイト | biskit.pasteur.fr |
Biskitは、構造バイオインフォマティクスと分子モデリングの研究を促進するオープンソースソフトウェアパッケージです。Pythonで記述されており、以下の要素で構成されています。
- 高分子構造、タンパク質複合体、分子動力学軌道を操作および解析するためのオブジェクト指向プログラミング ライブラリ
- 相同性モデリングによるタンパク質構造の自動予測や、柔軟なタンパク質-タンパク質ドッキングによるタンパク質複合体構造の予測など、特定のタスクを解決するためのプログラムセット
このライブラリは、多くの計算をより専門的なサードパーティ製ソフトウェアに委譲しています。現在、X-PLOR、Hex、T-Coffee、DSSP、MODELLERなど15の外部アプリケーションを利用しています。
最新バージョンのBiskit 2.4.0は、2012年3月4日にリリースされました。これは元々パスツール研究所で開発されました。「 Biskit」という名称は、研究グループ名であるUnité de Bio I nformatique S tructuraleに由来しています。
参考文献
- ^ “リリース 3.0.1”. 2025年3月18日. 2025年3月23日閲覧。
外部リンク
- 公式サイト